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公开(公告)号:CN109797232B
公开(公告)日:2020-10-09
申请号:CN201910095638.0
申请日:2019-01-31
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种丙二酸盐克罗诺杆菌CRISPR分型方法。本方法通过对丙二酸盐克罗诺杆菌的四种CRISPR分子进行DNA测序,提取序列中的间隔序列,根据几者的间隔序列组合确定丙二酸盐克罗诺杆菌的CRISPR型别。本发明方法简单、快速、低成本、分辨率高于MLST分型方法,无环境污染,对实验室设备要求低,且CRISPR分子保存有历史侵染的噬菌体及质粒等诸多信息,可联合数据库实现全国甚至全球标准化分子溯源,适合推广至食品、检验检疫等领域。
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公开(公告)号:CN109797232A
公开(公告)日:2019-05-24
申请号:CN201910095638.0
申请日:2019-01-31
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种丙二酸盐克罗诺杆菌CRISPR分型方法。本方法通过对丙二酸盐克罗诺杆菌的四种CRISPR分子进行DNA测序,提取序列中的间隔序列,根据几者的间隔序列组合确定丙二酸盐克罗诺杆菌的CRISPR型别。本发明方法简单、快速、低成本、分辨率高于MLST分型方法,无环境污染,对实验室设备要求低,且CRISPR分子保存有历史侵染的噬菌体及质粒等诸多信息,可联合数据库实现全国甚至全球标准化分子溯源,适合推广至食品、检验检疫等领域。
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公开(公告)号:CN114540314B
公开(公告)日:2023-12-05
申请号:CN202011333306.0
申请日:2020-11-24
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明提供了一种克罗诺杆菌噬菌体,所述噬菌体为克罗诺杆菌噬菌体vB_CtuP_A24,其保藏编号为:GDMCC No:61184‑B1,所述噬菌体为短尾噬菌体,呈多面体的头部和短尾结构,头部长127.6mm,宽56.7mm,尾部约36.1mm。本发明中的噬菌体在pH 4.0‑11范围和温度25‑60℃条件下具有良好的稳定性,不携带任何毒力或抗生素耐药基因,可以安全地运用于食品克罗诺杆菌的防控。
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公开(公告)号:CN109609668B
公开(公告)日:2022-06-14
申请号:CN201910105795.5
申请日:2019-02-01
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种鼠伤寒沙门菌MLVA分型的检测引物组、试剂盒及应用。本发明针对鼠伤寒沙门菌4个具有较好分辨能力的VNTR位点设计特异性引物,建立多重PCR扩增检测方法,对各位点PCR扩增产物片段进行测序,采用本地Blast技术对测序结果进行分析,获得4个位点重复序列数目组合,对鼠伤寒沙门菌进行MLVA分型。本发明的方法可对鼠伤寒沙门菌进行稳定的分型检测,仅分析4个VNTR位点、一次多重PCR扩增检测、直观方便的本地Blast分析获得VNTR重复序列数目,其分辨率与原MLVA‑5点分型方法相同,但分型效率高于原有MLVA‑5位点法,更简单、方便。
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公开(公告)号:CN112899379B
公开(公告)日:2022-05-20
申请号:CN202011611248.3
申请日:2020-12-30
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司
Inventor: 王涓 , 吴清平 , 丁郁 , 陈谋通 , 薛亮 , 张菊梅 , 曾海燕 , 叶青华 , 吴诗 , 张淑红 , 庞锐 , 雷涛 , 古其会 , 张友雄 , 韦献虎 , 陈惠元 , 相欣然 , 汪智 , 唐胜君 , 陈鲁
Abstract: 本发明提供了3株空肠弯曲菌,所述菌株346‑1C保藏号为GDMCC 60857,菌株3853‑1A的保藏号为GDMCC 60858,菌株542‑1A的保藏号为GDMCC 60859;同时还提供了分别用于检测3株特异性空肠弯曲菌的特异性分子靶标,所述分子靶标包括如SEQ ID NO:1~3所示的核苷酸序列。所述菌株具有标准的空肠弯曲菌菌体显微形态和生理生化特征,可用于检验空肠弯曲菌显色平板的准确性,以及相关试剂验证的标准菌株。本发明还提供了一种冻干保护剂,具有成型好,外观漂亮且水溶性好,1‑2秒内能够完全溶解;在‑20℃条件下可以保存至少一年以上,能够保证其数量级不发生变化,可用于长期储存质控菌株。
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公开(公告)号:CN112029885A
公开(公告)日:2020-12-04
申请号:CN202011054958.0
申请日:2020-09-29
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了用于鉴定瑞士乳杆菌、发酵乳杆菌和嗜酸乳杆菌的分子标记、检测引物和检测方法。所述的分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1、2、3、4、5或6所示。本发明能有效鉴定瑞士乳杆菌、发酵乳杆菌和嗜酸乳杆菌,具有快速、准确、经济和操作简单等优点,便于食品企业和检验机构使用。
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公开(公告)号:CN111979292A
公开(公告)日:2020-11-24
申请号:CN202010730727.0
申请日:2020-07-27
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种同时携带多重耐药基因cfr和lsa(E)的MRSA的用途。金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)Sta2868B2在筛选功能微生物、药物或抗菌材料中的应用,所述的金黄色葡萄球菌Sta2868B2,保藏号:GDMCC No:61037。本发明提供了一种同时携带多重耐药基因cfr和lsa(E)的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌-金黄色葡萄球菌Sta2868B2。该菌株对11种类型的抗生素特别是利奈唑胺耐药,可做为筛选新型功能微生物/药物/抗菌材料的模型材料,具有良好的应用前景。
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公开(公告)号:CN109652573B
公开(公告)日:2019-08-30
申请号:CN201910105788.5
申请日:2019-02-01
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种用于鼠伤寒沙门菌或其单相菌变种分型检测的VNTR位点、检测引物组及检测分析方法。本发明针对鼠伤寒沙门菌及其单相菌变种沙门菌1,4,[5],12:i:‑新筛选2个VNTR位点,并联用已知的5个VNTR位点,建立MLVA‑2位点法和MLVA‑7位点法。经过大量鼠伤寒沙门菌及其单相菌变种沙门菌1,4,[5],12:i:‑菌株检测验证,本发明的检测分析方法可直接对鼠伤寒沙门菌及其单相菌变种沙门菌1,4,[5],12:i:‑进行稳定的分型检测,仅分析2个基因,分型效率与传统的MLST分型方法相当,仅分析7个基因,分型效率高于联用原有MLST和MLVA‑5位点分型方法。
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公开(公告)号:CN109735638A
公开(公告)日:2019-05-10
申请号:CN201910142342.X
申请日:2019-02-26
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)
Abstract: 本发明公开了一种鉴定持留型单核细胞增生李斯特菌ST121型菌株的多重PCR检测引物、试剂盒、方法及应用。本发明的多重PCR检测方法,包括检测靶标多重PCR引物设计、多重PCR体系扩增和电泳检测,若结果同时出现目标基因0609,0171、prfA条带,则证明菌株是持留型单核细胞增生李斯特菌ST121菌株,若结果出现目标基因0609,0171、prfA三条条带中的任意两条,则为其他ST型单增李斯特菌,若结果只出现prfA基因条带,则为单增李斯特菌。本发明能有效鉴定持留型单核细胞增生李斯特菌ST121菌株,具有快速、高效、灵敏度高、经济、准确和操作简单等优点,便于应用于食品、检验检疫等领域。
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公开(公告)号:CN112538544B
公开(公告)日:2022-06-14
申请号:CN202011608299.0
申请日:2020-12-30
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司
Inventor: 吴清平 , 张菊梅 , 丁郁 , 薛亮 , 陈谋通 , 相欣然 , 王涓 , 叶青华 , 吴诗 , 曾海燕 , 杨小鹃 , 张淑红 , 庞锐 , 雷涛 , 古其会 , 韦献虎 , 张友雄 , 陈鲁
Abstract: 本发明提供了用于检测食源性致病菌的特异性分子靶标,所述特异性分子靶标的核苷酸序列如SEQ ID NO:1~31所示。本发明还提供了一种食源性致病菌活菌的检测方法,包括以下步骤:步骤1:在待测样品加入PMA染料溶液;步骤2:提取待测样品中的菌体DNA;步骤3:以步骤2中的菌体DNA为模板,进行实时荧光定量PCR检测;步骤4:待反应结束后,将获得的荧光定量PCR扩增的曲线和Ct值与建立的标准曲线计算样品中食源性致病菌活菌的数量。本发明的检测方法具有检测时间短,无须经过传统的培养增菌过程,不受样品中食源性致病菌标准菌株死菌干扰,准确检测并定量样品中食源性致病菌标准菌株的具体含菌数量。
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