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公开(公告)号:CN110468218A
公开(公告)日:2019-11-19
申请号:CN201910878058.9
申请日:2019-09-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的检测方法:以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊IGF2BP1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊IGF2BP1基因15-bp插入/缺失多态性位点和5-bp插入/缺失多态性位点的基因型。所述山羊IGF2BP1基因的15-bp和5-bp插入/缺失多态性位点的不同基因型及两个位点的组合基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,可以作为提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN107119117B
公开(公告)日:2019-10-29
申请号:CN201710284523.7
申请日:2017-04-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以秦川牛的血液全基因组DNA为模板,利用两对特异引物GBP2‑CNV1和GBP2‑CNV2分别扩增牛GBP2基因的两个拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增秦川牛BTF3基因作为对照,然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在秦川牛GBP2基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN109957614A
公开(公告)日:2019-07-02
申请号:CN201910375848.5
申请日:2019-05-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊CMTM2基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊CMTM2基因NC_030825.1:g.35582961_35582974位14‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,山羊CMTM2基因的14‑bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,存在提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊CMTM2基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN108893545A
公开(公告)日:2018-11-27
申请号:CN201810736273.0
申请日:2018-07-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛ACTL8基因SNP的RFLP方法,包括以下步骤:该方法是以黄牛全基因组DNA为模板,利用1对PCR引物,在PCR条件下进行扩增,然后利用限制性内切酶消化PCR扩增产物,再对酶切后的产物进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳对其进行片段大小分离,从而确定其SNP。本发明是一种在DNA水平上筛检与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,可用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,该方法操作简单、快速,成本低,而且检测的精确度高,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN106947826A
公开(公告)日:2017-07-14
申请号:CN201710289845.0
申请日:2017-04-27
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法及其应用,以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增黄牛SERPINA3基因部分片段;利用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物片段大小;用限制性内切酶BstXI酶切PCR扩增片段之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SERPINA3基因第648位的单核苷酸多态性位点的基因型;本发明提供的检测方法可用于夏南牛等中国地方黄牛品种肉用生长性状的分子标记辅助选择,进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN103789406B
公开(公告)日:2016-08-17
申请号:CN201310465936.7
申请日:2013-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛Pax3基因单核苷酸多态性的PCR?RFLP方法。首先,根据DNA池测序结果,检测到的基因多态性包括:在黄牛的Pax3基因序列转录起始位点?580位T或G的单核苷酸多态性;在Taq DNA聚合酶、Buffer(缓冲环境)、Mg++、dNTPs存在的情况下,PCR扩增黄牛Pax3基因,分别用HinfI和HaeIII限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳分型。本发明提供的检测方法为Pax3基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择,从而快速高效、精确地培育中国优质、特色的肉牛新品系。
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公开(公告)号:CN103290113B
公开(公告)日:2016-05-04
申请号:CN201310169313.5
申请日:2013-05-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛SIRT1基因启动子区SNP的RFLP方法,以黄牛血液全基因组DNA为模板,以引物对P(F、R)为引物,PCR扩增黄牛SIRT1基因启动子区,用限制性内切酶SmaI消化PCR扩增产物,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SIRT1启动子区单核苷酸多态性。由于SIRT1涉及到的肌肉分化、脂肪生成等重要功能与黄牛肉质性状密切相关,该SNP又能显著影响SIRT1基因的启动子活性,并且与黄牛多种重要经济性状相关,本发明提供的检测方法为SIRT1基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,可用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择,以便于快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN103866032B
公开(公告)日:2016-03-23
申请号:CN201410130751.5
申请日:2014-03-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测山羊STAT3基因单核苷酸多态性的方法及应用,以包含STAT3基因的待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2或P3为引物,PCR扩增山羊STAT3基因;用限制性内切酶DdeI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊STAT3基因第45204位、第62058位或第62230位的单核苷酸多态性。3个位点能够作为提高西农萨能奶山羊体高的分子标记,1个位点作为提高海南黑山羊管围的分子标记,1个作为提高海南黑山羊体长指数的标记,这些有利于中国地方山羊生长性状的标记辅助选择(MAS),有利于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN104498610A
公开(公告)日:2015-04-08
申请号:CN201410810292.5
申请日:2014-12-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2535/138
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MEF2C基因SNP位点的RFLP方法及试剂盒,该方法是以黄牛基因组DNA或包含MEF2C基因序列的DNA为模板,进行PCR扩增,然后利用限制性内切酶Hind Ш消化PCR扩增产物,再对酶切后片段进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定黄牛NEF2C基因单核苷酸多态性。由于MEF2C基因在肌肉发育过程中起着重要的调节作用,与黄牛生长和肉质性状密切相关,而且该SNP与黄牛多种重要经济性状相关,所以,本发明提供的检测方法可用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,而且该方法操作简单、快速,成本低,检测精确度高,在建立遗传资源优良的黄牛种群方面非常有优势。
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公开(公告)号:CN103290005B
公开(公告)日:2014-10-15
申请号:CN201310204432.X
申请日:2013-05-28
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性及其检测和应用,其基因多态性包括:在奶山羊的ADFP基因序列表SEQ ID No.1第78位为A或C的碱基多态性。上述奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性为:以包含ADFP基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增奶山羊ADFP基因后进行多态性的检测。RFLP多态性与产奶量关联分析证实:EcoRI多态位点与羊奶中的脂肪含量之间有显著相关,基因型为AA的个体产奶量显著高于基因型为AC和CC个体的。本发明可以用于奶山羊的辅助选择和分子育种,对提高奶山羊奶中的脂肪含量具有重要的作用。
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