公开(公告)号：CN111088327B

公开(公告)日：2022-09-13

申请号：CN202010006023.9

申请日：2020-01-03

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  刘贤 ,  梁爽爽 ,  蔡雯雯 ,  张子敬 ,  于翔 ,  施巧婷 ,  文逸凡 ,  贺花 ,  茹宝瑞 ,  胡沈荣 ,  雷初朝 ,  陈宏

IPC: C12Q1/6851 ,  C12Q1/6888

Abstract: 本发明公开了一种SIKE1基因CNV标记辅助检测黄牛体尺性状的方法及其应用：以黄牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增SIKE1基因CNV区域和内参基因BTF3的部分片段，根据定量结果并通过计算log22‑ΔΔCt鉴定个体SIKE1基因的拷贝数变异类型。基于SIKE1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群，有利于加快云岭牛等的分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN107988385B

公开(公告)日：2020-09-29

申请号：CN201711262485.1

申请日：2017-12-04

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  徐微 ,  郑立 ,  贺花 ,  张桂民 ,  陈宏 ,  雷初朝 ,  党瑞华 ,  蓝贤勇 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛PLAG1基因Indel标记的方法及其专用试剂盒：基于PCR技术，以肉牛(郏县红牛)的血液基因组DNA池为模板，利用特异引物对P1扩增牛PLAG1基因的Indel位点，然后进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果将不同个体分为缺失型、正常型以及杂合型，本发明提供的方法建立在肉牛PLAG1基因Indel位点与生长性状之间的关联性基础上，方法不仅简单，快速，便于推广应用，而且有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作。

公开(公告)号：CN110964838A

公开(公告)日：2020-04-07

申请号：CN202010006026.2

申请日：2020-01-03

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  文逸凡 ,  蔡雯雯 ,  刘贤 ,  张子敬 ,  于翔 ,  贺花 ,  王献伟 ,  李志明 ,  吕世杰 ,  施巧婷 ,  胡沈荣 ,  陈宏

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种快速检测绵羊LRRFIP1基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以绵羊血样全基因组DNA为模板，利用一对特异引物扩增绵羊LRRFIP1基因的拷贝数变异区域的部分片段，利用另外一对特异性引物扩增绵羊ANKRD1基因部分片段作为对照，然后利用2*2-ΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型，基于绵羊LRRFIP1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立茶卡羊等地方绵羊品种的遗传资源优势种群，有利于加快茶卡羊等的分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN107475400B

公开(公告)日：2020-03-06

申请号：CN201710802522.7

申请日：2017-09-07

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  董艳鹏 ,  郑立 ,  宋海霞 ,  贺花 ,  董冬 ,  宋成创 ,  陈宏 ,  雷初朝 ,  党瑞华 ,  蓝贤勇 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/683

Abstract: 本发明公开了一种MYLK4基因辅助检测牛生长性状的方法及其专用试剂盒。以黄牛基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增获得黄牛MYLK4基因；PCR产物经限制性内切酶HhaI消化后，进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定黄牛MYLK4基因第61595位的单核苷酸多态性。本发明所阐述的方法能够检测黄牛MYLK4基因的单核苷酸多态性，可作为与牛生长性状密切相关分子遗传标记，用于牛的辅助选择和分子育种，加快良种牛繁育速度。

公开(公告)号：CN110760597A

公开(公告)日：2020-02-07

申请号：CN201911159100.8

申请日：2019-11-22

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  姚宇飞 ,  徐嘉威 ,  张子敬 ,  吕世杰 ,  蔡翠翠 ,  贺花 ,  安清明 ,  王大会 ,  王献伟 ,  黄必志 ,  雷初朝 ,  陈宏 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛NCSTN基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以云岭牛基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增牛NCSTN基因的拷贝数变异区域部分片段，同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛BTF3基因部分片段作为内参对照，最后利用-ΔΔCt计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立云岭牛NCSTN基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN107119117B

公开(公告)日：2019-10-29

申请号：CN201710284523.7

申请日：2017-04-25

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  张桂民 ,  宋成创 ,  贺花 ,  陈宏 ,  雷初朝 ,  邓立 ,  蓝贤勇 ,  党瑞华 ,  白跃宇 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/6888

Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以秦川牛的血液全基因组DNA为模板，利用两对特异引物GBP2‑CNV1和GBP2‑CNV2分别扩增牛GBP2基因的两个拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增秦川牛BTF3基因作为对照，然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在秦川牛GBP2基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上，有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN106947826A

公开(公告)日：2017-07-14

申请号：CN201710289845.0

申请日：2017-04-27

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  杨士珍 ,  贺花 ,  刘鲲鹏 ,  邓立 ,  陈宏 ,  雷初朝 ,  蓝贤勇 ,  党瑞华 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法及其应用，以待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P1为引物，PCR扩增黄牛SERPINA3基因部分片段；利用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物片段大小；用限制性内切酶BstXI酶切PCR扩增片段之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SERPINA3基因第648位的单核苷酸多态性位点的基因型；本发明提供的检测方法可用于夏南牛等中国地方黄牛品种肉用生长性状的分子标记辅助选择，进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

公开(公告)号：CN104498610A

公开(公告)日：2015-04-08

申请号：CN201410810292.5

申请日：2014-12-22

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  展召阳 ,  张国兴 ,  周雅婷 ,  黄永震 ,  雷初朝 ,  蓝贤勇 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6858 ,  C12Q1/6888 ,  C12Q2600/124 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2535/138

Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MEF2C基因SNP位点的RFLP方法及试剂盒，该方法是以黄牛基因组DNA或包含MEF2C基因序列的DNA为模板，进行PCR扩增，然后利用限制性内切酶Hind Ш消化PCR扩增产物，再对酶切后片段进行琼脂糖凝胶电泳，鉴定黄牛NEF2C基因单核苷酸多态性。由于MEF2C基因在肌肉发育过程中起着重要的调节作用，与黄牛生长和肉质性状密切相关，而且该SNP与黄牛多种重要经济性状相关，所以，本发明提供的检测方法可用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择，而且该方法操作简单、快速，成本低，检测精确度高，在建立遗传资源优良的黄牛种群方面非常有优势。

公开(公告)号：CN103243155A

公开(公告)日：2013-08-14

申请号：CN201310003906.4

申请日：2013-01-06

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  王璟 ,  曹修凯 ,  潘虹 ,  滑留帅 ,  蓝贤勇 ,  胡沈荣 ,  雷初超

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛CIDEC基因5’调控区多个单核苷酸多态性的方法，以包含CIDEC基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P（P1、P2、P3）为引物，PCR扩增黄牛CIDEC基因；用限制性内切酶HaeIII、AccI、HaeIII分别消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛CIDEC基因第-974位、第-956位、第-501位的单核苷酸多态性，因为完全连锁，第-956位的多态性也代表了第-841,-763,-727和-546位的多态性、第-501位的多态性也代表了第-643位的单核苷酸多态性，这样检测三个位点的多态性就可以得到九个位点的多态信息。本发明提供的检测方法为CIDEC基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择（MAS），快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

公开(公告)号：CN102206706B

公开(公告)日：2013-02-13

申请号：CN201110062694.8

申请日：2011-03-18

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  王辰 ,  王璟 ,  蓝贤勇 ,  张茜茜 ,  赖新生 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法，以包含Dapper1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P(P1、P2、P3、P4)为引物，PCR扩增黄牛Dapper1基因；用限制性内切酶MspI、HindII、NcoI、HhaI分别消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛Dapper1基因第8344位、第8428位、第10513位、第10765位的单核苷酸多态性。本发明提供的检测方法为Dapper1基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。