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公开(公告)号:CN116356042B
公开(公告)日:2024-09-06
申请号:CN202310303084.5
申请日:2023-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种利用KASP快速检测牛环状RNA circCPNE8单核苷酸多态性的方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过KASP方法对来源于牛CPNE8基因的circCPNE8SNP位点进行准确分型,关联分析发现该circCPNE8SNP位点的不同基因型与牛肉质性状显著相关,并存在作为提高牛肉质性状早期选择的分子标记。本发明通过快速、精准的检测与牛肉质性状相关的circRNA SNP标记,可快速建立肉牛优势遗传资源群体,从而加快肉牛肉质性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN112695102B
公开(公告)日:2023-01-10
申请号:CN202110179632.9
申请日:2021-02-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了山羊PRNT基因单核苷酸多态性在产羔性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,参照山羊PRNT基因CDS区的单核苷酸多态性位点设计引物,通过对扩增片段测序,鉴定PRNT基因单核苷酸多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,PRNT基因突变位点c.71A>G的不同基因型与山羊个体产羔数显著相关,可以用于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN112980969A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN112941202A
公开(公告)日:2021-06-11
申请号:CN202110304062.1
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛SEPT7基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增牛SEPT7基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体SEPT7基因9‑bp插入突变的基因型。根据性状关联分析结果,SEPT7基因9‑bp插入突变位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,SEPT7基因9‑bp插入突变位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN112980969B
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN112941203A
公开(公告)日:2021-06-11
申请号:CN202110304073.X
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛ITGβ5基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增牛ITGβ5基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,ITGβ5基因13‑bpInDel多态性位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN112795667A
公开(公告)日:2021-05-14
申请号:CN202110302857.9
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种牛FRAS1基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增牛FRAS1基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体FRAS1基因15‑bp缺失突变位点的基因型。根据性状关联分析结果,FRAS1基因15‑bp缺失突变位点的基因型与母牛繁殖性状显著相关。因此,FRAS1基因15‑bp缺失突变位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN112941203B
公开(公告)日:2023-05-26
申请号:CN202110304073.X
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛ITGβ5基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增牛ITGβ5基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,ITGβ5基因13‑bpInDel多态性位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN112941202B
公开(公告)日:2022-06-24
申请号:CN202110304062.1
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛SEPT7基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增牛SEPT7基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体SEPT7基因9‑bp插入突变的基因型。根据性状关联分析结果,SEPT7基因9‑bp插入突变位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,SEPT7基因9‑bp插入突变位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN113005201A
公开(公告)日:2021-06-22
申请号:CN202110315036.9
申请日:2021-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测山羊FecB基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术,以山羊基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩山羊FecB基因的拷贝数变异区域部分片段,利用另外一对特异引物扩增山羊MC1R基因部分片段作为参照,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型,根据对拷贝数变异与山羊繁殖性状和生长性状的关联分析结果,本发明提供的方法为利用山羊FecB基因CNV标记建立优势性状种群奠定了基础,有利于加快山羊育种进程。
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