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公开(公告)号:CN108893546A
公开(公告)日:2018-11-27
申请号:CN201810771849.7
申请日:2018-07-13
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛NCAPG基因单核苷酸多态性的方法,以待测肉牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增肉牛NCAPG基因部分片段;用限制性内切酶HinfI消化PCR扩增产物之后,再进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定肉牛NCAPG基因的单核苷酸多态性位点的基因型。本发明提供的检测方法建立在NCAPG基因的SNP与生产性状关系的基础上,可用于肉牛生产性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号:CN107475400A
公开(公告)日:2017-12-15
申请号:CN201710802522.7
申请日:2017-09-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种MYLK4基因辅助检测牛生长性状的方法及其专用试剂盒。以黄牛基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增获得黄牛MYLK4基因;PCR产物经限制性内切酶HhaI消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛MYLK4基因第61595位的单核苷酸多态性。本发明所阐述的方法能够检测黄牛MYLK4基因的单核苷酸多态性,可作为与牛生长性状密切相关分子遗传标记,用于牛的辅助选择和分子育种,加快良种牛繁育速度。
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公开(公告)号:CN107119117A
公开(公告)日:2017-09-01
申请号:CN201710284523.7
申请日:2017-04-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以秦川牛的血液全基因组DNA为模板,利用两对特异引物GBP2‑CNV1和GBP2‑CNV2分别扩增牛GBP2基因的两个拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增秦川牛BTF3基因作为对照,然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在秦川牛GBP2基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110172516B
公开(公告)日:2022-05-17
申请号:CN201910218571.5
申请日:2019-03-21
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用,以中国地方黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区序列,再对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和DNA测序;根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区的2个单核苷酸变异;关联分析发现lncFAM200B基因5'侧翼区的这2个单核苷酸位点对生长性状具有重要调控,可作为分子标记。本发明提供的检测方法为建立lncFAM200B基因SNP与生长性状关系提供简单、快速的途径,检测结果可用于生长性状的标记辅助选择,加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN108841971A
公开(公告)日:2018-11-20
申请号:CN201810771166.1
申请日:2018-07-13
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明提供一种检测黄牛SH3PXD2B基因插入/缺失标记的方法:以待检黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2为引物,分别PCR扩增黄牛个体SH3PXD2B基因部分片段,通过电泳检测PCR扩增产物,根据电泳检测结果分别判定黄牛个体SH3PXD2B基因上两个插入/缺失突变位点的基因型;本发明根据检测到的SH3PXD2B基因indel突变位点NC_007318.6 g.4071212-4071213 ins AGGAGTGGGTACC、g.4088290-4088299 del TGTGGCCACA)的基因型,可应用于黄牛的分子标记辅助选择中,从而加快生长性状优良的地方黄牛种群的建立。
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公开(公告)号:CN106636429A
公开(公告)日:2017-05-10
申请号:CN201710051013.5
申请日:2017-01-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ADNCR基因单核苷酸多态性的四引物扩增受阻突变体系PCR检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板,通过四引物扩增受阻突变体系PCR扩增长链非编码RNA ADNCR基因片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定长链非编码RNA ADNCR基因在g.1263T>A位点存在不同的基因型。结果发现,长链非编码RNA ADNCR基因g.1263T>A的单核苷酸不同类型与秦川牛的坐骨端宽性状之间存在显著相关,提示长链非编码RNA ADNCR基因单核苷酸多态不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记,有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN106947826B
公开(公告)日:2020-06-30
申请号:CN201710289845.0
申请日:2017-04-27
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法及其应用,以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增黄牛SERPINA3基因部分片段;利用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物片段大小;用限制性内切酶BstXI酶切PCR扩增片段之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SERPINA3基因第648位的单核苷酸多态性位点的基因型;本发明提供的检测方法可用于夏南牛等中国地方黄牛品种肉用生长性状的分子标记辅助选择,进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN107619857B
公开(公告)日:2020-06-16
申请号:CN201711003896.9
申请日:2017-10-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用:以肉牛品种郏县牛的血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增其KLF8基因CNV区域和内参基因BTF3,根据2*log2 2‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型,鉴定其KLF8基因的拷贝数变异。与郏县牛生产数据的关联分析显示,KLF8不同拷贝数对郏县牛的生长发育有显著影响,其中缺失型个体的胸宽显著高于插入型和正常型个体。本发明在DNA水平上检测与肉牛生产性状密切相关的CNV,可作为肉牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号:CN107513579B
公开(公告)日:2020-01-10
申请号:CN201710985234.X
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛CRABP2基因单核苷酸多态性的方法及其专用试剂盒。以黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,PCR扩增黄牛CRABP2基因;PCR产物分别经限制性内切酶Apa I和Sal I消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛CRABP2基因第2458位和3878位的单核苷酸多态性。本发明所述的方法能够检测黄牛CRABP2基因的单核苷酸多态性,在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切的相关分子遗传标记,从而用于牛的辅助选择和分子育种,加快本地黄牛良种繁育速度。
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公开(公告)号:CN110172516A
公开(公告)日:2019-08-27
申请号:CN201910218571.5
申请日:2019-03-21
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用,以中国地方黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区序列,再对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和DNA测序;根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区的2个单核苷酸变异;关联分析发现lncFAM200B基因5'侧翼区的这2个单核苷酸位点对生长性状具有重要调控,可作为分子标记。本发明提供的检测方法为建立lncFAM200B基因SNP与生长性状关系提供简单、快速的途径,检测结果可用于生长性状的标记辅助选择,加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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