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公开(公告)号：CN103243156B
公开(公告)日：2016-06-22
申请号：CN201310003907.9
申请日：2013-01-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种验证黄牛CIDEC基因SNPs位点遗传效应的方法，以包含CIDEC基因的黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛CIDEC基因不同单倍型；用限制性内切酶KpnI和XhoI分别消化PCR扩增产物和pGL3-Basic空载体后，再使用DNA连接酶将不同单倍型连接到pGL3-Basic载体上，构建pGL3-Basic-CIDEC-H1、H2、H3、H4、H8、H9表达载体，将构建成功的表达载体转染至3T3-L1细胞中，使用双荧光报告系统试剂盒检测不同单倍型的转录活性。综合不同单倍型的转录活性，以及SNP位点改变顺式作用元件的信息来验证关联分析结果。本发明提供的检测方法为验证CIDEC基因的单核苷酸多态性遗传效应奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择（MAS），快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN102296110A
公开(公告)日：2011-12-28
申请号：CN201110201228.3
申请日：2011-07-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛FGF21基因SNP的RFLP方法，以包含FGF21基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P1、P2、P3为引物，PCR扩增黄牛FGF21基因，发现4个SNP位点；针对这4个SNP位点分别设计引物对F159、F297、F940、F1151，依次人为引入SalI、XhoI、XbaI、MspI酶切位点，进行PCR扩增，用上述四种限制性内切酶分别酶切该PCR扩增产物，再用琼脂糖凝胶电泳检测酶切后的片段，根据电泳结果鉴定黄牛FGF21基因第159位、第297位、第940位、第1151位的单核苷酸多态性。由于FGF21基因功能涉及体重等生长性状，本发明提供的检测方法为FGF21基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN103243156A
公开(公告)日：2013-08-14
申请号：CN201310003907.9
申请日：2013-01-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种验证黄牛CIDEC基因SNPs位点遗传效应的方法，以包含CIDEC基因的黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛CIDEC基因不同单倍型；用限制性内切酶KpnI和XhoI分别消化PCR扩增产物和pGL3-Basic空载体后，再使用DNA连接酶将不同单倍型连接到pGL3-Basic载体上，构建pGL3-Basic-CIDEC-H1、H2、H3、H4、H8、H9表达载体，将构建成功的表达载体转染至3T3-L1细胞中，使用双荧光报告系统试剂盒检测不同单倍型的转录活性。综合不同单倍型的转录活性，以及SNP位点改变顺式作用元件的信息来验证关联分析结果。本发明提供的检测方法为验证CIDEC基因的单核苷酸多态性遗传效应奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择（MAS），快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN103243155A
公开(公告)日：2013-08-14
申请号：CN201310003906.4
申请日：2013-01-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛CIDEC基因5’调控区多个单核苷酸多态性的方法，以包含CIDEC基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P（P1、P2、P3）为引物，PCR扩增黄牛CIDEC基因；用限制性内切酶HaeIII、AccI、HaeIII分别消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛CIDEC基因第-974位、第-956位、第-501位的单核苷酸多态性，因为完全连锁，第-956位的多态性也代表了第-841,-763,-727和-546位的多态性、第-501位的多态性也代表了第-643位的单核苷酸多态性，这样检测三个位点的多态性就可以得到九个位点的多态信息。本发明提供的检测方法为CIDEC基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择（MAS），快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN103243155B
公开(公告)日：2016-08-17
申请号：CN201310003906.4
申请日：2013-01-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛CIDEC基因5’调控区多个单核苷酸多态性的方法，以包含CIDEC基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P（P1、P2、P3）为引物，PCR扩增黄牛CIDEC基因；用限制性内切酶HaeIII、AccI、HaeIII分别消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛CIDEC基因第?974位、第?956位、第?501位的单核苷酸多态性，因为完全连锁，第?956位的多态性也代表了第?841,?763,?727和?546位的多态性、第?501位的多态性也代表了第?643位的单核苷酸多态性，这样检测三个位点的多态性就可以得到九个位点的多态信息。本发明提供的检测方法为CIDEC基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择（MAS），快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN102296110B
公开(公告)日：2016-08-10
申请号：CN201110201228.3
申请日：2011-07-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛FGF21基因SNP的RFLP方法，以包含FGF21基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P1、P2、P3为引物，PCR扩增黄牛FGF21基因，发现4个SNP位点；针对这4个SNP位点分别设计引物对F159、F297、F940、F1151，依次人为引入SalI、XhoI、XbaI、MspI酶切位点，进行PCR扩增，用上述四种限制性内切酶分别酶切该PCR扩增产物，再用琼脂糖凝胶电泳检测酶切后的片段，根据电泳结果鉴定黄牛FGF21基因第159位、第297位、第940位、第1151位的单核苷酸多态性。由于FGF21基因功能涉及体重等生长性状，本发明提供的检测方法为FGF21基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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