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公开(公告)号:CN112980935A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110352715.3
申请日:2021-03-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊PRNT基因单核苷酸多态性标记在性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊PRNT基因部分片段,通过测序鉴定该基因的g.149C>T突变位点在山羊群体中的多态性。根据关联分析结果,PRNT基因的这一单核苷酸多态性位点的基因型与山羊的胸围、胸宽极显著相关,可用于快速建立遗传资源优良的山羊群体,从而可以通过山羊性状的早期标记辅助选择加快育种进程。
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公开(公告)号:CN112941203A
公开(公告)日:2021-06-11
申请号:CN202110304073.X
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛ITGβ5基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增牛ITGβ5基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,ITGβ5基因13‑bpInDel多态性位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN112795667A
公开(公告)日:2021-05-14
申请号:CN202110302857.9
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种牛FRAS1基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增牛FRAS1基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体FRAS1基因15‑bp缺失突变位点的基因型。根据性状关联分析结果,FRAS1基因15‑bp缺失突变位点的基因型与母牛繁殖性状显著相关。因此,FRAS1基因15‑bp缺失突变位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN106947826B
公开(公告)日:2020-06-30
申请号:CN201710289845.0
申请日:2017-04-27
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法及其应用,以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增黄牛SERPINA3基因部分片段;利用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物片段大小;用限制性内切酶BstXI酶切PCR扩增片段之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SERPINA3基因第648位的单核苷酸多态性位点的基因型;本发明提供的检测方法可用于夏南牛等中国地方黄牛品种肉用生长性状的分子标记辅助选择,进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN107619857B
公开(公告)日:2020-06-16
申请号:CN201711003896.9
申请日:2017-10-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用:以肉牛品种郏县牛的血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增其KLF8基因CNV区域和内参基因BTF3,根据2*log2 2‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型,鉴定其KLF8基因的拷贝数变异。与郏县牛生产数据的关联分析显示,KLF8不同拷贝数对郏县牛的生长发育有显著影响,其中缺失型个体的胸宽显著高于插入型和正常型个体。本发明在DNA水平上检测与肉牛生产性状密切相关的CNV,可作为肉牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号:CN107641657B
公开(公告)日:2020-05-29
申请号:CN201711014547.7
申请日:2017-10-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ACVR1基因插入/缺失的检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,通过PCR技术扩增ACVR1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定ACVR1基因在AC_000159.1:g33007‑33023位点存在不同的基因型。结果发现,ACVR1基因16‑bp插入/缺失的不同类型与中国黄牛管围和胸围等生长发育性状之间存在显著相关,提示ACVR1基因16‑bp插入/缺失可作为提高中国黄牛生长发育性状的DNA标记,有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN107164482B
公开(公告)日:2020-02-18
申请号:CN201710414058.4
申请日:2017-06-05
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊CSN1S1基因插入/缺失的检测方法及其应用。该方法是以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增山羊CSN1S1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊CSN1S1基因存在indel位点多态性。大样本(N>1000)相关分析结果揭示,CSN1S1基因indel的不同类型与陕北白绒山羊第一胎产羔性状之间存在显著相关,提示CSN1S1基因indel的不同类型可作为提高山羊第一胎产羔性状的DNA标记。本发明提供的快速检测山羊CSN1S1基因indel的方法,可在中国山羊繁殖性状的标记辅助选择育种中应用,有利于快速建立高产羔数性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN105543352B
公开(公告)日:2020-02-07
申请号:CN201511030627.2
申请日:2015-12-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以秦川牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛FGF13基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛通用转录因子3基因作为对照,最后利用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立秦川牛FGF13基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107513579B
公开(公告)日:2020-01-10
申请号:CN201710985234.X
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛CRABP2基因单核苷酸多态性的方法及其专用试剂盒。以黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,PCR扩增黄牛CRABP2基因;PCR产物分别经限制性内切酶Apa I和Sal I消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛CRABP2基因第2458位和3878位的单核苷酸多态性。本发明所述的方法能够检测黄牛CRABP2基因的单核苷酸多态性,在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切的相关分子遗传标记,从而用于牛的辅助选择和分子育种,加快本地黄牛良种繁育速度。
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公开(公告)号:CN110607373A
公开(公告)日:2019-12-24
申请号:CN201910877427.2
申请日:2019-09-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊DNAH1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊DNAH1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊DNAH1基因NC_030829.1:g.48594103_48594129位27-bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,该山羊DNAH1基因的27-bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,存在提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊DNAH1基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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