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公开(公告)号：CN112831576B
公开(公告)日：2023-07-07
申请号：CN202110343708.7
申请日：2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 刘贤 , 柴亚楠 , 李克丽 , 牛梦晓 , 乔小玉 , 郑中华 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛DYNC1I2基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及专用试剂盒，以牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR技术，用两对引物P1、P2分别对牛DYNC1I2基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增，根据2*2‑ΔΔCt确定个体DYNC1I2基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据DYNC1I2基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果，本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于牛生长性状的标记辅助选择，加速良种选育进程。
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公开(公告)号：CN112941203B
公开(公告)日：2023-05-26
申请号：CN202110304073.X
申请日：2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛ITGβ5基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板，通过PCR技术扩增牛ITGβ5基因部分片段，应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果，ITGβ5基因13‑bpInDel多态性位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此，ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择，以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号：CN115873962A
公开(公告)日：2023-03-31
申请号：CN202211628484.5
申请日：2022-12-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用SETX基因单核苷酸遗传标记鉴定虎斑云岭牛品种的方法。本发明利用全基因组关联分析方法，对云岭牛的全基因组SNP进行分析，发现了云岭牛的11号染色体上一个使SETX基因密码子改变的特有突变，为虎斑云岭牛实现品种鉴定提供了依据。同时根据该突变所在SNP位点可以在DNA水平上对云岭牛的虎斑毛色性状进行筛选，从而快速建立遗传资源优良的云岭牛种群。
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公开(公告)号：CN110964790B
公开(公告)日：2023-02-21
申请号：CN201911404426.2
申请日：2019-12-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊PIGY基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以茶卡羊基因组DNA为模板，利用一对特异引物扩增茶卡羊PIGY基因的拷贝数变异区域部分片段，利用另外一对特异引物扩增茶卡羊的ANKRD1基因部分片段作为参照，然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型，根据对拷贝数变异与茶卡羊生长性状的关联分析结果，本发明提供的方法为利用茶卡羊PIGY基因CNV标记建立生长性状的优势种群奠定了基础，有利于加快分子标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号：CN112795668B
公开(公告)日：2022-12-30
申请号：CN202110310647.4
申请日：2021-03-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CFAP43基因插入/缺失标记在性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增山羊CFAP43基因部分片段，经过琼脂糖凝胶电泳后鉴定该基因的6‑bp插入突变位点在山羊群体中的多态性。根据关联分析结果，CFAP43基因的这一插入/缺失多态性位点的基因型与山羊的胸围、管围显著相关，可用于快速建立遗传资源优良的山羊群体，从而可以通过山羊性状的早期标记辅助选择加快育种进程。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110964839B
公开(公告)日：2022-11-08
申请号：CN202010006820.7
申请日：2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种SERPINA3‑1基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其应用。该方法基于实时荧光定量PCR，以黄牛基因组DNA为模板，扩增黄牛SERPINA3‑1基因的拷贝数变异区域及内参基因BTF3基因的部分片段，运用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。基于黄牛SERPINA3‑1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立种质资源优良的黄牛种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN113789395B
公开(公告)日：2022-10-04
申请号：CN202111277432.3
申请日：2021-10-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种利用Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定瘤牛公牛来源的方法。本发明利用基因组重测序结果，对主要瘤牛群体的Y染色体DNA序列进行扫描，发现了东亚瘤牛、非洲瘤牛等瘤牛群体特有的Y染色体SNP位点，根据这些SNP位点可以在DNA水平上准确鉴别瘤牛公牛所属群体，能有效用于不同瘤牛群体的地方品种的引种及分子标记辅助育种，为快速建立遗传资源优良的瘤牛种群奠定基础。
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公开(公告)号：CN110157810B
公开(公告)日：2022-08-19
申请号：CN201910398624.6
申请日：2019-05-14
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与夏南牛生长性状相关的CNV标记的检测方法及其应用：以夏南牛血液基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增夏南牛APOL3基因拷贝数变异区域和内参基因BTF3部分片段，根据2*2‑ΔΔCt将定量结果划分为增加型、减少型、正常型，从而鉴定夏南牛APOL3基因的拷贝数变异类型。本发明所检测的夏南牛APOL3基因的不同拷贝数类型与个体生长性状差异存在显著关联，通过在DNA水平上检测与夏南牛生长性状相关的CNV标记，可用于夏南牛生长性状的标记辅助选择，加快建立优质夏南牛资源群体。
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公开(公告)号：CN110079610B
公开(公告)日：2022-08-19
申请号：CN201910379625.6
申请日：2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊BAG4基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以茶卡羊血样全基因组DNA为模板，扩增茶卡羊BAG4基因的拷贝数变异区域，并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参，利用2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数，通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析，该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状，本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记，可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择，从而快速建立优良的茶卡羊种群，该方法具有简单、快速，便于推广应用的特点。
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公开(公告)号：CN111394474B
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN202010213959.9
申请日：2020-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛GAL3ST1基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以黄牛(例如，秦川牛)基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增黄牛GAL3ST1基因的拷贝数变异区域的部分片段，利用另外一对特异性PCR引物扩增黄牛通用转录因子3基因部分片段作为内参，最后利用2*2‑ΔΔCt的方法对定量结果进行计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在秦川牛GAL3ST1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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