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公开(公告)号：CN112766428A
公开(公告)日：2021-05-07
申请号：CN202110374936.0
申请日：2021-04-08
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明提供了一种肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质，其中，方法包括：获取多个肿瘤组织样本的测序数据，并计算拷贝数数值；筛选各肿瘤组织样本中发生变异的基因；对发生变异的基因进行无监督聚类得到多个样本类别；筛选各样本类别样本间基因拷贝数变异显著的基因并无监督聚类得到多个基因类别；基于拷贝数变异计算第一主成分，并通过回归分析确定第一主成分对患者预后的影响；根据第一主成分对患者预后的影响计算各肿瘤组织样本的拷贝数变异分值，并根据该值对各样本类别的样本进行分类，完成对肿瘤的分子分型。其基于每个基因的拷贝数变异进行分子分型，分辨率高、分型精准，且可以显著区分不同分子分型肿瘤患者的预后。
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公开(公告)号：CN112766428B
公开(公告)日：2021-07-02
申请号：CN202110374936.0
申请日：2021-04-08
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明提供了一种肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质，其中，方法包括：获取多个肿瘤组织样本的测序数据，并计算拷贝数数值；筛选各肿瘤组织样本中发生变异的基因；对发生变异的基因进行无监督聚类得到多个样本类别；筛选各样本类别样本间基因拷贝数变异显著的基因并无监督聚类得到多个基因类别；基于拷贝数变异计算第一主成分，并通过回归分析确定第一主成分对患者预后的影响；根据第一主成分对患者预后的影响计算各肿瘤组织样本的拷贝数变异分值，并根据该值对各样本类别的样本进行分类，完成对肿瘤的分子分型。其基于每个基因的拷贝数变异进行分子分型，分辨率高、分型精准，且可以显著区分不同分子分型肿瘤患者的预后。
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公开(公告)号：CN113724785B
公开(公告)日：2022-02-08
申请号：CN202111280404.7
申请日：2021-11-01
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于二代测序的肿瘤分型装置、方法、存储介质及设备，属于生物检测技术领域。包括获取基因测序数据；对测序数据进行预处理；根据测序深度，计算每个变异在不同样本中的等位基因频率；根据每个变异在不同样本中的等位基因频率，计算每个变异在混合样本中的等位基因频率；根据变异种类及其在单个样本中的等位基因频率，计算单个样本的信息熵；基于变异种类及其在混合样本中的等位基因频率，计算混合样本的信息熵；基于同一患者单个样本和混合样本的信息熵计算熵差；根据混合样本信息熵差计算患者的特征值，并根据特征值阈值进行肿瘤分型。所述装置、存储介质和设备，基于所述方法实现。本发明能够对肿瘤进行准确分型，具有较强的临床适用性。
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公开(公告)号：CN113724785A
公开(公告)日：2021-11-30
申请号：CN202111280404.7
申请日：2021-11-01
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于二代测序的肿瘤分型装置、方法、存储介质及设备，属于生物检测技术领域。包括获取基因测序数据；对测序数据进行预处理；根据测序深度，计算每个变异在不同样本中的等位基因频率；根据每个变异在不同样本中的等位基因频率，计算每个变异在混合样本中的等位基因频率；根据变异种类及其在单个样本中的等位基因频率，计算单个样本的信息熵；基于变异种类及其在混合样本中的等位基因频率，计算混合样本的信息熵；基于同一患者单个样本和混合样本的信息熵计算熵差；根据混合样本信息熵差计算患者的特征值，并根据特征值阈值进行肿瘤分型。所述装置、存储介质和设备，基于所述方法实现。本发明能够对肿瘤进行准确分型，具有较强的临床适用性。
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