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公开(公告)号:CN117551774B
公开(公告)日:2025-03-21
申请号:CN202311487571.8
申请日:2023-11-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种绵羊MAST4基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以澳洲白绵羊、贵乾半细毛羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增MAST4基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定MAST4基因上29‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。关联分析结果表明,MAST4基因29‑bp插入/缺失多态性位点的不同基因型与澳洲白绵羊、贵乾半细毛羊的产羔数性状差异均显著相关,并存在作为绵羊繁殖性状标记辅助选择的DNA标记,可用于快速建立优良绵羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110468218B
公开(公告)日:2022-09-02
申请号:CN201910878058.9
申请日:2019-09-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的检测方法:以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊IGF2BP1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊IGF2BP1基因15‑bp插入/缺失多态性位点和5‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。所述山羊IGF2BP1基因的15‑bp和5‑bp插入/缺失多态性位点的不同基因型及两个位点的组合基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,可以作为提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110144412B
公开(公告)日:2022-08-19
申请号:CN201910497680.5
申请日:2019-06-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与南阳牛生长相关的CNV标记的检测方法及其应用:所述的CNV标记是指南阳牛SSTR2基因的拷贝数变异,该检测方法是以南阳牛基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增南阳牛SSTR2基因CNV区域和内参基因RPP30部分片段,根据2‑ΔΔCt将定量结果分为增加型、减少型和正常型,从而鉴定南阳牛SSTR2基因的拷贝数变异类型。本发明在DNA水平上检测与南阳牛生长性状密切相关的SSTR2基因的拷贝数变异,以便快速建立遗传资源优良的南阳牛种群。
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公开(公告)号:CN114703293A
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN202210283316.0
申请日:2022-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛CRY1基因的InDel标记在繁殖性状早期选择中的应用。以待测奶牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳,鉴定CRY1基因NC_037332.1:g.70335656‑70335661位InDel位点的基因型。根据CRY1基因InDel位点的不同基因型与卵巢相关性状的关联分析结果,确定了CRY1基因InDel位点的基因型可作为提高奶牛繁殖力的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与繁殖力密切相关的InDel标记,可快速建立奶牛优势遗传资源群体,从而加快奶牛繁殖性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN110172516B
公开(公告)日:2022-05-17
申请号:CN201910218571.5
申请日:2019-03-21
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用,以中国地方黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区序列,再对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和DNA测序;根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区的2个单核苷酸变异;关联分析发现lncFAM200B基因5'侧翼区的这2个单核苷酸位点对生长性状具有重要调控,可作为分子标记。本发明提供的检测方法为建立lncFAM200B基因SNP与生长性状关系提供简单、快速的途径,检测结果可用于生长性状的标记辅助选择,加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN109880890B
公开(公告)日:2022-04-29
申请号:CN201910284640.2
申请日:2019-04-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊HIAT1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊HIAT1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊HIAT1基因NC_030810.1:g.7695‑7696位15‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,山羊HIAT1基因15‑bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的生长性状存在显著相关关系,可作为提高山羊生长性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊HIAT1基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良生长性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112980969A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN107034282B
公开(公告)日:2020-04-07
申请号:CN201710326788.9
申请日:2017-05-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛KCNJ12基因SNP的RFLP方法及其应用,以黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛KCNJ12基因的相应序列,用限制性内切酶PstI消化PCR扩增产物,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定KCNJ12基因单核苷酸多态性。本发明提供的检测方法可用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择,加快地方黄牛品种改良。
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公开(公告)号:CN107130025B
公开(公告)日:2019-11-08
申请号:CN201710327145.6
申请日:2017-05-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种同时检测黄牛FoxO1基因两个插入缺失位点的方法及其应用。该检测方法以待测黄牛全基因组DNA为模板,通过Touch‑down PCR程序同时扩增黄牛FoxO1基因第二内含子区插入缺失位点,根据琼脂糖凝胶电泳结果,同时鉴定黄牛FoxO1基因存在的2个插入缺失位点(Indel3:rs383545622;Indel4:rs525318770)的基因型。本发明提供的检测方法为FoxO1基因的2个Indel位点多态性与中国黄牛生长性状关系的建立奠定了基础,以便FoxO1基因的两个插入缺失突变可用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN110157810A
公开(公告)日:2019-08-23
申请号:CN201910398624.6
申请日:2019-05-14
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与夏南牛生长性状相关的CNV标记的检测方法及其应用:以夏南牛血液基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增夏南牛APOL3基因拷贝数变异区域和内参基因BTF3部分片段,根据2*2-ΔΔCt将定量结果划分为增加型、减少型、正常型,从而鉴定夏南牛APOL3基因的拷贝数变异类型。本发明所检测的夏南牛APOL3基因的不同拷贝数类型与个体生长性状差异存在显著关联,通过在DNA水平上检测与夏南牛生长性状相关的CNV标记,可用于夏南牛生长性状的标记辅助选择,加快建立优质夏南牛资源群体。
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