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公开(公告)号：CN111647649B
公开(公告)日：2023-08-18
申请号：CN202010612786.8
申请日：2020-06-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种基于CCDC39基因CNV检测辅助选择黄牛生长性状的方法：以黄牛基因组DNA为模板进行实时荧光定量PCR，利用一对特异性引物扩增CCDC39基因的拷贝数变异区域的部分片段，同时利用另外一对特异性引物扩增BTF3基因部分片段作为参考，根据2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。与黄牛生长数据的关联分析显示，所检测的CCDC39基因拷贝数变异对黄牛的体重有显著影响，其中缺失型个体的体重显著高于正常型和多拷贝型个体。本发明提供的方法有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作的进行。
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公开(公告)号：CN112813175B
公开(公告)日：2023-07-07
申请号：CN202110342428.4
申请日：2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 柴亚楠 , 刘贤 , 李克丽 , 杜雪儿 , 郑中华 , 乔小玉 , 郎利敏 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛CHRDL1基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及其应用：以牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR技术，用两对引物P1、P2分别对牛CHRDL1基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增，根据2*2‑ΔΔCt确定个体CHRDL1基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据CHRDL1基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果，本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于牛生长性状的标记辅助选择，加速良种选育进程。
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公开(公告)号：CN113481303B
公开(公告)日：2023-05-26
申请号：CN202110892448.9
申请日：2021-08-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ACTR3基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增ACTR3基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参，最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于ACTR3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立黄牛遗传资源优势种群，有利于加快牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN110564829B
公开(公告)日：2022-11-04
申请号：CN201910943149.6
申请日：2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种奶牛NCAM2基因CNV标记辅助检测泌乳性状的方法及其专用试剂盒：利用实时定量PCR技术，以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板，分别用两对引物P1、P2对牛NCAM2基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域进行扩增，最后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型，并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记，可加快奶牛优良产乳性能的选育进程。该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN109943647A
公开(公告)日：2019-06-28
申请号：CN201910354837.9
申请日：2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛MLLT10基因CNV标记的方法及其应用，基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛基因组DNA为模板，利用特异性PCR引物扩增黄牛MLLT10基因拷贝数变异区，并扩增黄牛BTF3基因部分片段作为内参，最后利用2-ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立黄牛MLLT10基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，检测方法简单、快速，可用于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，便于推广应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109943646A
公开(公告)日：2019-06-28
申请号：CN201910354830.7
申请日：2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛PLAG1基因CNV分子标记辅助检测生长性状的方法及其应用：以黄牛基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增PLAG1基因拷贝数变异区域和内参基因BTF3的部分片段，根据2-ΔΔCt方法将定量结果分为多拷贝型和正常型，从而鉴定黄牛个体PLAG1基因的拷贝数变异类型。本发明在DNA水平上检测与黄牛生长性状密切相关的拷贝数变异，该拷贝数变异可作为中国黄牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，用于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作。
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公开(公告)号：CN112831576B
公开(公告)日：2023-07-07
申请号：CN202110343708.7
申请日：2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 刘贤 , 柴亚楠 , 李克丽 , 牛梦晓 , 乔小玉 , 郑中华 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛DYNC1I2基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及专用试剂盒，以牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR技术，用两对引物P1、P2分别对牛DYNC1I2基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增，根据2*2‑ΔΔCt确定个体DYNC1I2基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据DYNC1I2基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果，本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于牛生长性状的标记辅助选择，加速良种选育进程。
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公开(公告)号：CN110964839B
公开(公告)日：2022-11-08
申请号：CN202010006820.7
申请日：2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种SERPINA3‑1基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其应用。该方法基于实时荧光定量PCR，以黄牛基因组DNA为模板，扩增黄牛SERPINA3‑1基因的拷贝数变异区域及内参基因BTF3基因的部分片段，运用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。基于黄牛SERPINA3‑1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立种质资源优良的黄牛种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN113151501A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110513334.9
申请日：2021-05-11
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 张家强 , 刘贤 , 张子敬 , 柴亚楠 , 李欣淼 , 杜蕾 , 李利娟 , 杨国杰 , 李志明 , 吕世杰 , 陈付英 , 施巧婷 , 王二耀 , 胡沈荣 , 茹宝瑞 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛WBP1L基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增WBP1L基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参，最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于WBP1L基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立遗传资源优势种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN111647649A
公开(公告)日：2020-09-11
申请号：CN202010612786.8
申请日：2020-06-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种基于CCDC39基因CNV检测辅助选择黄牛生长性状的方法：以黄牛基因组DNA为模板进行实时荧光定量PCR，利用一对特异性引物扩增CCDC39基因的拷贝数变异区域的部分片段，同时利用另外一对特异性引物扩增BTF3基因部分片段作为参考，根据2*2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。与黄牛生长数据的关联分析显示，所检测的CCDC39基因拷贝数变异对黄牛的体重有显著影响，其中缺失型个体的体重显著高于正常型和多拷贝型个体。本发明提供的方法有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作的进行。
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