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公开(公告)号：CN115873962B
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202211628484.5
申请日：2022-12-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用SETX基因单核苷酸遗传标记鉴定虎斑云岭牛品种的方法。本发明利用全基因组关联分析方法，对云岭牛的全基因组SNP进行分析，发现了云岭牛的11号染色体上一个使SETX基因密码子改变的特有突变，为虎斑云岭牛实现品种鉴定提供了依据。同时根据该突变所在SNP位点可以在DNA水平上对云岭牛的虎斑毛色性状进行筛选，从而快速建立遗传资源优良的云岭牛种群。
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公开(公告)号：CN109182539B
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN201811173459.6
申请日：2018-10-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种黄牛IGF1R基因插入/缺失的检测方法及其应用。以包含IGF1R基因的待测全基因组DNA为模板，以参照牛全基因组设计的引物对P1为引物，通过PCR技术扩增IGF1R基因，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定IGF1R基因在AC_000178.1:g 8086838‑8086865位点存在不同的基因型。结果发现，IGF1R基因28‑bp插入/缺失的不同类型与晋南牛体斜长、胸围和体重等生长性状之间存在显著相关，提示IGF1R基因28‑bp插入/缺失的不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记。本发明有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号：CN111647649B
公开(公告)日：2023-08-18
申请号：CN202010612786.8
申请日：2020-06-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种基于CCDC39基因CNV检测辅助选择黄牛生长性状的方法：以黄牛基因组DNA为模板进行实时荧光定量PCR，利用一对特异性引物扩增CCDC39基因的拷贝数变异区域的部分片段，同时利用另外一对特异性引物扩增BTF3基因部分片段作为参考，根据2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。与黄牛生长数据的关联分析显示，所检测的CCDC39基因拷贝数变异对黄牛的体重有显著影响，其中缺失型个体的体重显著高于正常型和多拷贝型个体。本发明提供的方法有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作的进行。
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公开(公告)号：CN116200472A
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310357348.5
申请日：2023-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛SCN9A基因InDel标记在肉质性状早期选择中的应用。以牛全基因组DNA为模板，通过PCR及琼脂糖凝胶电泳，准确鉴定SCN9A基因11‑bp缺失突变位点的基因型，关联分析结果揭示SCN9A基因11‑bp缺失突变位点的不同基因型与牛肉质性状显著相关，并存在作为筛选肉牛肉质性状的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与牛肉质性状密切相关的InDel标记，可快速建立牛优势遗传资源群体，从而加快牛肉质性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号：CN111088327B
公开(公告)日：2022-09-13
申请号：CN202010006023.9
申请日：2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种SIKE1基因CNV标记辅助检测黄牛体尺性状的方法及其应用：以黄牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增SIKE1基因CNV区域和内参基因BTF3的部分片段，根据定量结果并通过计算log22‑ΔΔCt鉴定个体SIKE1基因的拷贝数变异类型。基于SIKE1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群，有利于加快云岭牛等的分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110607373B
公开(公告)日：2022-09-02
申请号：CN201910877427.2
申请日：2019-09-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊DNAH1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增山羊DNAH1基因部分片段，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定山羊DNAH1基因NC_030829.1:g.48594103_48594129位27‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现，该山羊DNAH1基因的27‑bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系，存在提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊DNAH1基因插入/缺失多态性的方法，可应用于山羊分子标记辅助选择育种中，加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号：CN110079615B
公开(公告)日：2022-07-19
申请号：CN201910498477.X
申请日：2019-06-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KMT2D基因CNV标记的方法及其应用：所述的CNV标记是指茶卡羊KMT2D基因候选区域Chr3:136830401‑136832800内的拷贝数变异，以茶卡羊基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增茶卡羊KMT2D基因CNV区域和内参基因ANKRD1部分片段，根据2*2‑ΔCt将定量结果分为增加型、减少型和正常型。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊体长性状密切相关的CNV标记，可作为茶卡羊生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号：CN111850140B
公开(公告)日：2022-04-26
申请号：CN202010797583.0
申请日：2020-08-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种山羊PPP3CA基因InDel标记的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳，鉴定山羊PPP3CA基因NC_030813.1:g.16472‑16491位InDel位点的基因型。根据PPP3CA基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊产仔数的关联分析结果，确定了PPP3CA基因InDel位点的基因型可作为提高山羊产仔数的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与山羊产仔数密切相关的InDel标记，可快速建立山羊优势遗传资源群体，从而加快山羊繁殖性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号：CN112795668A
公开(公告)日：2021-05-14
申请号：CN202110310647.4
申请日：2021-03-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CFAP43基因插入/缺失标记在性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增山羊CFAP43基因部分片段，经过琼脂糖凝胶电泳后鉴定该基因的6‑bp插入突变位点在山羊群体中的多态性。根据关联分析结果，CFAP43基因的这一插入/缺失多态性位点的基因型与山羊的胸围、管围显著相关，可用于快速建立遗传资源优良的山羊群体，从而可以通过山羊性状的早期标记辅助选择加快育种进程。
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公开(公告)号：CN111850140A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN202010797583.0
申请日：2020-08-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种山羊PPP3CA基因InDel标记的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳，鉴定山羊PPP3CA基因NC_030813.1:g.16472-16491位InDel位点的基因型。根据PPP3CA基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊产仔数的关联分析结果，确定了PPP3CA基因InDel位点的基因型可作为提高山羊产仔数的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与山羊产仔数密切相关的InDel标记，可快速建立山羊优势遗传资源群体，从而加快山羊繁殖性状的标记辅助选择育种进程。
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