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公开(公告)号：CN109182539A
公开(公告)日：2019-01-11
申请号：CN201811173459.6
申请日：2018-10-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种黄牛IGF1R基因插入/缺失的检测方法及其应用。以包含IGF1R基因的待测全基因组DNA为模板，以参照牛全基因组设计的引物对P1为引物，通过PCR技术扩增IGF1R基因，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定IGF1R基因在AC_000178.1:g 8086630-8086657位点存在不同的基因型。结果发现，IGF1R基因28-bp插入/缺失的不同类型与晋南牛体斜长、胸围和体重等生长性状之间存在显著相关，提示IGF1R基因28-bp插入/缺失的不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记。本发明有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号：CN108841971A
公开(公告)日：2018-11-20
申请号：CN201810771166.1
申请日：2018-07-13
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明提供一种检测黄牛SH3PXD2B基因插入/缺失标记的方法：以待检黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P1、P2为引物，分别PCR扩增黄牛个体SH3PXD2B基因部分片段，通过电泳检测PCR扩增产物，根据电泳检测结果分别判定黄牛个体SH3PXD2B基因上两个插入/缺失突变位点的基因型；本发明根据检测到的SH3PXD2B基因indel突变位点NC_007318.6 g.4071212-4071213 ins AGGAGTGGGTACC、g.4088290-4088299 del TGTGGCCACA)的基因型，可应用于黄牛的分子标记辅助选择中，从而加快生长性状优良的地方黄牛种群的建立。
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公开(公告)号：CN107400720A
公开(公告)日：2017-11-28
申请号：CN201710808013.5
申请日：2017-09-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种KLF3基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其专用试剂盒。基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛基因组DNA为模板，扩增黄牛KLF3基因的拷贝数变异区域，并扩增牛通用转录因子BTF3基因作为内参，最后利用2-ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立牛KLF3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单，快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN107130025A
公开(公告)日：2017-09-05
申请号：CN201710327145.6
申请日：2017-05-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种同时检测黄牛FoxO1基因两个插入缺失位点的方法及其应用。该检测方法以待测黄牛全基因组DNA为模板，通过Touch‑down PCR程序同时扩增黄牛FoxO1基因第二内含子区插入缺失位点，根据琼脂糖凝胶电泳结果，同时鉴定黄牛FoxO1基因存在的2个插入缺失位点(Indel3：rs383545622；Indel4：rs525318770)的基因型。本发明提供的检测方法为FoxO1基因的2个Indel位点多态性与中国黄牛生长性状关系的建立奠定了基础，以便FoxO1基因的两个插入缺失突变可用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN106755422A
公开(公告)日：2017-05-31
申请号：CN201611219653.4
申请日：2016-12-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种与黄牛生长性状相关的MEG3基因SNP的检测方法及其应用，根据黄牛MEG3基因外显子区单核苷酸突变位点所在位置，采用PCR‑RFLP、Tetra‑primer ARMS‑PCR技术对黄牛个体进行分型，分型结果与生长数据关联分析。本发明提供的检测方法是在DNA水平上检测与黄牛生产性状密切相关的SNP标记，可用于中国黄牛品种生长性状标记辅助选择中，加快建立优良黄牛种群。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106636429A
公开(公告)日：2017-05-10
申请号：CN201710051013.5
申请日：2017-01-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ADNCR基因单核苷酸多态性的四引物扩增受阻突变体系PCR检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板，通过四引物扩增受阻突变体系PCR扩增长链非编码RNA ADNCR基因片段，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定长链非编码RNA ADNCR基因在g.1263T>A位点存在不同的基因型。结果发现，长链非编码RNA ADNCR基因g.1263T>A的单核苷酸不同类型与秦川牛的坐骨端宽性状之间存在显著相关，提示长链非编码RNA ADNCR基因单核苷酸多态不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记，有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号：CN105506111A
公开(公告)日：2016-04-20
申请号：CN201511030253.4
申请日：2015-12-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测南阳牛MAPK10基因CNV标记的方法及其应用：以南阳牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增南阳牛MAPK10基因CNV区域和内参基因BTF3，根据log22-ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，鉴定南阳牛MAPK10基因的拷贝数变异。与南阳牛生产数据的关联分析显示，MAPK10不同拷贝数对南阳牛的生长发育有显著影响，其中正常型个体的初生重、18月龄体高和24月龄体重和日增重均显著高于插入型和缺失型个体。本发明在DNA水平上检测与南阳牛生产性状密切相关的CNV标记，可作为中国南阳牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。
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公开(公告)号：CN101875977A
公开(公告)日：2010-11-03
申请号：CN201010235173.3
申请日：2010-07-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SREBP1c基因单核苷酸多态性的方法，以包含SREBP1c基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛SREBP1c基因；用限制性内切酶Bgl I消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SREBP1c基因第10914位的单核苷酸多态性。由于SREBP1c基因功能涉及体重、日增重、体斜长和胸围4个重要的生长性状，本发明提供的检测方法为SREBP1c基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN111676273B
公开(公告)日：2023-08-11
申请号：CN202010599560.9
申请日：2020-06-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种检测牛成肌细胞HMGA2基因增强子的方法。根据染色质开放性高通量测序数据分析和序列保守性，并结合双荧光素酶载体报告系统，筛选具备增强子活性的牛HMGA2基因序列片段，根据Hi‑C数据分析确定筛选片段中与HMGA2基因启动子产生远距互作的序列，利用CRISPRi系统和实时荧光定量PCR技术验证序列片段功能。本发明从分子和细胞两个水平鉴定出可以促进牛成肌细胞HMGA2基因表达的增强子，可以用于肉牛的基因编辑和转基因育种，从而加快优良肉牛群体选育进程。
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公开(公告)号：CN113151501B
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202110513334.9
申请日：2021-05-11
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 张家强 , 刘贤 , 张子敬 , 柴亚楠 , 李欣淼 , 杜蕾 , 李利娟 , 杨国杰 , 李志明 , 吕世杰 , 陈付英 , 施巧婷 , 王二耀 , 胡沈荣 , 茹宝瑞 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛WBP1L基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增WBP1L基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参，最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于WBP1L基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立遗传资源优势种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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