公开(公告)号：CN110157810A

公开(公告)日：2019-08-23

申请号：CN201910398624.6

申请日：2019-05-14

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  彭术军 ,  曹修凯 ,  刘梅 ,  郝丹 ,  祁兴磊 ,  黄永震 ,  雷初朝 ,  蓝贤勇

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种与夏南牛生长性状相关的CNV标记的检测方法及其应用：以夏南牛血液基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增夏南牛APOL3基因拷贝数变异区域和内参基因BTF3部分片段，根据2*2-ΔΔCt将定量结果划分为增加型、减少型、正常型，从而鉴定夏南牛APOL3基因的拷贝数变异类型。本发明所检测的夏南牛APOL3基因的不同拷贝数类型与个体生长性状差异存在显著关联，通过在DNA水平上检测与夏南牛生长性状相关的CNV标记，可用于夏南牛生长性状的标记辅助选择，加快建立优质夏南牛资源群体。

公开(公告)号：CN110157810B

公开(公告)日：2022-08-19

申请号：CN201910398624.6

申请日：2019-05-14

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  彭术军 ,  曹修凯 ,  刘梅 ,  郝丹 ,  祁兴磊 ,  黄永震 ,  雷初朝 ,  蓝贤勇

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种与夏南牛生长性状相关的CNV标记的检测方法及其应用：以夏南牛血液基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增夏南牛APOL3基因拷贝数变异区域和内参基因BTF3部分片段，根据2*2‑ΔΔCt将定量结果划分为增加型、减少型、正常型，从而鉴定夏南牛APOL3基因的拷贝数变异类型。本发明所检测的夏南牛APOL3基因的不同拷贝数类型与个体生长性状差异存在显著关联，通过在DNA水平上检测与夏南牛生长性状相关的CNV标记，可用于夏南牛生长性状的标记辅助选择，加快建立优质夏南牛资源群体。

公开(公告)号：CN107523643B

公开(公告)日：2020-08-04

申请号：CN201710985278.2

申请日：2017-10-20

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  郑立 ,  李继超 ,  马懿磊 ,  王健 ,  宋成创 ,  曹修凯 ,  彭术军 ,  雷初朝 ,  陈宏 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒：基于实时荧光定量PCR技术，以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板，利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照，然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN107523643A

公开(公告)日：2017-12-29

申请号：CN201710985278.2

申请日：2017-10-20

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  郑立 ,  李继超 ,  马懿磊 ,  王健 ,  宋成创 ,  曹修凯 ,  彭术军 ,  雷初朝 ,  陈宏 ,  胡沈荣

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒：基于实时荧光定量PCR技术，以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板，利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照，然后利用2-ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，方法简单、快速，便于推广应用。