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公开(公告)号:CN109797232B
公开(公告)日:2020-10-09
申请号:CN201910095638.0
申请日:2019-01-31
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种丙二酸盐克罗诺杆菌CRISPR分型方法。本方法通过对丙二酸盐克罗诺杆菌的四种CRISPR分子进行DNA测序,提取序列中的间隔序列,根据几者的间隔序列组合确定丙二酸盐克罗诺杆菌的CRISPR型别。本发明方法简单、快速、低成本、分辨率高于MLST分型方法,无环境污染,对实验室设备要求低,且CRISPR分子保存有历史侵染的噬菌体及质粒等诸多信息,可联合数据库实现全国甚至全球标准化分子溯源,适合推广至食品、检验检疫等领域。
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公开(公告)号:CN110093392A
公开(公告)日:2019-08-06
申请号:CN201910272325.8
申请日:2019-04-04
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种四霉素A高产菌株YB101及其筛选方法和发酵生产方法。本发明对化学诱变复合紫外诱变处理后的大量菌株进行筛选时,利用多孔板培养技术并结合酶标仪检测结合于一体的简便、快速、精准、高效的高通量筛选技术应用于筛选高产目标产物的活性菌株,从而得到高产TMA活性菌株。本发明因此能够大大减轻工作量,提高筛选效率,并且操作程序简单,方法稳定,重现性好。在发酵培养过程中,利用优化的发酵条件,向发酵培养液中加入甘油,其最佳添加量的体积比为8.0%,用此含有甘油的发酵培养液对白色链霉菌进行发酵培养,通过优化发酵条件,最终检测TMA在发酵液中的产量为960.0μg/mL,相比菌株YB101的产量385.0μg/mL,提高了2.5倍。
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公开(公告)号:CN110093392B
公开(公告)日:2022-12-02
申请号:CN201910272325.8
申请日:2019-04-04
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种四霉素A高产菌株YB101及其筛选方法和发酵生产方法。本发明对化学诱变复合紫外诱变处理后的大量菌株进行筛选时,利用多孔板培养技术并结合酶标仪检测结合于一体的简便、快速、精准、高效的高通量筛选技术应用于筛选高产目标产物的活性菌株,从而得到高产TMA活性菌株。本发明因此能够大大减轻工作量,提高筛选效率,并且操作程序简单,方法稳定,重现性好。在发酵培养过程中,利用优化的发酵条件,向发酵培养液中加入甘油,其最佳添加量的体积比为8.0%,用此含有甘油的发酵培养液对白色链霉菌进行发酵培养,通过优化发酵条件,最终检测TMA在发酵液中的产量为960.0μg/mL,相比菌株YB101的产量385.0μg/mL,提高了2.5倍。
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公开(公告)号:CN109797232A
公开(公告)日:2019-05-24
申请号:CN201910095638.0
申请日:2019-01-31
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种丙二酸盐克罗诺杆菌CRISPR分型方法。本方法通过对丙二酸盐克罗诺杆菌的四种CRISPR分子进行DNA测序,提取序列中的间隔序列,根据几者的间隔序列组合确定丙二酸盐克罗诺杆菌的CRISPR型别。本发明方法简单、快速、低成本、分辨率高于MLST分型方法,无环境污染,对实验室设备要求低,且CRISPR分子保存有历史侵染的噬菌体及质粒等诸多信息,可联合数据库实现全国甚至全球标准化分子溯源,适合推广至食品、检验检疫等领域。
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公开(公告)号:CN114540314B
公开(公告)日:2023-12-05
申请号:CN202011333306.0
申请日:2020-11-24
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明提供了一种克罗诺杆菌噬菌体,所述噬菌体为克罗诺杆菌噬菌体vB_CtuP_A24,其保藏编号为:GDMCC No:61184‑B1,所述噬菌体为短尾噬菌体,呈多面体的头部和短尾结构,头部长127.6mm,宽56.7mm,尾部约36.1mm。本发明中的噬菌体在pH 4.0‑11范围和温度25‑60℃条件下具有良好的稳定性,不携带任何毒力或抗生素耐药基因,可以安全地运用于食品克罗诺杆菌的防控。
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公开(公告)号:CN112575100B
公开(公告)日:2022-06-14
申请号:CN202011619201.1
申请日:2020-12-30
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司
Inventor: 吴诗 , 吴清平 , 丁郁 , 陈谋通 , 薛亮 , 张菊梅 , 代京莎 , 王涓 , 叶青华 , 蔡芷荷 , 庞锐 , 雷涛 , 杨小鹃 , 张淑红 , 古其会 , 韦献虎 , 张友雄 , 张峰 , 黄嘉慧 , 陈鲁
Abstract: 本发明涉及生物工程技术领域,具有涉及3株我国自主知识产权的、符合国内传播规律的银白色葡萄球菌标准参考菌株,可用作食品、药品、临床检验等不同领域的标准参考菌株。其保藏号分别为:GDMCC 60854、GDMCC 60948和GDMCC 60949。本发明的3株银白色葡萄球菌菌株,遗传背景清晰,且样品来源、耐药性和分子检测靶标等信息清晰,完全满足食品、药品、临床检验方面对于标准菌株的要求。本发明还涉及一组用于检测、鉴别上述3株银白色葡萄球菌标准菌株的特异性靶标基因以及对应的PCR引物。最后,本发明还提供了一种存活率高、特异性的银白色葡萄球菌冻干保护剂,可用于本发明标准菌株的长期储存。
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公开(公告)号:CN109609668B
公开(公告)日:2022-06-14
申请号:CN201910105795.5
申请日:2019-02-01
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种鼠伤寒沙门菌MLVA分型的检测引物组、试剂盒及应用。本发明针对鼠伤寒沙门菌4个具有较好分辨能力的VNTR位点设计特异性引物,建立多重PCR扩增检测方法,对各位点PCR扩增产物片段进行测序,采用本地Blast技术对测序结果进行分析,获得4个位点重复序列数目组合,对鼠伤寒沙门菌进行MLVA分型。本发明的方法可对鼠伤寒沙门菌进行稳定的分型检测,仅分析4个VNTR位点、一次多重PCR扩增检测、直观方便的本地Blast分析获得VNTR重复序列数目,其分辨率与原MLVA‑5点分型方法相同,但分型效率高于原有MLVA‑5位点法,更简单、方便。
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公开(公告)号:CN111979292A
公开(公告)日:2020-11-24
申请号:CN202010730727.0
申请日:2020-07-27
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种同时携带多重耐药基因cfr和lsa(E)的MRSA的用途。金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)Sta2868B2在筛选功能微生物、药物或抗菌材料中的应用,所述的金黄色葡萄球菌Sta2868B2,保藏号:GDMCC No:61037。本发明提供了一种同时携带多重耐药基因cfr和lsa(E)的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌-金黄色葡萄球菌Sta2868B2。该菌株对11种类型的抗生素特别是利奈唑胺耐药,可做为筛选新型功能微生物/药物/抗菌材料的模型材料,具有良好的应用前景。
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公开(公告)号:CN111724859A
公开(公告)日:2020-09-29
申请号:CN202010551662.3
申请日:2020-06-16
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种基于核心基因组SNP分析的副溶血性弧菌溯源方法,所述方法对研究样品菌株和参考菌株核心基因组的SNP进行分析,判断其与各参考菌株之间的双尾SNP距离,可得到样品菌株与参考菌株之间的溯源关系,并可进一步用于样品菌致病性研究。本发明的副溶血性弧菌菌株溯源方法,可精确地反映样品菌与已知参考菌之间的分化时间,能较好地解释不同菌株之间的克隆性。相对于传统的分型方法,本发明方法通量更高,分辨率、准确性和重复性都更好,有助于确定不同菌株之间是否存在直接传播关系,对于不同菌株的流行病学关联研究、疾病防控具有重要的意义。
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公开(公告)号:CN109652573B
公开(公告)日:2019-08-30
申请号:CN201910105788.5
申请日:2019-02-01
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种用于鼠伤寒沙门菌或其单相菌变种分型检测的VNTR位点、检测引物组及检测分析方法。本发明针对鼠伤寒沙门菌及其单相菌变种沙门菌1,4,[5],12:i:‑新筛选2个VNTR位点,并联用已知的5个VNTR位点,建立MLVA‑2位点法和MLVA‑7位点法。经过大量鼠伤寒沙门菌及其单相菌变种沙门菌1,4,[5],12:i:‑菌株检测验证,本发明的检测分析方法可直接对鼠伤寒沙门菌及其单相菌变种沙门菌1,4,[5],12:i:‑进行稳定的分型检测,仅分析2个基因,分型效率与传统的MLST分型方法相当,仅分析7个基因,分型效率高于联用原有MLST和MLVA‑5位点分型方法。
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