公开(公告)号：CN109182539B

公开(公告)日：2023-09-22

申请号：CN201811173459.6

申请日：2018-10-09

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  马懿磊 ,  曹修凯 ,  程杰 ,  黄永震 ,  马云 ,  雷初朝

IPC: C12Q1/6888

Abstract: 本发明公开了一种黄牛IGF1R基因插入/缺失的检测方法及其应用。以包含IGF1R基因的待测全基因组DNA为模板，以参照牛全基因组设计的引物对P1为引物，通过PCR技术扩增IGF1R基因，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定IGF1R基因在AC_000178.1:g 8086838‑8086865位点存在不同的基因型。结果发现，IGF1R基因28‑bp插入/缺失的不同类型与晋南牛体斜长、胸围和体重等生长性状之间存在显著相关，提示IGF1R基因28‑bp插入/缺失的不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记。本发明有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。

公开(公告)号：CN109182539A

公开(公告)日：2019-01-11

申请号：CN201811173459.6

申请日：2018-10-09

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  马懿磊 ,  曹修凯 ,  程杰 ,  黄永震 ,  马云 ,  雷初朝

IPC: C12Q1/6888

Abstract: 本发明公开了一种黄牛IGF1R基因插入/缺失的检测方法及其应用。以包含IGF1R基因的待测全基因组DNA为模板，以参照牛全基因组设计的引物对P1为引物，通过PCR技术扩增IGF1R基因，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定IGF1R基因在AC_000178.1:g 8086630-8086657位点存在不同的基因型。结果发现，IGF1R基因28-bp插入/缺失的不同类型与晋南牛体斜长、胸围和体重等生长性状之间存在显著相关，提示IGF1R基因28-bp插入/缺失的不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记。本发明有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。

公开(公告)号：CN107523643B

公开(公告)日：2020-08-04

申请号：CN201710985278.2

申请日：2017-10-20

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  郑立 ,  李继超 ,  马懿磊 ,  王健 ,  宋成创 ,  曹修凯 ,  彭术军 ,  雷初朝 ,  陈宏 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒：基于实时荧光定量PCR技术，以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板，利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照，然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN107557439B

公开(公告)日：2020-04-21

申请号：CN201710986321.7

申请日：2017-10-20

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  马懿磊 ,  蔡含芳 ,  白跃宇 ,  马云 ,  雷初朝 ,  蓝贤勇 ,  黄永震

IPC: C12Q1/6888

Abstract: 本发明公开了一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以晋南牛的耳组织全基因组DNA为模板，利用一对特异引物IGF1R‑CNV扩增牛IGF1R基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异引物BTF3‑CNV扩增牛BTF3基因片段作为对照，然后利用2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数，本发明提供的方法为建立晋南牛IGF1R基因拷贝数与生长性状之间的关联奠定了基础，通过对拷贝数变异与生长性状进行的关联分析，有利于加快晋南牛分子标记辅助选择育种工作。该方法简单、快速、便于推广应用。

公开(公告)号：CN107557439A

公开(公告)日：2018-01-09

申请号：CN201710986321.7

申请日：2017-10-20

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  马懿磊 ,  蔡含芳 ,  白跃宇 ,  马云 ,  雷初朝 ,  蓝贤勇 ,  黄永震

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以晋南牛的耳组织全基因组DNA为模板，利用一对特异引物IGF1R-CNV扩增牛IGF1R基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异引物BTF3-CNV扩增牛BTF3基因片段作为对照，然后利用2-ΔCt的方法计算个体的拷贝数，本发明提供的方法为建立晋南牛IGF1R基因拷贝数与生长性状之间的关联奠定了基础，通过对拷贝数变异与生长性状进行的关联分析，有利于加快晋南牛分子标记辅助选择育种工作。该方法简单、快速、便于推广应用。

公开(公告)号：CN107523643A

公开(公告)日：2017-12-29

申请号：CN201710985278.2

申请日：2017-10-20

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  郑立 ,  李继超 ,  马懿磊 ,  王健 ,  宋成创 ,  曹修凯 ,  彭术军 ,  雷初朝 ,  陈宏 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒：基于实时荧光定量PCR技术，以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板，利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照，然后利用2-ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，方法简单、快速，便于推广应用。