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公开(公告)号:CN109355359B
公开(公告)日:2022-04-01
申请号:CN201811377400.9
申请日:2018-11-19
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊MYLK4基因CNV标记的检测方法及其应用。该方法基于实时荧光定量PCR,以山羊基因组DNA为模板,扩增山羊MYLK4基因的拷贝数变异区域,接着运用‑ΔΔCt计算并根据结果判定个体的拷贝数变异类型。本发明利用个体的CNV类型与生长性状进行关联分析。本发明所提供的检测方法为MYLK4基因拷贝数变异与山羊生长性状关系的建立奠定了理论基础,该方法简单快捷,便于推广使用,有利于加快建立种质资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN109161601B
公开(公告)日:2021-08-17
申请号:CN201811184564.X
申请日:2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种PLAGL1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用。以黄牛基因组DNA为模板,通过PCR扩增获得黄牛PLAGL1基因部分片段;将PCR产物经限制性内切酶Nde1消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛PLAGL1基因第95141位的SNP。本发明所检测的黄牛PLAGL1基因的SNP位点的基因型,可作为与牛生长性状密切相关的分子遗传标记,用于黄牛的分子标记辅助选择,推动良种牛繁育进程。
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公开(公告)号:CN109055578B
公开(公告)日:2021-08-17
申请号:CN201811185702.6
申请日:2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种PLAG1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用:以待测黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛PLAG1基因的部分片段;对扩增片段酶切后进行琼脂糖凝胶电泳,实现对黄牛PLAG1基因第48308位为C>T的碱基多态性位点的检测;关联分析确定TC和CC基因型与黄牛生长性状密切相关,可作为分子遗传标记用于黄牛分子标记辅助选择育种中,从而加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN113151501A
公开(公告)日:2021-07-23
申请号:CN202110513334.9
申请日:2021-05-11
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor: 黄永震 , 张家强 , 刘贤 , 张子敬 , 柴亚楠 , 李欣淼 , 杜蕾 , 李利娟 , 杨国杰 , 李志明 , 吕世杰 , 陈付英 , 施巧婷 , 王二耀 , 胡沈荣 , 茹宝瑞 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛WBP1L基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛个体基因组DNA为模板,以一对特异性引物扩增WBP1L基因拷贝数变异区域的部分片段,以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参,最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于WBP1L基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,可用于快速建立遗传资源优势种群,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107523643B
公开(公告)日:2020-08-04
申请号:CN201710985278.2
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒:基于实时荧光定量PCR技术,以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板,利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照,然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN111088327A
公开(公告)日:2020-05-01
申请号:CN202010006023.9
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种SIKE1基因CNV标记辅助检测黄牛体尺性状的方法及其应用:以黄牛血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增SIKE1基因CNV区域和内参基因BTF3的部分片段,根据定量结果并通过计算log22-ΔΔCt鉴定个体SIKE1基因的拷贝数变异类型。基于SIKE1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群,有利于加快云岭牛等的分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110592235A
公开(公告)日:2019-12-20
申请号:CN201910945253.9
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测奶牛USP16基因CNV标记的方法及其应用:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用引物对P1、P2扩增牛USP16基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域,最后利用2*2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN109161601A
公开(公告)日:2019-01-08
申请号:CN201811184564.X
申请日:2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种PLAGL1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用。以黄牛基因组DNA为模板,通过PCR扩增获得黄牛PLAGL1基因部分片段;将PCR产物经限制性内切酶Nde1消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛PLAGL1基因第95141位的SNP。本发明所检测的黄牛PLAGL1基因的SNP位点的基因型,可作为与牛生长性状密切相关的分子遗传标记,用于黄牛的分子标记辅助选择,推动良种牛繁育进程。
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公开(公告)号:CN109055578A
公开(公告)日:2018-12-21
申请号:CN201811185702.6
申请日:2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172 , C12Q2531/113 , C12Q2521/301
Abstract: 本发明公开了一种PLAG1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用:以待测黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛PLAG1基因的部分片段;对扩增片段酶切后进行琼脂糖凝胶电泳,实现对黄牛PLAG1基因第48308位为C>T的碱基多态性位点的检测;关联分析确定TC和CC基因型与黄牛生长性状密切相关,可作为分子遗传标记用于黄牛分子标记辅助选择育种中,从而加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN107641657A
公开(公告)日:2018-01-30
申请号:CN201711014547.7
申请日:2017-10-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ACVR1基因插入/缺失的检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,通过PCR技术扩增ACVR1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定ACVR1基因在AC_000159.1:g33007-33023位点存在不同的基因型。结果发现,ACVR1基因16-bp插入/缺失的不同类型与中国黄牛管围和胸围等生长发育性状之间存在显著相关,提示ACVR1基因16-bp插入/缺失可作为提高中国黄牛生长发育性状的DNA标记,有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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