公开(公告)号：US07745180B2

公开(公告)日：2010-06-29

申请号：US10796298

申请日：2004-03-09

申请人： Masato Mitsuhashi

发明人： Masato Mitsuhashi

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  C07H21/00

CPC分类号： C12N15/1006 ,  C12N1/066 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6846 ,  C12Q2565/537 ,  C12Q2521/107 ,  C12Q2527/137 ,  C12Q2527/125

摘要： Disclosed are a method, device kit, and automated system for simple, reproducible, and high-throughput quantification of mRNA from whole blood. More particularly, the method, device, kit and automated system involve combinations of leukocyte filters attached to oligo(dT)-immobilized multi-well plates.

摘要翻译： 公开了一种用于从全血中简单，可重复和高通量定量mRNA的方法，装置试剂盒和自动化系统。 更具体地，方法，装置，试剂盒和自动化系统涉及附着于寡聚（dT）活化的多孔板的白细胞过滤器的组合。

公开(公告)号：US07736854B2

公开(公告)日：2010-06-15

申请号：US11606518

申请日：2006-11-29

申请人： Joseph A. Sorge

发明人： Joseph A. Sorge

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6823 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2521/307 ,  C12Q2525/161 ,  C12Q2525/301 ,  C12Q2561/109 ,  C12Q2565/519 ,  C12Q2561/101 ,  C12Q2521/107

摘要： The present invention is directed to methods of generating a signal indicative of the presence of a target nucleic acid in a sample by forming a cleavage structure comprising duplex and single-stranded nucleic acid by incubating a sample comprising a target nucleic acid with a thermostable nucleic acid polymerase substantially lacking 5′ to 3′ exonuclease activity and cleaving said cleavage structure with a thermostable Fen nuclease lacking 5′ to 3′ synthetic activity to generate a signal.

摘要翻译： 本发明涉及通过形成包含双链体和单链核酸的切割结构，通过将包含靶核酸的样品与热稳定性核酸一起孵育来产生指示样品中目标核酸存在的信号的方法 聚合酶基本上缺乏5'至3'核酸外切酶活性，并用缺乏5'至3'合成活性的热稳定的Fen核酸酶切割所述切割结构以产生信号。

公开(公告)号：US20100047784A1

公开(公告)日：2010-02-25

申请号：US12308954

申请日：2007-06-29

申请人： Gilad Shlomit ,  Esther Meiri ,  Noga Yerushalmi

发明人： Gilad Shlomit ,  Esther Meiri ,  Noga Yerushalmi

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6876 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6832 ,  C12Q1/6853 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/136 ,  C12Q2600/178 ,  C12Q2545/101 ,  C12Q2563/149 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2565/626 ,  C12Q2521/107 ,  C12Q2525/207 ,  C12Q2525/301 ,  C12Q2561/101 ,  C12Q2525/161

摘要： Described herein are methods and compositions for detecting, amplifying and labeling targeted nucleic acids, including microRNAs.

摘要翻译： 本文描述了用于检测，扩增和标记靶向核酸（包括微小RNA）的方法和组合物。

公开(公告)号：US07657379B2

公开(公告)日：2010-02-02

申请号：US10332305

申请日：2001-07-02

申请人： Roland Stoughton ,  Timothy R. Hughes

发明人： Roland Stoughton ,  Timothy R. Hughes

IPC分类号： G06F19/00 ,  C12Q1/68 ,  C12N15/09 ,  G06G7/58

CPC分类号： G06F19/18 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6837 ,  C40B30/04 ,  G01N33/5005 ,  G01N2500/00 ,  G06F19/20 ,  G06F19/24 ,  C12Q2545/114 ,  C12Q2521/107 ,  C12Q2539/113

摘要： The invention relates to methods and systems (e.g., computer systems and computer program products) for determining the biological function of uncharacterized cellular constituents, particularly genes and gene products, by using “response profiles,” i.e., measurements of pluralities of cellular constituents in cells having a modified gene or gene product, as phenotypic markers for the gene or gene product. Methods are provided for clustering such response profiles so that similar or correlated response profiles are organized into the same cluster. The invention also provides databases or “compendiums” of response profiles to which the response profile of an uncharacterized gene or gene product can be compared. In one embodiment, steps of the methods comprise comparing the measured response profiles to response profiles stored in the databases or compendiums, and determining the biological function of the response profiles in the databases that are most similar to the measured response profiles.

摘要翻译： 本发明涉及通过使用“响应曲线”来确定未表征的细胞成分，特别是基因和基因产物的生物学功能的方法和系统（例如，计算机系统和计算机程序产品），即细胞中多种细胞成分的测量 具有修饰的基因或基因产物，作为基因或基因产物的表型标记。 提供了用于聚类这种响应简档的方法，使得相似或相关的响应简档被组织到相同的集群中。 本发明还提供可以比较非特异性基因或基因产物的反应谱的响应谱的数据库或“汇编”。 在一个实施例中，方法的步骤包括将测量的响应简档与存储在数据库或汇编中的响应简档进行比较，以及确定与测量的响应简档最相似的数据库中的响应简档的生物学功能。

公开(公告)号：US20090325235A1

公开(公告)日：2009-12-31

申请号：US12145734

申请日：2008-06-25

申请人： Baek KIM

发明人： Baek KIM

IPC分类号： C12P19/34

CPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N9/1276 ,  C12Q2521/107

摘要： Methods and kits performing reverse transcription and RT-PCR reactions having high fidelity, processivity and DNA polymerase activity are described. The methods involve performance of reverse transcription at an increased temperature with a reverse transcriptase from Simian Immunodeficiency Virus-agm.sab or a variation thereof. The kits of the present invention include a reverse transcriptase from Simian Immunodeficiency Virus-agm.sab or a variation thereof, a DNA polymerase capable of amplifying cDNA under conditions suitable for polymerase chain reaction, and the reagents necessary to carry out both processes.

摘要翻译： 描述了具有高保真度，持续性和DNA聚合酶活性的进行逆转录和RT-PCR反应的方法和试剂盒。 该方法涉及在来自Simian Immunodeficiency Virus-agm.sab的逆转录酶或其变体的情况下在升高的温度下进行逆转录。 本发明的试剂盒包括来自Simian Immunodeficiency Virus-agm.sab的逆转录酶或其变体，能够在适合于聚合酶链式反应的条件下扩增cDNA的DNA聚合酶以及进行两种方法所必需的试剂。

公开(公告)号：US20090291852A1

公开(公告)日：2009-11-26

申请号：US11884084

申请日：2006-02-10

申请人： Mitinori Saitou ,  Kazuki Kurimoto ,  Yukihiro Yabuta ,  Yasuhide Ohinata

发明人： Mitinori Saitou ,  Kazuki Kurimoto ,  Yukihiro Yabuta ,  Yasuhide Ohinata

IPC分类号： C12P19/34 ,  C07H21/04 ,  C40B30/00 ,  C40B50/06

CPC分类号： C12Q1/686 ,  C12Q2521/107 ,  C12Q2525/155

摘要： A method for amplification of a nucleotide sequence characterized by performing PCR amplification using mRNA isolated from a biological sample as a template and using a first primer comprising a poly(T) sequence and an additional nucleotide sequence X thereto and a second primer comprising a poly(T) sequence and an additional nucleotide sequence Y thereto, provided that the nucleotide sequences X and Y in the first and second primers, respectively, have different sequences from each other.

摘要翻译： 一种用于扩增核苷酸序列的方法，其特征在于使用从生物样品分离的mRNA作为模板进行PCR扩增，并使用包含poly（T）序列和另外的核苷酸序列X的第一引物和包含聚（ T）序列和另外的核苷酸序列Y，条件是第一和第二引物中的核苷酸序列X和Y分别具有彼此不同的序列。

公开(公告)号：US20090220969A1

公开(公告)日：2009-09-03

申请号：US12231525

申请日：2008-09-03

申请人： Vincent Chiang ,  Rui Shi

发明人： Vincent Chiang ,  Rui Shi

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  C12N9/12

CPC分类号： C12Q1/6853 ,  C12Q2525/173 ,  C12Q2521/119 ,  C12Q2521/107

摘要： One-step RT-PCR methods, compositions and kits for the detection and quantification of small RNAs in a sample are disclosed. The one-step RT-PCR approach involves polyadenylation of a small RNA followed by reverse transcription with a first primer containing a poly(T) sequence and at least two 3′ nucleotides complementary to the 3′ terminal end nucleotides of the small RNA, to produce a cDNA. This may be followed by PCR amplification using the same first primer as the revere primer and a second, forward primer in which a portion of its sequence is complementary to the 3′ terminal end of the cDNA. This may be then followed by detection and/or quantification of the amplified product.

摘要翻译： 公开了用于检测和定量样品中的小RNA的一步RT-PCR方法，组合物和试剂盒。 一步RT-PCR方法涉及小RNA的多聚腺苷酸化，然后用含有poly（T）序列的第一引物和与小RNA的3'末端核苷酸互补的至少两个3'核苷酸进行逆转录， 产生cDNA。 然后可以使用与反向引物相同的第一引物进行PCR扩增，第二引物其序列的一部分与cDNA的3'末端互补。 然后可以检测和/或定量扩增产物。

公开(公告)号：US20090004655A1

公开(公告)日：2009-01-01

申请号：US11960093

申请日：2007-12-19

申请人： Dominique J. Brees ,  James K. Loy

发明人： Dominique J. Brees ,  James K. Loy

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/68 ,  C12Q2521/107

摘要： The present invention relates to methods for evaluating the cell damaging potential of an agent by determining the ability of the agent to increase messenger RNA release in cells.

摘要翻译： 本发明涉及通过测定试剂增加细胞中信使RNA释放的能力来评估试剂的细胞损伤潜能的方法。

公开(公告)号：US07468251B2

公开(公告)日：2008-12-23

申请号：US11442618

申请日：2006-05-25

申请人： Joseph A. Sorge

发明人： Joseph A. Sorge

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6823 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2521/307 ,  C12Q2525/161 ,  C12Q2525/301 ,  C12Q2561/109 ,  C12Q2565/519 ,  C12Q2561/101 ,  C12Q2521/107

摘要： The invention relates to compositions for generating a signal indicative of the presence of a target nucleic acid in a sample, where the compositions include an RNA polymerase, a FEN nuclease, and a probe.

摘要翻译： 本发明涉及用于产生指示样品中目标核酸存在的信号的组合物，其中组合物包括RNA聚合酶，FEN核酸酶和探针。

公开(公告)号：US20080131890A1

公开(公告)日：2008-06-05

申请号：US11809567

申请日：2007-06-01

申请人： Hatim T. Allawi ,  Victor Lyamichev

发明人： Hatim T. Allawi ,  Victor Lyamichev

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6816 ,  C07H21/02 ,  C12Q1/68 ,  C12Q2525/161 ,  C12Q2521/107 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention relates to compositions and methods for the detection and characterization of small nucleic acid molecules (e.g., RNA (e.g., small RNAs such as micro RNAs (miRNAs) and small interfering RNAs (siRNAs)) and other short nucleic acid molecules). More particularly, the present invention relates to methods for the detection and quantification of RNA expression. The present invention further provides for the detection of miRNA and siRNA variants.

摘要翻译： 本发明涉及用于检测和表征小核酸分子（例如RNA（例如，小RNA如微RNA（miRNA）和小干扰RNA（siRNA））和其它短核酸分子的组合物和方法。 更具体地说，本发明涉及检测和定量RNA表达的方法。 本发明进一步提供了miRNA和siRNA变体的检测。