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公开(公告)号:CN107151666A
公开(公告)日:2017-09-12
申请号:CN201610119545.3
申请日:2016-03-03
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12N15/10
Abstract: 一种水体中微生物DNA的提取方法,采用无菌微孔滤膜收集微生物,利用物理和化学方法破碎微生物细胞,其次采用醋酸钾、异硫氰酸胍、柠檬酸钠等试剂去除腐殖酸等杂质,将细胞裂解液进行多次离心纯化,最后用乙醇和醋酸钾抽提后得到纯化的微生物基因组DNA,所提取的微生物DNA具有较好的完整性,纯度高,产量高,其OD260/OD280比值在1.8~2.0之间,经琼脂糖凝胶电泳后染色,DNA条带清晰且单一,无拖尾,无杂带,获得的微生物DNA产量高、操作简单、成本低,提取过程无需再纯化,缩减了提取步骤,降底了提取成本,适用于各种水体微生物的多样性分析。
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公开(公告)号:CN106929584A
公开(公告)日:2017-07-07
申请号:CN201710203520.6
申请日:2017-03-30
Applicant: 上海市农业科学院
CPC classification number: C12Q1/6844 , C12Q2521/507 , C12Q2531/119 , C12Q2565/625
Abstract: 一种检测Camv35S启动子的RPA引物、试剂盒及检测方法,该RPA引物具有高度专一性,用生物素、地高辛或FITC分别进行标记后,在RPA扩增反应中,无需引入探针,RPA扩增结束后,利用双标记核酸产物检测试纸条,仅需5~10分钟,就能快速检测被检制品中是否含有转基因成分,检测结果准确可靠,灵敏度高,直观性强,省去了电泳的步骤,也无需用到高致癌性的荧光染料溴化乙锭,大大缩短了实验进程,简化了实验步骤,在准确性及快速检测方面得到了显著的提高。
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公开(公告)号:CN106718179A
公开(公告)日:2017-05-31
申请号:CN201611037837.9
申请日:2016-11-23
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 一种转基因青蒿的环境安全评价方法,该方法对转基因青蒿的农艺性状、抗逆性以及基因漂移进行测试,同时以野生型受体青蒿作对照,评估中设置的参数涵盖了转基因青蒿和其野生型受体差异性的各指标,为转基因青蒿的环境释放建立了模型,在说明两者实质等同性上具有重要示范意义,本发明从以上三个方面建立的评价体系操作简单,易于实现,直观性强,结果准确性高,该方法对转基因青蒿的环境安全评价提供了待测指标,为转基因青蒿品种的商业化风险评估提供了技术支撑。
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公开(公告)号:CN105256013A
公开(公告)日:2016-01-20
申请号:CN201510629306.8
申请日:2015-09-29
Applicant: 上海市农业科学院
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12Q2531/113 , C12Q2563/159
Abstract: 一种同步检测猪羊牛动物源性成分的微滴PCR引物体系及检测方法,包括如下步骤:以样品总DNA为模板,利用所述引物对I、引物对II和引物对III组成的微滴PCR引物体系进行微滴PCR扩增实验,反应结束后根据琼脂糖凝胶电泳判定结果。其中,所述样品总DNA模板为猪、羊、牛物种肉产品中的一种以上。本发明公开了一种快速、准确、灵敏的微滴PCR同步检测3种动物源性成分的方法,能有效缩短实验时间,大大提高效率,且节省成本,从而有效鉴定猪羊牛制品的真伪及掺假情况。此外,本发明设计的微滴PCR引物体系配合相关试剂制成试剂盒,方便使用,同时为工业化生产及应用提供了可能。
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公开(公告)号:CN102719552B
公开(公告)日:2013-12-04
申请号:CN201210244815.5
申请日:2012-07-16
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了一种转基因香石竹Moonshade的品系特异性定性、定量PCR检测方法,包括以下步骤:1)转基因香石竹Moonshade基因组DNA的提取;2)转基因香石竹Moonshade外源基因插入位点的左边界旁邻序列的分离和确认;3)转基因香石竹Moonshade定性PCR检测;4)转基因香石竹Moonshade定量PCR检测。本发明建立了适用于转基因香石竹Moonshade的品系特异性定性、定量PCR检测方法,并验证了该检测方法的特异性和灵敏度,为转基因香石竹的进口检测、监管及环境安全评价提供重要依据。
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公开(公告)号:CN1557966B
公开(公告)日:2010-05-05
申请号:CN200410016060.9
申请日:2004-01-18
Applicant: 上海市农业科学院生物技术研究中心
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及适合于转基因棉花、番茄、水稻、油菜外源基因定性、定量PCR检测及拷贝数分析的内标准基因及其应用。本发明依据内标准基因的种内非特异性、种间特异性、单拷贝或低拷贝数,通过生物信息学分析和分子生物学实验验证,在棉花、番茄、水稻和油菜中寻找到4个内标准基因,分别为棉花的SAD I、番茄的LAT52、水稻的SPS和油菜的HMG I/Y基因。应用PCR方法进行了这些内标准基因的检测灵敏度和精确度实验验证。同时依据这些内标准基因分别建立了转基因棉花、番茄、水稻和油菜外源基因的定性、定量PCR检测系统;根据内标准基因的恒定拷贝数,建立转基因水稻、油菜、棉花、番茄的外源基因拷贝数的荧光定量PCR检测分析平台。
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公开(公告)号:CN102286624B
公开(公告)日:2013-03-27
申请号:CN201110247859.9
申请日:2011-08-26
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种转基因香石竹Moonlite的品系特异性定性、定量PCR检测方法,包括以下步骤:1)转基因香石竹Moonlite基因组DNA的提取;2)转基因香石竹Moonlite外源基因插入位点左边界旁邻序列的扩增和确认;3)转基因香石竹Moonlite定性PCR检测方法的建立和验证;4)转基因香石竹Moonlite定量PCR检测方法的建立和验证。本发明成功建立了适用于转基因香石竹Moonlite的品系特异性定性、定量PCR检测方法,并验证该检测方法的特异性和灵敏度,为转基因香石竹的进口检测、监管及环境安全评价提供依据。
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公开(公告)号:CN102286624A
公开(公告)日:2011-12-21
申请号:CN201110247859.9
申请日:2011-08-26
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种转基因香石竹Moonlite的品系特异性定性、定量PCR检测方法,包括以下步骤:1)转基因香石竹Moonlite基因组DNA的提取;2)转基因香石竹Moonlite外源基因插入位点左边界旁邻序列的扩增和确认;3)转基因香石竹Moonlite定性PCR检测方法的建立和验证;4)转基因香石竹Moonlite定量PCR检测方法的建立和验证。本发明成功建立了适用于转基因香石竹Moonlite的品系特异性定性、定量PCR检测方法,并验证该检测方法的特异性和灵敏度,为转基因香石竹的进口检测、监管及环境安全评价提供依据。
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公开(公告)号:CN101311275A
公开(公告)日:2008-11-26
申请号:CN200710041264.1
申请日:2007-05-25
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开一种在转基因品系特异性检测中扩增基因组品系特异序列方法。该方法将基因组DNA限制酶切,将人工合成的连接头与其相连,分别在连接头上和基因组已知区域设计引物,扩增基因组品系特异序列。本发明通过应用LA PCR技术,使以往扩增效率较低的长链未知区域的扩增变得简单,而且提高了保真性能。该方法还可制备成试剂盒,该试剂盒不必经过繁杂的文库构建及筛选、环化等,就能简单地得到基因组等上的长链目的DNA,并可减少变异点的导入,在转基因品系特异性检测中扩增品系特异性基因片段非常有效。
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公开(公告)号:CN116218960A
公开(公告)日:2023-06-06
申请号:CN202211722460.6
申请日:2022-12-30
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明提供一种简便的可视化快速核酸检测方法及其应用,所述方法采用以下检测体系,包括:(1)PMNT;(2)Cas12a蛋白;(3)crRNA;(4)报告分子;将待测样本加入该检测体系中,通过溶液在自然光下的颜色变化实现一种可视化快速核酸检测:当报告分子被Cas12a蛋白切割,溶液呈现黄色,表示待测样本中存在对应的靶标核酸分子;当报告分子不被Cas12a蛋白切割,溶液呈现红色,则表示待测样本中不存在对应的靶标核酸分子。本发明弥补了现有CRISPR检测技术的不足,具有无需荧光标记、无需荧光设备、检测结果易判定等优点,在环境监控、食品安全、医疗、动植物传染病防控等领域具有广阔的应用前景。
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