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公开(公告)号：CN109988847A
公开(公告)日：2019-07-09
申请号：CN201910308792.1
申请日：2019-04-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板，扩增茶卡羊SHE基因的拷贝数变异区域，并以扩增的茶卡羊ANKRD1基因片段作为内参，然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析，本发明提供的检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法为建立茶卡羊SHE基因拷贝数变异与体长性状之间的关联奠定了基础，可用于加快茶卡羊体长性状的选育进程，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN109880890A
公开(公告)日：2019-06-14
申请号：CN201910284640.2
申请日：2019-04-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊HIAT1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增山羊HIAT1基因部分片段，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定山羊HIAT1基因NC_030810.1:g.7695-7696位15-bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现，山羊HIAT1基因15-bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的生长性状存在显著相关关系，可作为提高山羊生长性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊HIAT1基因插入/缺失多态性的方法，可应用于山羊分子标记辅助选择育种中，加快建立优良生长性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号：CN105349674B
公开(公告)日：2019-05-17
申请号：CN201510867756.0
申请日：2015-11-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6827 , C12Q1/686 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种与秦川牛生长相关的CNV标记的检测方法与应用：所述的CNV标记是指牛SHH基因候选区域Chr 4:118264951‑118267170的拷贝数变异，该检测方法是以秦川牛的基因组DNA为模板，以引物对P1和P2为引物，通过实时荧光定量PCR分别扩增秦川牛SHH基因CNV区域和内参基因BTF3，根据log22‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定秦川牛SHH基因的拷贝数变异。本发明可在DNA水平上检测与秦川牛生产性状密切相关的CNV标记，可作为秦川牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。
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公开(公告)号：CN105671175B
公开(公告)日：2019-04-05
申请号：CN201610149819.3
申请日：2016-03-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛SPAG17基因插入/缺失的检测方法及其应用。以包含SPAG17基因的待测全基因组DNA为模板，以参照牛全基因组设计的引物对P1为引物，通过PCR技术扩增SPAG17基因，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定SPAG17基因在AC_000160:g146755‑146756insTCCTGACT位点存在不同的基因型。结果发现，SPAG17基因8‑bp插入/缺失的不同类型与夏南牛体高和体斜长等生长发育性状之间存在显著相关，提示SPAG17基因8‑bp插入/缺失的不同类型可作为提高夏南牛生长发育性状的DNA标记。故本发明将有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号：CN105624314B
公开(公告)日：2019-04-05
申请号：CN201610149981.5
申请日：2016-03-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种利用PCR技术检测山羊TMEM 95基因微小拷贝数变异的方法及其应用，该方法以包含TMEM 95基因的中国地方山羊全基因组DNA为模板，以引物对P1为引物，PCR扩增山羊TMEM 95基因部分序列，再对PCR扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊TMEM 95基因非编码区58bp微小拷贝数变异；由于TMEM 95基因对生长性状、泌乳性状具有重要调控作用，故本发明提供的检测方法为TMEM 95基因的微小拷贝数变异与生产性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国山羊生产性状的标记辅助选择，利于建立遗传资源优良的山羊种群。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109371145A
公开(公告)日：2019-02-22
申请号：CN201811565430.2
申请日：2018-12-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法及其应用，根据黄牛SPARC基因SNP位点(g.12545 C>T)为C或T的碱基多态性，以待测黄牛基因组DNA为模板，以突变受阻扩增引物PCR扩增黄牛SPARC基因部分片段；扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定黄牛SPARC基因的基因型；本发明可以在DNA水平上检测与黄牛生长性状关联的分子标记，以加快黄牛的早期选育，培育出生长性状优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN104878099B
公开(公告)日：2018-02-16
申请号：CN201510250256.2
申请日：2015-05-15
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6827 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊ATBF1基因单核苷酸多态性的检测方法及其应用：该方法是以待测山羊全基因组DNA为模板，通过PCR技术扩增山羊ATBF1基因，并用限制性内切酶MspI或HpaII消化PCR产物，再进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳结果鉴定山羊ATBF1基因第25748 nt或163517nt的基因型；ATBF1基因第25748nt和163517ntSNPs的不同基因型与山羊生长发育性状之间存在显著相关，故将有利于快速建立优良的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号：CN107574234A
公开(公告)日：2018-01-12
申请号：CN201711015960.5
申请日：2017-10-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛ACVR1基因单核苷酸多态性的方法及其应用。以包含ACVR1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对1F为引物，PCR扩增黄牛ACVR1基因，其包括在黄牛ACVR1基因第41793位为C或T的碱基多态性；用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛ACVR1基因第41793位的单核苷酸多态性；由于该方法是一种在DNA水平上筛查和检测到与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记，因此，可以用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN107475400A
公开(公告)日：2017-12-15
申请号：CN201710802522.7
申请日：2017-09-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种MYLK4基因辅助检测牛生长性状的方法及其专用试剂盒。以黄牛基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增获得黄牛MYLK4基因；PCR产物经限制性内切酶HhaI消化后，进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定黄牛MYLK4基因第61595位的单核苷酸多态性。本发明所阐述的方法能够检测黄牛MYLK4基因的单核苷酸多态性，可作为与牛生长性状密切相关分子遗传标记，用于牛的辅助选择和分子育种，加快良种牛繁育速度。
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公开(公告)号：CN107119117A
公开(公告)日：2017-09-01
申请号：CN201710284523.7
申请日：2017-04-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以秦川牛的血液全基因组DNA为模板，利用两对特异引物GBP2‑CNV1和GBP2‑CNV2分别扩增牛GBP2基因的两个拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增秦川牛BTF3基因作为对照，然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在秦川牛GBP2基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上，有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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