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公开(公告)号:CN117551774B
公开(公告)日:2025-03-21
申请号:CN202311487571.8
申请日:2023-11-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种绵羊MAST4基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以澳洲白绵羊、贵乾半细毛羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增MAST4基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定MAST4基因上29‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。关联分析结果表明,MAST4基因29‑bp插入/缺失多态性位点的不同基因型与澳洲白绵羊、贵乾半细毛羊的产羔数性状差异均显著相关,并存在作为绵羊繁殖性状标记辅助选择的DNA标记,可用于快速建立优良绵羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112980969A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN102808018A
公开(公告)日:2012-12-05
申请号:CN201210153944.3
申请日:2012-05-17
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊PITX2基因单核苷酸多态性的检测方法,该方法以奶山羊基因组DNA或包含奶山羊PITX2基因的DNA序列为模板,利用PCR引物对P为引物,扩增奶山羊PITX2基因;通过限制性内切酶RsaI对其进行酶切,再根据琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行片段大小分离,利用凝胶成像系统分析其片段大小,从而确定奶山羊PITX2基因第543位的SNP。该SNP位点的TT基因型和TC基因型可作为显著提高奶山羊乳脂含量,而同时又显著降低乳糖含量、乳浓度的有效DNA标记。
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公开(公告)号:CN117568487A
公开(公告)日:2024-02-20
申请号:CN202311540306.1
申请日:2023-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种绵羊MAST4基因插入/缺失标记的繁殖性状早期选择的应用。以澳洲白绵羊全基因组DNA为模板,参照绵羊全基因组设计引物,通过PCR技术扩增绵羊MAST4基因片段,之后应用琼脂糖凝胶电泳鉴定MAST4基因上21‑bp插入/缺失突变在澳洲白绵羊群体中的多态性。关联分析结果表明,所鉴定的MAST4基因21‑bp InDel位点的不同基因型与澳洲白绵羊的产羔数差异显著相关,并存在作为绵羊繁殖性状标记辅助选择的DNA标记,可用于快速建立优良绵羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN116200472A
公开(公告)日:2023-06-02
申请号:CN202310357348.5
申请日:2023-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛SCN9A基因InDel标记在肉质性状早期选择中的应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR及琼脂糖凝胶电泳,准确鉴定SCN9A基因11‑bp缺失突变位点的基因型,关联分析结果揭示SCN9A基因11‑bp缺失突变位点的不同基因型与牛肉质性状显著相关,并存在作为筛选肉牛肉质性状的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与牛肉质性状密切相关的InDel标记,可快速建立牛优势遗传资源群体,从而加快牛肉质性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN112695102B
公开(公告)日:2023-01-10
申请号:CN202110179632.9
申请日:2021-02-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了山羊PRNT基因单核苷酸多态性在产羔性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,参照山羊PRNT基因CDS区的单核苷酸多态性位点设计引物,通过对扩增片段测序,鉴定PRNT基因单核苷酸多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,PRNT基因突变位点c.71A>G的不同基因型与山羊个体产羔数显著相关,可以用于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN116200472B
公开(公告)日:2024-09-03
申请号:CN202310357348.5
申请日:2023-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛SCN9A基因InDel标记在肉质性状早期选择中的应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR及琼脂糖凝胶电泳,准确鉴定SCN9A基因11‑bp缺失突变位点的基因型,关联分析结果揭示SCN9A基因11‑bp缺失突变位点的不同基因型与牛肉质性状显著相关,并存在作为筛选肉牛肉质性状的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与牛肉质性状密切相关的InDel标记,可快速建立牛优势遗传资源群体,从而加快牛肉质性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN117417993A
公开(公告)日:2024-01-19
申请号:CN202311482765.9
申请日:2023-11-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种绵羊E2F8基因插入/缺失标记的繁殖性状早期选择的应用。以澳洲白绵羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增E2F8基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定E2F8基因32‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。关联分析结果表明,所鉴定的E2F8基因的32‑bp插入/缺失多态性位点的不同基因型与澳洲白绵羊的产羔数差异显著相关,并存在提高绵羊产羔数性状的DNA标记,可用于快速建立优良绵羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112980969B
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN112941203A
公开(公告)日:2021-06-11
申请号:CN202110304073.X
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛ITGβ5基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增牛ITGβ5基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,ITGβ5基因13‑bpInDel多态性位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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