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公开(公告)号:CN119753174A
公开(公告)日:2025-04-04
申请号:CN202510184933.9
申请日:2025-02-19
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测与牛热应激适应性相关的分子标记的方法,对北方黄牛和南方黄牛样本经三代测序的方法所得基因组序列进行比对、结构变异检测及生物学功能验证,并对其中位于牛参考基因组上PADI3基因区域2:135317354‑135317410、长度57 bp的缺失突变在牛群体中的携带情况与个体间热应激适应性的差异通过关联分析进行了考察,最终揭示了该结构变异区域能够为牛热应激耐受群体选育和改良提供在DNA水平上实现有效检测的候选分子标记。
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公开(公告)号:CN110592235B
公开(公告)日:2022-08-23
申请号:CN201910945253.9
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测奶牛USP16基因CNV标记的方法及其应用:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用引物对P1、P2扩增牛USP16基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域,最后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110760597B
公开(公告)日:2022-08-23
申请号:CN201911159100.8
申请日:2019-11-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛NCSTN基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以云岭牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛NCSTN基因的拷贝数变异区域部分片段,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛BTF3基因部分片段作为内参对照,最后利用‑ΔΔCt计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立云岭牛NCSTN基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110564829A
公开(公告)日:2019-12-13
申请号:CN201910943149.6
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种奶牛NCAM2基因CNV标记辅助检测泌乳性状的方法及其专用试剂盒:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用两对引物P1、P2对牛NCAM2基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域进行扩增,最后利用2*2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程。该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110564829B
公开(公告)日:2022-11-04
申请号:CN201910943149.6
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种奶牛NCAM2基因CNV标记辅助检测泌乳性状的方法及其专用试剂盒:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用两对引物P1、P2对牛NCAM2基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域进行扩增,最后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程。该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN111321232B
公开(公告)日:2022-08-16
申请号:CN202010192466.1
申请日:2020-03-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测肉牛EIF4A2基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以云岭牛基因组DNA为模板,利用一对引物扩增地方肉牛(例如,云岭牛)EIF4A2基因的拷贝数变异区域部分片段,同时利用另外一对引物扩增牛通用转录因子3基因部分片段作为内参,对定量结果进行计算,判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在肉牛EIF4A2基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上,有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110863009B
公开(公告)日:2021-12-07
申请号:CN201911167804.X
申请日:2019-11-25
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种牛KCNJ12基因真核过表达载体的构建与应用。针对秦川牛KCNJ12基因编码区设计引物,并扩增对应的牛KCNJ12基因;构建pcDNA3.1‑KCNJ12重组过表达载体,并转染细胞。本发明通过克隆牛KCNJ12基因并构建真核过表达载体,可应用于牛KCNJ12基因功能研究、鉴定和调控肌肉生长发育。
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公开(公告)号:CN111321232A
公开(公告)日:2020-06-23
申请号:CN202010192466.1
申请日:2020-03-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测肉牛EIF4A2基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以云岭牛基因组DNA为模板,利用一对引物扩增地方肉牛(例如,云岭牛)EIF4A2基因的拷贝数变异区域部分片段,同时利用另外一对引物扩增牛通用转录因子3基因部分片段作为内参,对定量结果进行计算,判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在肉牛EIF4A2基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上,有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN111647649B
公开(公告)日:2023-08-18
申请号:CN202010612786.8
申请日:2020-06-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种基于CCDC39基因CNV检测辅助选择黄牛生长性状的方法:以黄牛基因组DNA为模板进行实时荧光定量PCR,利用一对特异性引物扩增CCDC39基因的拷贝数变异区域的部分片段,同时利用另外一对特异性引物扩增BTF3基因部分片段作为参考,根据2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。与黄牛生长数据的关联分析显示,所检测的CCDC39基因拷贝数变异对黄牛的体重有显著影响,其中缺失型个体的体重显著高于正常型和多拷贝型个体。本发明提供的方法有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作的进行。
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公开(公告)号:CN110760597A
公开(公告)日:2020-02-07
申请号:CN201911159100.8
申请日:2019-11-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛NCSTN基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以云岭牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛NCSTN基因的拷贝数变异区域部分片段,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛BTF3基因部分片段作为内参对照,最后利用-ΔΔCt计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立云岭牛NCSTN基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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