肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质

    公开(公告)号:CN112766428A

    公开(公告)日:2021-05-07

    申请号:CN202110374936.0

    申请日:2021-04-08

    Abstract: 本发明提供了一种肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质,其中,方法包括:获取多个肿瘤组织样本的测序数据,并计算拷贝数数值;筛选各肿瘤组织样本中发生变异的基因;对发生变异的基因进行无监督聚类得到多个样本类别;筛选各样本类别样本间基因拷贝数变异显著的基因并无监督聚类得到多个基因类别;基于拷贝数变异计算第一主成分,并通过回归分析确定第一主成分对患者预后的影响;根据第一主成分对患者预后的影响计算各肿瘤组织样本的拷贝数变异分值,并根据该值对各样本类别的样本进行分类,完成对肿瘤的分子分型。其基于每个基因的拷贝数变异进行分子分型,分辨率高、分型精准,且可以显著区分不同分子分型肿瘤患者的预后。

    一种用于生物组织样本检测细菌污染的质检方法

    公开(公告)号:CN112226528B

    公开(公告)日:2021-03-16

    申请号:CN202011463358.X

    申请日:2020-12-14

    Inventor: 李坤 魏继雨 陈豫

    Abstract: 本发明属于生物工程质检技术领域,具体涉及一种用于生物组织样本检测细菌污染的质检方法,分别配制两种RT‑qPCR反应体系,分别扩增细菌16S的rRNA和人ACTB,经过RT‑qPCR反应后,根据扩增后的细菌16S的rRNA的CT值和人ACTB的CT值的差值ΔCT=CT(ACTB)‑CT(16S),比较ΔCT与阈值的关系:若高于阈值,则生物组织样本为阳性,质控不合格;若低于阈值,则生物组织样本为阴性,质控合格。本发明方法在阈值取4时,质控结果具有最佳的灵敏度(86.7%)和特异性(93.8%),且检测方便、耗时短、准确度高。

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