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公开(公告)号:CN107619857A
公开(公告)日:2018-01-23
申请号:CN201711003896.9
申请日:2017-10-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用:以肉牛品种郏县牛的血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增其KLF8基因CNV区域和内参基因BTF3,根据2*log2 2-ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型,鉴定其KLF8基因的拷贝数变异。与郏县牛生产数据的关联分析显示,KLF8不同拷贝数对郏县牛的生长发育有显著影响,其中缺失型个体的胸宽显著高于插入型和正常型个体。本发明在DNA水平上检测与肉牛生产性状密切相关的CNV,可作为肉牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号:CN107557439A
公开(公告)日:2018-01-09
申请号:CN201710986321.7
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以晋南牛的耳组织全基因组DNA为模板,利用一对特异引物IGF1R-CNV扩增牛IGF1R基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异引物BTF3-CNV扩增牛BTF3基因片段作为对照,然后利用2-ΔCt的方法计算个体的拷贝数,本发明提供的方法为建立晋南牛IGF1R基因拷贝数与生长性状之间的关联奠定了基础,通过对拷贝数变异与生长性状进行的关联分析,有利于加快晋南牛分子标记辅助选择育种工作。该方法简单、快速、便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107523643A
公开(公告)日:2017-12-29
申请号:CN201710985278.2
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒:基于实时荧光定量PCR技术,以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板,利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照,然后利用2-ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN103695416B
公开(公告)日:2017-10-24
申请号:CN201310465407.7
申请日:2013-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种秦川牛CFL2基因的单核苷酸多态性检测方法及其应用,其基因单核苷酸多态性包括:以包含CFL2基因的待测秦川牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增秦川牛CFL2基因;用限制性内切酶HaeIII消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定秦川牛CFL2基因第2213位的碱基多态性。由于这一突变位点与秦川牛肉用性状(胸围,胸宽,胸深和体重)密切关联该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与秦川牛生长性状密切相关分子遗传标记的方法,以用于秦川牛的辅助选择和分子育种,加快秦川牛良种繁育速度。
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公开(公告)号:CN107164482A
公开(公告)日:2017-09-15
申请号:CN201710414058.4
申请日:2017-06-05
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种山羊CSN1S1基因插入/缺失的检测方法及其应用。该方法是以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增山羊CSN1S1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊CSN1S1基因存在indel位点多态性。大样本(N>1000)相关分析结果揭示,CSN1S1基因indel的不同类型与陕北白绒山羊第一胎产羔性状之间存在显著相关,提示CSN1S1基因indel的不同类型可作为提高山羊第一胎产羔性状的DNA标记。本发明提供的快速检测山羊CSN1S1基因indel的方法,可在中国山羊繁殖性状的标记辅助选择育种中应用,有利于快速建立高产羔数性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN103805692B
公开(公告)日:2017-08-04
申请号:CN201310504648.8
申请日:2013-10-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测秦川牛PNPLA3基因单核苷酸多态性(SNP)的RFLP方法,以包含PNPLA3基因的待测牛全基因组DNA为模板,以人为设计的引物对P1、P2、P3、P4、P5为引物,PCR扩增牛PNPLA3基因,发现27个SNP位点;从中挑选错义突变位点4个并分别设计引物对P2‑BglI、P2‑RsaI、P3‑BmgT120I和P3‑MspI。用这4对引物进行PCR扩增,并用上述四种限制性内切酶分别酶切该PCR扩增产物,再用琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物,电泳结果显示秦川牛基因PNPLA3基因第2062位、第2078位、第35800位和第35932位的单核苷酸多态性。由于PNPLA3基因涉及体重、日增重等生长性状,PNPLA3蛋白具有脂肪酶和酰基转移酶的活性而且在维持能量平衡方面也具有重要的作用,本发明所述检测方法可用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择(MAS)育种,有利于快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN104498610B
公开(公告)日:2017-01-11
申请号:CN201410810292.5
申请日:2014-12-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MEF2C基因SNP位点的RFLP方法及试剂盒,该方法是以黄牛基因组DNA或包含MEF2C基因序列的DNA为模板,进行PCR扩增,然后利用限制性内切酶Hind Ш消化PCR扩增产物,再对酶切后片段进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定黄牛NEF2C基因单核苷酸多态性。由于MEF2C基因在肌肉发育过程中起着重要的调节作用,与黄牛生长和肉质性状密切相关,而且该SNP与黄牛多种重要经济性状相关,所以,本发明提供的检测方法可用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,而且该方法操作简单、快速,成本低,检测精确度高,在建立遗传资源优良的黄牛种群方面非常有优势。
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公开(公告)号:CN103233001B
公开(公告)日:2016-11-02
申请号:CN201210210461.2
申请日:2012-06-25
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种黄牛FoxO1基因的单核苷酸多态性及其检测方法,其基因单核苷酸多态性包括:以包含FoxO1基因的待测秦川牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增秦川牛FoxO1基因;用限制性内切酶HhaI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定秦川牛FoxO1基因第178132位的碱基多态性。由于FoxO1基因对动物肌肉脂肪性状、生长发育性状具有重要作用。所以,该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与秦川牛生长性状密切相关的分子遗传标记,以用于秦川牛的辅助选择和分子育种,加快秦川牛良种繁育速度。
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公开(公告)号:CN105624314A
公开(公告)日:2016-06-01
申请号:CN201610149981.5
申请日:2016-03-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一种利用PCR技术检测山羊TMEM 95基因微小拷贝数变异的方法及其应用,该方法以包含TMEM 95基因的中国地方山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增山羊TMEM 95基因部分序列,再对PCR扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊TMEM 95基因非编码区58bp微小拷贝数变异;由于TMEM 95基因对生长性状、泌乳性状具有重要调控作用,故本发明提供的检测方法为TMEM 95基因的微小拷贝数变异与生产性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国山羊生产性状的标记辅助选择,利于建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN101871006B
公开(公告)日:2014-07-02
申请号:CN201010003635.9
申请日:2010-01-05
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊weaver基因的单核苷酸多态性及其检测方法,其基因多态性包括:在奶山羊的weaver基因第99045位为T或C的碱基多态性;在奶山羊的weaver基因第99116位为T或C的碱基多态性。上述奶山羊weaver基因的单核苷酸多态性为:以包含weaver基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增奶山羊weaver基因;用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定奶山羊的单核苷酸多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记,可用于奶山羊的分子育种。
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