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公开(公告)号:CN112980969A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN112980969B
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN110904247B
公开(公告)日:2022-05-31
申请号:CN201911385215.9
申请日:2019-12-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法及其应用。该方法是通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳鉴定山羊Sox9基因中的一个InDel位点的多态性,根据对InDel位点与山羊生长性状进行的关联性分析,发现该Sox9基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊胸围之间存在显著相关,提示所述InDel位点的基因型可作为提高山羊胸围的DNA标记,本发明的检测方法可以在山羊生长性状的标记辅助选择育种中应用,快速建立优良的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112980935A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110352715.3
申请日:2021-03-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊PRNT基因单核苷酸多态性标记在性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊PRNT基因部分片段,通过测序鉴定该基因的g.149C>T突变位点在山羊群体中的多态性。根据关联分析结果,PRNT基因的这一单核苷酸多态性位点的基因型与山羊的胸围、胸宽极显著相关,可用于快速建立遗传资源优良的山羊群体,从而可以通过山羊性状的早期标记辅助选择加快育种进程。
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公开(公告)号:CN112695102B
公开(公告)日:2023-01-10
申请号:CN202110179632.9
申请日:2021-02-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了山羊PRNT基因单核苷酸多态性在产羔性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,参照山羊PRNT基因CDS区的单核苷酸多态性位点设计引物,通过对扩增片段测序,鉴定PRNT基因单核苷酸多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,PRNT基因突变位点c.71A>G的不同基因型与山羊个体产羔数显著相关,可以用于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN112795668A
公开(公告)日:2021-05-14
申请号:CN202110310647.4
申请日:2021-03-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CFAP43基因插入/缺失标记在性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊CFAP43基因部分片段,经过琼脂糖凝胶电泳后鉴定该基因的6‑bp插入突变位点在山羊群体中的多态性。根据关联分析结果,CFAP43基因的这一插入/缺失多态性位点的基因型与山羊的胸围、管围显著相关,可用于快速建立遗传资源优良的山羊群体,从而可以通过山羊性状的早期标记辅助选择加快育种进程。
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公开(公告)号:CN109957614A
公开(公告)日:2019-07-02
申请号:CN201910375848.5
申请日:2019-05-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊CMTM2基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊CMTM2基因NC_030825.1:g.35582961_35582974位14‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,山羊CMTM2基因的14‑bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,存在提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊CMTM2基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112980935B
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202110352715.3
申请日:2021-03-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊PRNT基因单核苷酸多态性标记在性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊PRNT基因部分片段,通过测序鉴定该基因的g.149C>T突变位点在山羊群体中的多态性。根据关联分析结果,PRNT基因的这一单核苷酸多态性位点的基因型与山羊的胸围、胸宽极显著相关,可用于快速建立遗传资源优良的山羊群体,从而可以通过山羊性状的早期标记辅助选择加快育种进程。
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公开(公告)号:CN113005201B
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN202110315036.9
申请日:2021-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测山羊FecB基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术,以山羊基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩山羊FecB基因的拷贝数变异区域部分片段,利用另外一对特异引物扩增山羊MC1R基因部分片段作为参照,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型,根据对拷贝数变异与山羊繁殖性状和生长性状的关联分析结果,本发明提供的方法为利用山羊FecB基因CNV标记建立优势性状种群奠定了基础,有利于加快山羊育种进程。
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公开(公告)号:CN109957614B
公开(公告)日:2022-04-26
申请号:CN201910375848.5
申请日:2019-05-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊CMTM2基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊CMTM2基因NC_030825.1:g.35582961_35582974位14‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,山羊CMTM2基因的14‑bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,存在提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊CMTM2基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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