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公开(公告)号:CN111676273A
公开(公告)日:2020-09-18
申请号:CN202010599560.9
申请日:2020-06-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种检测牛成肌细胞HMGA2基因增强子的方法。根据染色质开放性高通量测序数据分析和序列保守性,并结合双荧光素酶载体报告系统,筛选具备增强子活性的牛HMGA2基因序列片段,根据Hi-C数据分析确定筛选片段中与HMGA2基因启动子产生远距互作的序列,利用CRISPRi系统和实时荧光定量PCR技术验证序列片段功能。本发明从分子和细胞两个水平鉴定出可以促进牛成肌细胞HMGA2基因表达的增强子,可以用于肉牛的基因编辑和转基因育种,从而加快优良肉牛群体选育进程。
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公开(公告)号:CN111560421A
公开(公告)日:2020-08-21
申请号:CN202010550697.5
申请日:2020-06-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种夏南牛HMGA2基因Indel标记的检测方法及应用;以夏南牛的基因组DNA为模板,通过PCR扩增夏南牛HMGA2基因部分片段,并利用琼脂糖凝胶电泳对夏南牛个体HMGA2基因chr5:48094736-48094742的7bp插入缺失突变位点快速分型;该检测方法可以在DNA水平上筛查和检测与夏南牛体高密切相关的分子遗传标记,并应用于夏南牛体高的分子标记辅助选择,从而加快夏南牛品种改良的选育进程。
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公开(公告)号:CN111676273B
公开(公告)日:2023-08-11
申请号:CN202010599560.9
申请日:2020-06-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种检测牛成肌细胞HMGA2基因增强子的方法。根据染色质开放性高通量测序数据分析和序列保守性,并结合双荧光素酶载体报告系统,筛选具备增强子活性的牛HMGA2基因序列片段,根据Hi‑C数据分析确定筛选片段中与HMGA2基因启动子产生远距互作的序列,利用CRISPRi系统和实时荧光定量PCR技术验证序列片段功能。本发明从分子和细胞两个水平鉴定出可以促进牛成肌细胞HMGA2基因表达的增强子,可以用于肉牛的基因编辑和转基因育种,从而加快优良肉牛群体选育进程。
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公开(公告)号:CN110093425B
公开(公告)日:2022-08-19
申请号:CN201910355325.4
申请日:2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以小尾寒羊耳组织全基因组DNA为模板,扩增小尾寒羊ORMDL1基因的拷贝数变异区域,并以扩增小尾寒羊ANKRD1基因片段作为内参,然后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,本发明提供的检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法为建立小尾寒羊ORMDL1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,以用于加快小尾寒羊品种改良的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110093425A
公开(公告)日:2019-08-06
申请号:CN201910355325.4
申请日:2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以小尾寒羊耳组织全基因组DNA为模板,扩增小尾寒羊ORMDL1基因的拷贝数变异区域,并以扩增小尾寒羊ANKRD1基因片段作为内参,然后利用2*2-ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,本发明提供的检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法为建立小尾寒羊ORMDL1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,以用于加快小尾寒羊品种改良的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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