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公开(公告)号:CN106755422B
公开(公告)日:2020-02-14
申请号:CN201611219653.4
申请日:2016-12-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种与黄牛生长性状相关的MEG3基因SNP的检测方法及其应用,根据黄牛MEG3基因外显子区单核苷酸突变位点所在位置,采用PCR‑RFLP、Tetra‑primer ARMS‑PCR技术对黄牛个体进行分型,分型结果与生长数据关联分析。本发明提供的检测方法是在DNA水平上检测与黄牛生产性状密切相关的SNP标记,可用于中国黄牛品种生长性状标记辅助选择中,加快建立优良黄牛种群。
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公开(公告)号:CN107119117B
公开(公告)日:2019-10-29
申请号:CN201710284523.7
申请日:2017-04-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以秦川牛的血液全基因组DNA为模板,利用两对特异引物GBP2‑CNV1和GBP2‑CNV2分别扩增牛GBP2基因的两个拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增秦川牛BTF3基因作为对照,然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在秦川牛GBP2基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN108893545A
公开(公告)日:2018-11-27
申请号:CN201810736273.0
申请日:2018-07-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛ACTL8基因SNP的RFLP方法,包括以下步骤:该方法是以黄牛全基因组DNA为模板,利用1对PCR引物,在PCR条件下进行扩增,然后利用限制性内切酶消化PCR扩增产物,再对酶切后的产物进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳对其进行片段大小分离,从而确定其SNP。本发明是一种在DNA水平上筛检与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,可用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,该方法操作简单、快速,成本低,而且检测的精确度高,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107557439B
公开(公告)日:2020-04-21
申请号:CN201710986321.7
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以晋南牛的耳组织全基因组DNA为模板,利用一对特异引物IGF1R‑CNV扩增牛IGF1R基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异引物BTF3‑CNV扩增牛BTF3基因片段作为对照,然后利用2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数,本发明提供的方法为建立晋南牛IGF1R基因拷贝数与生长性状之间的关联奠定了基础,通过对拷贝数变异与生长性状进行的关联分析,有利于加快晋南牛分子标记辅助选择育种工作。该方法简单、快速、便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107641657A
公开(公告)日:2018-01-30
申请号:CN201711014547.7
申请日:2017-10-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ACVR1基因插入/缺失的检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,通过PCR技术扩增ACVR1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定ACVR1基因在AC_000159.1:g33007-33023位点存在不同的基因型。结果发现,ACVR1基因16-bp插入/缺失的不同类型与中国黄牛管围和胸围等生长发育性状之间存在显著相关,提示ACVR1基因16-bp插入/缺失可作为提高中国黄牛生长发育性状的DNA标记,有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN107557439A
公开(公告)日:2018-01-09
申请号:CN201710986321.7
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以晋南牛的耳组织全基因组DNA为模板,利用一对特异引物IGF1R-CNV扩增牛IGF1R基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异引物BTF3-CNV扩增牛BTF3基因片段作为对照,然后利用2-ΔCt的方法计算个体的拷贝数,本发明提供的方法为建立晋南牛IGF1R基因拷贝数与生长性状之间的关联奠定了基础,通过对拷贝数变异与生长性状进行的关联分析,有利于加快晋南牛分子标记辅助选择育种工作。该方法简单、快速、便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107641657B
公开(公告)日:2020-05-29
申请号:CN201711014547.7
申请日:2017-10-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ACVR1基因插入/缺失的检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,通过PCR技术扩增ACVR1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定ACVR1基因在AC_000159.1:g33007‑33023位点存在不同的基因型。结果发现,ACVR1基因16‑bp插入/缺失的不同类型与中国黄牛管围和胸围等生长发育性状之间存在显著相关,提示ACVR1基因16‑bp插入/缺失可作为提高中国黄牛生长发育性状的DNA标记,有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN105543352B
公开(公告)日:2020-02-07
申请号:CN201511030627.2
申请日:2015-12-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以秦川牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛FGF13基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛通用转录因子3基因作为对照,最后利用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立秦川牛FGF13基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN106521001B
公开(公告)日:2019-11-08
申请号:CN201611193760.4
申请日:2016-12-21
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种秦川牛microRNA‑320a‑1基因单核苷酸多态性的检测方法及其应用,以待测秦川牛全基因组DNA为模板,以引物对P2为引物,PCR扩增秦川牛microRNA‑320a‑1基因片段;用限制性内切酶PvuII消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定秦川牛microRNA‑320a‑1基因rs518926539:C>T的单核苷酸多态性。本发明提供的检测方法为利用microRNA‑320a‑1基因SNP与生长性状的关系进行秦川牛肉用生长性状的标记辅助选择奠定了基础,有利于快速建立遗传资源优良的秦川牛种群。
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公开(公告)号:CN106521001A
公开(公告)日:2017-03-22
申请号:CN201611193760.4
申请日:2016-12-21
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种秦川牛microRNA-320a-1基因单核苷酸多态性的检测方法及其应用,以待测秦川牛全基因组DNA为模板,以引物对P2为引物,PCR扩增秦川牛microRNA-320a-1基因片段;用限制性内切酶PvuII消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定秦川牛microRNA-320a-1基因rs518926539:C>T的单核苷酸多态性。本发明提供的检测方法为利用microRNA-320a-1基因SNP与生长性状的关系进行秦川牛肉用生长性状的标记辅助选择奠定了基础,有利于快速建立遗传资源优良的秦川牛种群。
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