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公开(公告)号:CN115873962B
公开(公告)日:2024-09-20
申请号:CN202211628484.5
申请日:2022-12-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用SETX基因单核苷酸遗传标记鉴定虎斑云岭牛品种的方法。本发明利用全基因组关联分析方法,对云岭牛的全基因组SNP进行分析,发现了云岭牛的11号染色体上一个使SETX基因密码子改变的特有突变,为虎斑云岭牛实现品种鉴定提供了依据。同时根据该突变所在SNP位点可以在DNA水平上对云岭牛的虎斑毛色性状进行筛选,从而快速建立遗传资源优良的云岭牛种群。
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公开(公告)号:CN118326051A
公开(公告)日:2024-07-12
申请号:CN202410457562.2
申请日:2024-04-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定中原黄牛品种父系来源的方法,利用基因组重测序数据对秦川牛等五个品种黄牛群体的Y染色体进行DNA序列扫描,发现了该黄牛群体特有的Y染色体SNP位点,根据这些SNP位点可以在DNA水平上准确鉴别公牛所属群体,能有效用于引种及辅助育种,为快速建立遗传资源优良的公牛种群奠定基础。
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公开(公告)号:CN114717334A
公开(公告)日:2022-07-08
申请号:CN202210462213.0
申请日:2022-04-28
Applicant: 西北农林科技大学 , 青海省畜牧兽医科学院
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , G16B20/10 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种利用KIT基因拷贝数变异遗传标记鉴定斑点瘤牛品种的方法。依据对斑点毛色性状瘤牛及其他纯色毛色性状牛品种进行全基因组CNV分析所发现的牛6号染色体上一个包含KIT基因的约490Kb的发生重复突变的CNV区段,对斑点瘤牛实现品种鉴定。根据该CNV区段可以在DNA水平上对瘤牛毛色性状进行分子标记辅助选择,从而快速建立遗传资源优良的种群。
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公开(公告)号:CN115820880B
公开(公告)日:2024-09-20
申请号:CN202211627674.5
申请日:2022-12-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种利用KIT基因下游区域拷贝数变异遗传标记鉴定白牦牛品种的方法。依据对纯白毛色性状牦牛及其他非纯白毛色性状牦牛进行全基因组拷贝数变异分析所发现的KIT基因下游的候选基因组区域,对白牦牛实现品种鉴定。本发明通过检测牦牛个体候选基因组区域内发生重复突变的情况,可以在DNA水平上对牦牛毛色性状进行鉴定,从而快速建立遗传资源优良的牦牛种群。
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公开(公告)号:CN118222725A
公开(公告)日:2024-06-21
申请号:CN202410485796.8
申请日:2024-04-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种单核苷酸遗传标记在选育高海拔适应性黄牛中的应用。利用全基因组渗入分析方法,对藏牛的全基因组SNP进行分析,发现藏牛EGLN1基因启动子上的三个单核苷酸变异可能与藏牛高海拔适应性相关,并从中发现了作为高海拔适应性黄牛选育的分子标记,可以用于快速建立高海拔适应性牛群体,为培育适应高原环境的牛品种提供了依据。
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公开(公告)号:CN112359120B
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN202011296046.4
申请日:2020-11-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MFN1基因CNV标记的方法及其应用:以云岭牛的血样基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增MFN1基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段,根据2*log22‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定云岭牛MFN1基因的拷贝数变异类型。与云岭牛生长数据的关联分析显示,MFN1基因不同拷贝数对个体生长发育有显著影响,其中缺失型个体的胸宽低于插入型个体。本发明在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记,可作为生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号:CN113755609A
公开(公告)日:2021-12-07
申请号:CN202111165152.3
申请日:2021-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种利用MC1R基因单核苷酸遗传标记鉴定金丝牦牛品种的方法。本发明利用全基因组关联分析和全基因组选择性清除信号计算两种方法,对金色毛色玉树牦牛的全基因组SNP进行分析,最终鉴定出这些牦牛的20号染色体上一个使MC1R基因密码子提前终止的特有突变,为玉树金牦牛实现品种鉴定提供了依据。同时根据该突变所在SNP位点可以在DNA水平上对玉树牦牛的金色毛色性状进行分子标记辅助选择育种,从而快速建立遗传资源优良的金牦牛种群。
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公开(公告)号:CN119753174A
公开(公告)日:2025-04-04
申请号:CN202510184933.9
申请日:2025-02-19
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测与牛热应激适应性相关的分子标记的方法,对北方黄牛和南方黄牛样本经三代测序的方法所得基因组序列进行比对、结构变异检测及生物学功能验证,并对其中位于牛参考基因组上PADI3基因区域2:135317354‑135317410、长度57 bp的缺失突变在牛群体中的携带情况与个体间热应激适应性的差异通过关联分析进行了考察,最终揭示了该结构变异区域能够为牛热应激耐受群体选育和改良提供在DNA水平上实现有效检测的候选分子标记。
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公开(公告)号:CN115820880A
公开(公告)日:2023-03-21
申请号:CN202211627674.5
申请日:2022-12-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种利用KIT基因下游区域拷贝数变异遗传标记鉴定白牦牛品种的方法。依据对纯白毛色性状牦牛及其他非纯白毛色性状牦牛进行全基因组拷贝数变异分析所发现的KIT基因下游的候选基因组区域,对白牦牛实现品种鉴定。本发明通过检测牦牛个体候选基因组区域内发生重复突变的情况,可以在DNA水平上对牦牛毛色性状进行鉴定,从而快速建立遗传资源优良的牦牛种群。
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公开(公告)号:CN113755609B
公开(公告)日:2022-10-04
申请号:CN202111165152.3
申请日:2021-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种利用MC1R基因单核苷酸遗传标记鉴定金丝牦牛品种的方法。本发明利用全基因组关联分析和全基因组选择性清除信号计算两种方法,对金色毛色玉树牦牛的全基因组SNP进行分析,最终鉴定出这些牦牛的20号染色体上一个使MC1R基因密码子提前终止的特有突变,为玉树金牦牛实现品种鉴定提供了依据。同时根据该突变所在SNP位点可以在DNA水平上对玉树牦牛的金色毛色性状进行分子标记辅助选择育种,从而快速建立遗传资源优良的金牦牛种群。
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