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公开(公告)号:CN109182539B
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN201811173459.6
申请日:2018-10-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种黄牛IGF1R基因插入/缺失的检测方法及其应用。以包含IGF1R基因的待测全基因组DNA为模板,以参照牛全基因组设计的引物对P1为引物,通过PCR技术扩增IGF1R基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定IGF1R基因在AC_000178.1:g 8086838‑8086865位点存在不同的基因型。结果发现,IGF1R基因28‑bp插入/缺失的不同类型与晋南牛体斜长、胸围和体重等生长性状之间存在显著相关,提示IGF1R基因28‑bp插入/缺失的不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记。本发明有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110079615B
公开(公告)日:2022-07-19
申请号:CN201910498477.X
申请日:2019-06-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KMT2D基因CNV标记的方法及其应用:所述的CNV标记是指茶卡羊KMT2D基因候选区域Chr3:136830401‑136832800内的拷贝数变异,以茶卡羊基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增茶卡羊KMT2D基因CNV区域和内参基因ANKRD1部分片段,根据2*2‑ΔCt将定量结果分为增加型、减少型和正常型。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊体长性状密切相关的CNV标记,可作为茶卡羊生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号:CN111676273A
公开(公告)日:2020-09-18
申请号:CN202010599560.9
申请日:2020-06-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种检测牛成肌细胞HMGA2基因增强子的方法。根据染色质开放性高通量测序数据分析和序列保守性,并结合双荧光素酶载体报告系统,筛选具备增强子活性的牛HMGA2基因序列片段,根据Hi-C数据分析确定筛选片段中与HMGA2基因启动子产生远距互作的序列,利用CRISPRi系统和实时荧光定量PCR技术验证序列片段功能。本发明从分子和细胞两个水平鉴定出可以促进牛成肌细胞HMGA2基因表达的增强子,可以用于肉牛的基因编辑和转基因育种,从而加快优良肉牛群体选育进程。
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公开(公告)号:CN111560421A
公开(公告)日:2020-08-21
申请号:CN202010550697.5
申请日:2020-06-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种夏南牛HMGA2基因Indel标记的检测方法及应用;以夏南牛的基因组DNA为模板,通过PCR扩增夏南牛HMGA2基因部分片段,并利用琼脂糖凝胶电泳对夏南牛个体HMGA2基因chr5:48094736-48094742的7bp插入缺失突变位点快速分型;该检测方法可以在DNA水平上筛查和检测与夏南牛体高密切相关的分子遗传标记,并应用于夏南牛体高的分子标记辅助选择,从而加快夏南牛品种改良的选育进程。
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公开(公告)号:CN110964790A
公开(公告)日:2020-04-07
申请号:CN201911404426.2
申请日:2019-12-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊PIGY基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增茶卡羊PIGY基因的拷贝数变异区域部分片段,利用另外一对特异引物扩增茶卡羊的ANKRD1基因部分片段作为参照,然后利用2*2-ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型,根据对拷贝数变异与茶卡羊生长性状的关联分析结果,本发明提供的方法为利用茶卡羊PIGY基因CNV标记建立生长性状的优势种群奠定了基础,有利于加快分子标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN103636379B
公开(公告)日:2015-11-25
申请号:CN201310600870.8
申请日:2013-11-19
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: A01G1/00
Abstract: 本发明涉及一种半干旱区荒山灌草立体配置恢复方法,属于灌草种的恢复建造技术领域。该方法针对荒山荒坡植被恢复治理采用“先草后灌、先封后建”的稀疏配置模式,具体实施方式如下:(1)原生植被覆盖度>40%以自然封禁恢复为主;(2)植被覆盖度30~40%以封禁+改良为主,改良(缓坡)宽带窄行灌草稀疏培植;(3)植被覆盖度<30%以封禁+建造为主,建造(陡坡)窄带宽行灌草稀疏培植。该发明方法操作简单,适宜机械或人工作业,投入少,见效快。该配置方法具备快速恢复退化植被,保护地面原生植被,形成新的空间植被格局,控制天然草地植被退化,提高草地生产力和水土保持及改善生态环境的多重功能。
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公开(公告)号:CN110964790B
公开(公告)日:2023-02-21
申请号:CN201911404426.2
申请日:2019-12-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊PIGY基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增茶卡羊PIGY基因的拷贝数变异区域部分片段,利用另外一对特异引物扩增茶卡羊的ANKRD1基因部分片段作为参照,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型,根据对拷贝数变异与茶卡羊生长性状的关联分析结果,本发明提供的方法为利用茶卡羊PIGY基因CNV标记建立生长性状的优势种群奠定了基础,有利于加快分子标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN109988847B
公开(公告)日:2022-07-19
申请号:CN201910308792.1
申请日:2019-04-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊SHE基因的拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKRD1基因片段作为内参,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,本发明提供的检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法为建立茶卡羊SHE基因拷贝数变异与体长性状之间的关联奠定了基础,可用于加快茶卡羊体长性状的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110079615A
公开(公告)日:2019-08-02
申请号:CN201910498477.X
申请日:2019-06-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KMT2D基因CNV标记的方法及其应用:所述的CNV标记是指茶卡羊KMT2D基因候选区域Chr3:136830401-136832800内的拷贝数变异,以茶卡羊基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增茶卡羊KMT2D基因CNV区域和内参基因ANKRD1部分片段,根据2*2-ΔCt将定量结果分为增加型、减少型和正常型。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊体长性状密切相关的CNV标记,可作为茶卡羊生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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