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公开(公告)号:CN113643759B
公开(公告)日:2022-01-11
申请号:CN202111206821.7
申请日:2021-10-15
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于液体活检的染色体稳定性评价方法和装置、终端设备及存储介质,其中,染色体稳定性评价方法,包括:分别对待测血浆样本和选定的基准血浆样本进行捕获测序并进行预处理操作得到Bam文件;根据Bam文件分别对待测血浆样本和基准血浆样本bin水平的reads数量进行统计;根据bin水平的reads数量对待测血浆样本的染色体稳定性进行评分;根据评分对待测血浆样本的染色体稳定性进行评价。其根据统计的bin水平的reads数量得到染色体稳定性的评分,进而根据该评分对待测血浆样本的染色体稳定性进行评价,提高检测的鲁棒性和灵敏度。
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公开(公告)号:CN112766428A
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN202110374936.0
申请日:2021-04-08
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明提供了一种肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质,其中,方法包括:获取多个肿瘤组织样本的测序数据,并计算拷贝数数值;筛选各肿瘤组织样本中发生变异的基因;对发生变异的基因进行无监督聚类得到多个样本类别;筛选各样本类别样本间基因拷贝数变异显著的基因并无监督聚类得到多个基因类别;基于拷贝数变异计算第一主成分,并通过回归分析确定第一主成分对患者预后的影响;根据第一主成分对患者预后的影响计算各肿瘤组织样本的拷贝数变异分值,并根据该值对各样本类别的样本进行分类,完成对肿瘤的分子分型。其基于每个基因的拷贝数变异进行分子分型,分辨率高、分型精准,且可以显著区分不同分子分型肿瘤患者的预后。
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公开(公告)号:CN112226528B
公开(公告)日:2021-03-16
申请号:CN202011463358.X
申请日:2020-12-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明属于生物工程质检技术领域,具体涉及一种用于生物组织样本检测细菌污染的质检方法,分别配制两种RT‑qPCR反应体系,分别扩增细菌16S的rRNA和人ACTB,经过RT‑qPCR反应后,根据扩增后的细菌16S的rRNA的CT值和人ACTB的CT值的差值ΔCT=CT(ACTB)‑CT(16S),比较ΔCT与阈值的关系:若高于阈值,则生物组织样本为阳性,质控不合格;若低于阈值,则生物组织样本为阴性,质控合格。本发明方法在阈值取4时,质控结果具有最佳的灵敏度(86.7%)和特异性(93.8%),且检测方便、耗时短、准确度高。
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公开(公告)号:CN110129441A
公开(公告)日:2019-08-16
申请号:CN201910372726.0
申请日:2019-05-06
Applicant: 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明公开了一种基于二代测序用于脑胶质瘤的检测panel、检测试剂盒及其应用。其中,该检测panel包括脑胶质瘤相关基因和位点,脑胶质瘤相关基因及位点包括:1号染色体上的SNP位点、19号染色体上的SNP位点、MGMT、ATRX、H3F3A、ACVR1、CTC、HIST1H3B、MLH1、PLCG1、SMO、AKT1、CTNNB1、HIST1H3C、MSH2、PMS2、TERT、ATRX、DAXX、HRAS、MSH6、PPM1D、TP53、BCOR、DDX3X、IDH1、MYC、PTCH1等。应用本申请的检测panel,仅通过二代测序就可以为患者提供精准、全面的诊疗服务。
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公开(公告)号:CN119252324A
公开(公告)日:2025-01-03
申请号:CN202411782959.5
申请日:2024-12-06
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于超高深度测序的微小残留病灶检测方法及系统,涉及微小残留病灶智能化检测技术领域,包括以下步骤:基于测序文库,按照样本索引进行拆分获取待测样本,并根据待测样本的分子标识符,得到共识序列;基于共识序列,通过过滤掉质量值小于25或者familysize小于3的共识序列,联合subtype类型和距片段边缘距离作为引入原始核酸分子链上的噪音;上下文序列(context)以及链方向作为引入PCR扩增捕获水平的噪音;基于噪音水平,结合肿瘤先验知识,估计ctDNA水平,通过检验分子信号来源的显著性,从而确定MRD状态。本发明提高了MRD检测的灵敏度和特异性。
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公开(公告)号:CN118645153A
公开(公告)日:2024-09-13
申请号:CN202411114845.3
申请日:2024-08-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及基于全基因组甲基化数据的肿瘤微环境评价方法和系统,包括,获取免疫细胞的全基因组甲基化测序数据,计算免疫细胞特征区域的区域甲基化比率;对所述区域甲基化比率进行富集分析,获取免疫细胞的富集分数,基于所述富集分数评估免疫细胞浸润状态。本发明的方案可应用于≤10X低深度全基因组甲基化数据,填补了基于低深度的全基因组甲基化技术平台评估肿瘤免疫微环境的空白。
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公开(公告)号:CN116312774B
公开(公告)日:2024-03-15
申请号:CN202310575289.9
申请日:2023-05-22
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种基于cfDNA的癌症预测模型及其构建方法和应用,属于医学检测技术领域。该模型构建方法是:利用收集的染色质开放区域内的序列上游末端覆盖度和序列下游末端覆盖度计算染色质开放区域内的方向特异cfDNA片段值(orientation‑aware cfDNA fragmentation value,OCF值),利用阳性样本和对照样本的OCF值进行机器学习训练和预测模型的构建。上述构建方法或者构建的预测模型可用于癌症预测,如制造癌症预测装置、设备和存储介质等,从而能对患者患有癌症的概率给出预测。本申请能够使用受试者血浆cfDNA全基因测序数据,而无需组织穿刺等侵入性检测方法,预测受试者患有癌症的概率。
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公开(公告)号:CN116926198A
公开(公告)日:2023-10-24
申请号:CN202311191784.6
申请日:2023-09-15
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B25/10 , G16B40/00
Abstract: 本申请公开了一种检测胃癌组织Claudin18.2蛋白阳性的方法、装置、设备和存储介质,属于基因检测技术领域。该方法是基于NGS技术检测胃癌组织Claudin18.2基因的表达水平,并将其与本申请的预设阈值进行比较,从而在基因水平对胃癌组织Claudin18.2蛋白阳性进行检测,更易于实现检测结果判读的标准化。
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公开(公告)号:CN116287279A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310595127.1
申请日:2023-05-25
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B40/20 , G16B25/10 , G16H50/30
Abstract: 本申请公开了一种用于检测胰腺癌的生物标志物及其应用,属于医学检测技术领域。该生物标志物是肿瘤特异甲基化连锁区域组合中至少一个区域,该甲基化连锁区域的甲基化结果,如该区域内甲基化片段占比,即覆盖甲基化连锁区域中发生甲基化的片段数与覆盖该区域所有片段数的比例,在健康人群和胰腺癌的患者中具有显著差异,该生物标志物结合本申请提供的胰腺癌风险评估模型,可以有效检测胰腺癌。还可以将甲基化连锁区域组合中至少一个区域中甲基化结果与蛋白组合物CA19‑9和NSE联合作为生物标志物,可以有效检测胰腺癌。
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公开(公告)号:CN115679000A
公开(公告)日:2023-02-03
申请号:CN202211721580.4
申请日:2022-12-30
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6874 , G16B20/50 , G16B20/30 , G16B25/20 , G16B20/20
Abstract: 本申请公开了一种微小残留病灶的检测方法、装置、设备和存储介质,属于医疗检测技术领域。该方法基于差异化深度全外显子/靶向用药测序和组织‑血细胞‑血浆共捕获技术,及10万×超高深度个性化/高证据热点组合Panel测序的方式,评估血浆样本中微小残留病灶和肿瘤进化/第二原发的方法,克服现有方法在组织检测下限较高或追踪位点过少,和血液中ctDNA含量较低时检测灵敏度、准确度不足或检测成本过高,个性化追踪检测与肿瘤进化/第二原发检测无法兼得等问题,在有限成本范围内显著提高患者治疗后复发风险预测的准确性。
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