准确鉴别插入突变纯、杂合线虫的三引物组及PCR鉴别方法

    公开(公告)号:CN109576381A

    公开(公告)日:2019-04-05

    申请号:CN201910089793.1

    申请日:2019-01-18

    CPC classification number: C12Q1/6888 C12Q1/686 C12Q2565/125

    Abstract: 本发明提供了准确鉴别插入突变纯、杂合型线虫的三引物组及PCR鉴别方法,属于基因编辑技术领域,更具体地涉及一种准确鉴别插入突变纯、杂合型线虫的三引物组及PCR鉴别方法,通过设计上游引物WT-S、下游引物WT-A和第三引物I-S,并将该三引物组用于插入突变纯、杂合型线虫的PCR鉴定中,对野生型、插入突变型DNA模板,进行竞争性PCR,很好地解决了二引物组PCR导致的假阴性结果和易丢失插入突变的问题,更准确地鉴别出野生型、插入突变杂合型及插入突变纯合型线虫。类推,也可以通过设计上游引物WT-S、下游引物WT-A和第三引物I-A,组成三引物组对插入突变纯、杂合型线虫进行鉴定。此鉴别方法可以广泛用于其他物种中插入型突变体的鉴定。

    用于亲权鉴定的SSR位点的筛选方法和应用

    公开(公告)号:CN109207606A

    公开(公告)日:2019-01-15

    申请号:CN201811125248.5

    申请日:2018-09-26

    CPC classification number: C12Q1/6888 C12Q2600/156

    Abstract: 本发明提供了一种用于亲权鉴定的SSR位点的筛选方法和应用,涉及生物技术领域。该筛选方法首先从待筛选SSR位点的物种的全基因组序列中找出所有的潜在SSR位点,然后经过依次的筛选和过滤筛选出候选的SSR位点;然后使用模拟筛选的方法,依据待筛选SSR位点的物种的遗传特征,构建模拟亲代并杂交产生子代,以验证能够用于亲权鉴定的SSR位点的特征;然后将候选SSR位点按照PE值排序,然后筛选出符合如下条件的SSR位点:(b1)MAF值≤M;(b2)缺失值比例<10%;(b3)任意两个SSR位点的距离>LD衰减距离;(b4)重复单元≥N;满足上述条件的SSR位点可用于亲权鉴定。

    同时分析牛基因组DNA16个基因座的荧光检测试剂盒

    公开(公告)号:CN109136384A

    公开(公告)日:2019-01-04

    申请号:CN201710615931.6

    申请日:2017-07-26

    Inventor: 李翔 葛斌文 陈拓

    CPC classification number: C12Q1/6888 C12Q2600/156

    Abstract: 本发明公开了一种可以同时分析16个牛基因座的荧光标记复合扩增检测试剂盒,其特征在于:包含16个基因座TGLA227、BM2113、TGLA53、ETH10、SPS115、TGLA126、TGLA122、INRA023、CSSM66、ETH3、ETH225、BM1824、BM1818、BAmel、G18833和BM720,分为4组,共涉及5种颜色的荧光标记。本发明的荧光标记复合扩增检测试剂盒提供用于复合扩增16个基因座的寡核苷酸引物混合物;系统中包括的用于鉴别DNA样本性别的基因座是BAmel基因座。该系统的检测结果表明其多态性高、平衡性好、灵敏度高、特异性强、分型结果准确、种属特异性强,完全能够满足牛类个体识别、亲权鉴定以及DNA数据库建设的需要。

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