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公开(公告)号:CN118645153B
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202411114845.3
申请日:2024-08-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及基于全基因组甲基化数据的肿瘤微环境评价方法和系统,包括,获取免疫细胞的全基因组甲基化测序数据,计算免疫细胞特征区域的区域甲基化比率;对所述区域甲基化比率进行富集分析,获取免疫细胞的富集分数,基于所述富集分数评估免疫细胞浸润状态。本发明的方案可应用于≤10X低深度全基因组甲基化数据,填补了基于低深度的全基因组甲基化技术平台评估肿瘤免疫微环境的空白。
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公开(公告)号:CN118645153A
公开(公告)日:2024-09-13
申请号:CN202411114845.3
申请日:2024-08-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及基于全基因组甲基化数据的肿瘤微环境评价方法和系统,包括,获取免疫细胞的全基因组甲基化测序数据,计算免疫细胞特征区域的区域甲基化比率;对所述区域甲基化比率进行富集分析,获取免疫细胞的富集分数,基于所述富集分数评估免疫细胞浸润状态。本发明的方案可应用于≤10X低深度全基因组甲基化数据,填补了基于低深度的全基因组甲基化技术平台评估肿瘤免疫微环境的空白。
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公开(公告)号:CN116312774A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310575289.9
申请日:2023-05-22
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种基于cfDNA的癌症预测模型及其构建方法和应用,属于医学检测技术领域。该模型构建方法是:利用收集的染色质开放区域内的序列上游末端覆盖度和序列下游末端覆盖度计算染色质开放区域内的方向特异cfDNA片段值(orientation‑aware cfDNA fragmentation value,OCF值),利用阳性样本和对照样本的OCF值进行机器学习训练和预测模型的构建。上述构建方法或者构建的预测模型可用于癌症预测,如制造癌症预测装置、设备和存储介质等,从而能对患者患有癌症的概率给出预测。本申请能够使用受试者血浆cfDNA全基因测序数据,而无需组织穿刺等侵入性检测方法,预测受试者患有癌症的概率。
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公开(公告)号:CN116087530B
公开(公告)日:2023-06-20
申请号:CN202310315892.3
申请日:2023-03-29
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种用于检测胰腺癌的蛋白组合物、装置、设备和存储介质,属于医学检测技术领域。该蛋白组合物包括蛋白CA125、CA19‑9、CA50、CEA、NSE和free‑β‑hCG,基于上述蛋白表达水平的胰腺癌风险评估模型可以用于计算患有胰腺癌的概率,该蛋白组合物的表达水平结合本申请提供的胰腺癌风险评估模型,可以有效检测胰腺癌,其AUC值高于使用任意一个单一蛋白标志物以及临床血清标志物CA19‑9和NSE的检测结果。
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公开(公告)号:CN116287279B
公开(公告)日:2023-08-04
申请号:CN202310595127.1
申请日:2023-05-25
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B40/20 , G16B25/10 , G16H50/30
Abstract: 本申请公开了一种用于检测胰腺癌的生物标志物及其应用,属于医学检测技术领域。该生物标志物是肿瘤特异甲基化连锁区域组合中至少一个区域,该甲基化连锁区域的甲基化结果,如该区域内甲基化片段占比,即覆盖甲基化连锁区域中发生甲基化的片段数与覆盖该区域所有片段数的比例,在健康人群和胰腺癌的患者中具有显著差异,该生物标志物结合本申请提供的胰腺癌风险评估模型,可以有效检测胰腺癌。还可以将甲基化连锁区域组合中至少一个区域中甲基化结果与蛋白组合物CA19‑9和NSE联合作为生物标志物,可以有效检测胰腺癌。
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公开(公告)号:CN115691672B
公开(公告)日:2023-06-16
申请号:CN202211638241.X
申请日:2022-12-20
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种针对测序平台特征的碱基质量值矫正方法、装置、电子设备和存储介质,属于基因测序技术领域。该方法以原始双端测序数据为基础,提取read1和read2的重叠碱基,利用重叠碱基区分测序错误和非测序错误,并根据测序错误碱基所在的read朝向、测序循环数、测序方向的dinucleotide及测序仪给定的碱基质量值,将提取的重叠碱基划分成不同的bins,统计各特征bins下测序错误碱基并计算经验质量值,采用局部加权回归模型对特征bins内的RQS和EQS进行多项式拟合建模,并利用建立的模型对原始碱基质量值进行矫正。本申请能够区分测序错误和非测序错误,能够更准确的反映测序仪偏好,在此基础上建模矫正,能够全面提高碱基质量值的可信度。
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公开(公告)号:CN116087530A
公开(公告)日:2023-05-09
申请号:CN202310315892.3
申请日:2023-03-29
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种用于检测胰腺癌的蛋白组合物、装置、设备和存储介质,属于医学检测技术领域。该蛋白组合物包括蛋白CA125、CA19‑9、CA50、CEA、NSE和free‑β‑hCG,基于上述蛋白表达水平的胰腺癌风险评估模型可以用于计算患有胰腺癌的概率,该蛋白组合物的表达水平结合本申请提供的胰腺癌风险评估模型,可以有效检测胰腺癌,其AUC值高于使用任意一个单一蛋白标志物以及临床血清标志物CA19‑9和NSE的检测结果。
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公开(公告)号:CN116656830B
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202310956843.8
申请日:2023-08-01
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B25/20 , G16B30/00 , G16B40/10 , G16B40/20 , G16H50/30 , G06F18/2411
Abstract: 本申请公开了一种用于胃癌辅助诊断的甲基化标志物、装置、设备和存储介质,属于生物医学技术领域。该甲基化标志物包括差异甲基化区间,具体包括125个甲基化程度高相关区间(Methylation‑correlated block,MCB)中一个或多个的部分区间或全长区间,该甲基化程度高相关区间内甲基化位点的甲基化程度在胃癌组织样本与胃良性组织样本存在显著差异,与胃癌发生及发展有关。通过对差异甲基化区间进行分析、构建模型,可实现对胃癌辅助诊断的目的,具有通量高、检测特异性和敏感性高的优点,具有广阔的临床应用前景。将其用于胃癌辅助诊断,可以实现胃癌早筛早诊,提高生存率的目的。
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公开(公告)号:CN116656830A
公开(公告)日:2023-08-29
申请号:CN202310956843.8
申请日:2023-08-01
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B25/20 , G16B30/00 , G16B40/10 , G16B40/20 , G16H50/30 , G06F18/2411
Abstract: 本申请公开了一种用于胃癌辅助诊断的甲基化标志物、装置、设备和存储介质,属于生物医学技术领域。该甲基化标志物包括差异甲基化区间,具体包括125个甲基化程度高相关区间(Methylation‑correlated block,MCB)中一个或多个的部分区间或全长区间,该甲基化程度高相关区间内甲基化位点的甲基化程度在胃癌组织样本与胃良性组织样本存在显著差异,与胃癌发生及发展有关。通过对差异甲基化区间进行分析、构建模型,可实现对胃癌辅助诊断的目的,具有通量高、检测特异性和敏感性高的优点,具有广阔的临床应用前景。将其用于胃癌辅助诊断,可以实现胃癌早筛早诊,提高生存率的目的。
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公开(公告)号:CN115679000B
公开(公告)日:2023-03-21
申请号:CN202211721580.4
申请日:2022-12-30
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6874 , G16B20/50 , G16B20/30 , G16B25/20 , G16B20/20
Abstract: 本申请公开了一种微小残留病灶的检测方法、装置、设备和存储介质,属于医疗检测技术领域。该方法基于差异化深度全外显子/靶向用药测序和组织‑血细胞‑血浆共捕获技术,及10万×超高深度个性化/高证据热点组合Panel测序的方式,评估血浆样本中微小残留病灶和肿瘤进化/第二原发的方法,克服现有方法在组织检测下限较高或追踪位点过少,和血液中ctDNA含量较低时检测灵敏度、准确度不足或检测成本过高,个性化追踪检测与肿瘤进化/第二原发检测无法兼得等问题,在有限成本范围内显著提高患者治疗后复发风险预测的准确性。
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