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公开(公告)号：CN116024354B
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202211154046.X
申请日：2022-09-21
Applicant: 西北农林科技大学 , 河南农业大学 , 泌阳县现代农业产业园服务中心
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与黄牛生长性状相关的SNP分子标记、检测引物、试剂盒及育种方法。本发明的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，5’端起第96位碱基为T或G。该SNP位点能够作为黄牛品种遗传改良的分子标记，采用该分子标记对黄牛进行选育，有利于提高黄牛群体的体高性状，可应用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择育种中，有利于性状优良的黄牛种群的遗传改良。本发明提供了检测FGF13基因SNP分子标记的引物、试剂盒，同时提供了基于FGF13基因SNP分子标记的黄牛生长性状改良育种方法，有利于缩短育种时间，加快育种进程。
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公开(公告)号：CN115873962B
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202211628484.5
申请日：2022-12-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用SETX基因单核苷酸遗传标记鉴定虎斑云岭牛品种的方法。本发明利用全基因组关联分析方法，对云岭牛的全基因组SNP进行分析，发现了云岭牛的11号染色体上一个使SETX基因密码子改变的特有突变，为虎斑云岭牛实现品种鉴定提供了依据。同时根据该突变所在SNP位点可以在DNA水平上对云岭牛的虎斑毛色性状进行筛选，从而快速建立遗传资源优良的云岭牛种群。
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公开(公告)号：CN109182539B
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN201811173459.6
申请日：2018-10-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种黄牛IGF1R基因插入/缺失的检测方法及其应用。以包含IGF1R基因的待测全基因组DNA为模板，以参照牛全基因组设计的引物对P1为引物，通过PCR技术扩增IGF1R基因，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定IGF1R基因在AC_000178.1:g 8086838‑8086865位点存在不同的基因型。结果发现，IGF1R基因28‑bp插入/缺失的不同类型与晋南牛体斜长、胸围和体重等生长性状之间存在显著相关，提示IGF1R基因28‑bp插入/缺失的不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记。本发明有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号：CN111647649B
公开(公告)日：2023-08-18
申请号：CN202010612786.8
申请日：2020-06-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种基于CCDC39基因CNV检测辅助选择黄牛生长性状的方法：以黄牛基因组DNA为模板进行实时荧光定量PCR，利用一对特异性引物扩增CCDC39基因的拷贝数变异区域的部分片段，同时利用另外一对特异性引物扩增BTF3基因部分片段作为参考，根据2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。与黄牛生长数据的关联分析显示，所检测的CCDC39基因拷贝数变异对黄牛的体重有显著影响，其中缺失型个体的体重显著高于正常型和多拷贝型个体。本发明提供的方法有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作的进行。
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公开(公告)号：CN111088327B
公开(公告)日：2022-09-13
申请号：CN202010006023.9
申请日：2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种SIKE1基因CNV标记辅助检测黄牛体尺性状的方法及其应用：以黄牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增SIKE1基因CNV区域和内参基因BTF3的部分片段，根据定量结果并通过计算log22‑ΔΔCt鉴定个体SIKE1基因的拷贝数变异类型。基于SIKE1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群，有利于加快云岭牛等的分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110079615B
公开(公告)日：2022-07-19
申请号：CN201910498477.X
申请日：2019-06-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KMT2D基因CNV标记的方法及其应用：所述的CNV标记是指茶卡羊KMT2D基因候选区域Chr3:136830401‑136832800内的拷贝数变异，以茶卡羊基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增茶卡羊KMT2D基因CNV区域和内参基因ANKRD1部分片段，根据2*2‑ΔCt将定量结果分为增加型、减少型和正常型。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊体长性状密切相关的CNV标记，可作为茶卡羊生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号：CN111850140B
公开(公告)日：2022-04-26
申请号：CN202010797583.0
申请日：2020-08-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种山羊PPP3CA基因InDel标记的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳，鉴定山羊PPP3CA基因NC_030813.1:g.16472‑16491位InDel位点的基因型。根据PPP3CA基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊产仔数的关联分析结果，确定了PPP3CA基因InDel位点的基因型可作为提高山羊产仔数的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与山羊产仔数密切相关的InDel标记，可快速建立山羊优势遗传资源群体，从而加快山羊繁殖性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号：CN111850140A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN202010797583.0
申请日：2020-08-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种山羊PPP3CA基因InDel标记的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳，鉴定山羊PPP3CA基因NC_030813.1:g.16472-16491位InDel位点的基因型。根据PPP3CA基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊产仔数的关联分析结果，确定了PPP3CA基因InDel位点的基因型可作为提高山羊产仔数的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与山羊产仔数密切相关的InDel标记，可快速建立山羊优势遗传资源群体，从而加快山羊繁殖性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号：CN107988385B
公开(公告)日：2020-09-29
申请号：CN201711262485.1
申请日：2017-12-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛PLAG1基因Indel标记的方法及其专用试剂盒：基于PCR技术，以肉牛(郏县红牛)的血液基因组DNA池为模板，利用特异引物对P1扩增牛PLAG1基因的Indel位点，然后进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果将不同个体分为缺失型、正常型以及杂合型，本发明提供的方法建立在肉牛PLAG1基因Indel位点与生长性状之间的关联性基础上，方法不仅简单，快速，便于推广应用，而且有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作。
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公开(公告)号：CN111676273A
公开(公告)日：2020-09-18
申请号：CN202010599560.9
申请日：2020-06-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种检测牛成肌细胞HMGA2基因增强子的方法。根据染色质开放性高通量测序数据分析和序列保守性，并结合双荧光素酶载体报告系统，筛选具备增强子活性的牛HMGA2基因序列片段，根据Hi-C数据分析确定筛选片段中与HMGA2基因启动子产生远距互作的序列，利用CRISPRi系统和实时荧光定量PCR技术验证序列片段功能。本发明从分子和细胞两个水平鉴定出可以促进牛成肌细胞HMGA2基因表达的增强子，可以用于肉牛的基因编辑和转基因育种，从而加快优良肉牛群体选育进程。
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