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公开(公告)号:CN116087530A
公开(公告)日:2023-05-09
申请号:CN202310315892.3
申请日:2023-03-29
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种用于检测胰腺癌的蛋白组合物、装置、设备和存储介质,属于医学检测技术领域。该蛋白组合物包括蛋白CA125、CA19‑9、CA50、CEA、NSE和free‑β‑hCG,基于上述蛋白表达水平的胰腺癌风险评估模型可以用于计算患有胰腺癌的概率,该蛋白组合物的表达水平结合本申请提供的胰腺癌风险评估模型,可以有效检测胰腺癌,其AUC值高于使用任意一个单一蛋白标志物以及临床血清标志物CA19‑9和NSE的检测结果。
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公开(公告)号:CN113257350A
公开(公告)日:2021-08-13
申请号:CN202110650420.4
申请日:2021-06-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于液体活检的ctDNA突变程度分析方法和装置、ctDNA性能分析装置,其中,突变程度分析方法包括:对待检测血浆样本进行捕获测序得到FASTQ文件;分别提取配对reads中的分子标签并存储为uBAM文件;将FASTQ文件的基因序列与参考基因组进行比对并去重,并将其与uBAM文件合并得到含有分子标签的BAM文件;对BAM文件中的reads进行聚集并去重;在基因突变panel区域得到样本原始突变集合,并对其中的基因突变参数进行统计;对样本原始突变集合进行过滤,对各样本的基因突变参数进行统计;针对样本的基因突变参数对待检测血浆样本的突变程度进行评估,提高ctDNA突变检测的灵敏度。
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公开(公告)号:CN112735531A
公开(公告)日:2021-04-30
申请号:CN202110337436.X
申请日:2021-03-30
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明提供了一种循环无细胞核小体活性区域的甲基化分析方法和装置、终端设备及存储介质,其中,方法包括:获取待检测血浆样本的捕获测序数据并从中提取cfDNA分子片段;基于提取的cfDNA分子片段,在其基因组区间内采用窗口进行滑动操作,并计算各窗口内首尾跨过了整个窗口的cfDNA分子数量及窗口覆盖的所有不同情况cfDNA分子数量的比值;基于计算的比值通过柯尔莫诺夫‑斯米尔诺夫检验的方法筛选出与根据健康人样本创建的基线核小体活性差异区域之间存在显著差异的区间,得到核小体活性区域;计算筛选的核小体活性区域的甲基化表型特征,完成对循环无细胞核小体活性区域的甲基化分析,能够有效辅助区分待检测血浆样本的来源。
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公开(公告)号:CN118645153B
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202411114845.3
申请日:2024-08-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及基于全基因组甲基化数据的肿瘤微环境评价方法和系统,包括,获取免疫细胞的全基因组甲基化测序数据,计算免疫细胞特征区域的区域甲基化比率;对所述区域甲基化比率进行富集分析,获取免疫细胞的富集分数,基于所述富集分数评估免疫细胞浸润状态。本发明的方案可应用于≤10X低深度全基因组甲基化数据,填补了基于低深度的全基因组甲基化技术平台评估肿瘤免疫微环境的空白。
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公开(公告)号:CN116656830B
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202310956843.8
申请日:2023-08-01
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B25/20 , G16B30/00 , G16B40/10 , G16B40/20 , G16H50/30 , G06F18/2411
Abstract: 本申请公开了一种用于胃癌辅助诊断的甲基化标志物、装置、设备和存储介质,属于生物医学技术领域。该甲基化标志物包括差异甲基化区间,具体包括125个甲基化程度高相关区间(Methylation‑correlated block,MCB)中一个或多个的部分区间或全长区间,该甲基化程度高相关区间内甲基化位点的甲基化程度在胃癌组织样本与胃良性组织样本存在显著差异,与胃癌发生及发展有关。通过对差异甲基化区间进行分析、构建模型,可实现对胃癌辅助诊断的目的,具有通量高、检测特异性和敏感性高的优点,具有广阔的临床应用前景。将其用于胃癌辅助诊断,可以实现胃癌早筛早诊,提高生存率的目的。
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公开(公告)号:CN116656830A
公开(公告)日:2023-08-29
申请号:CN202310956843.8
申请日:2023-08-01
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B25/20 , G16B30/00 , G16B40/10 , G16B40/20 , G16H50/30 , G06F18/2411
Abstract: 本申请公开了一种用于胃癌辅助诊断的甲基化标志物、装置、设备和存储介质,属于生物医学技术领域。该甲基化标志物包括差异甲基化区间,具体包括125个甲基化程度高相关区间(Methylation‑correlated block,MCB)中一个或多个的部分区间或全长区间,该甲基化程度高相关区间内甲基化位点的甲基化程度在胃癌组织样本与胃良性组织样本存在显著差异,与胃癌发生及发展有关。通过对差异甲基化区间进行分析、构建模型,可实现对胃癌辅助诊断的目的,具有通量高、检测特异性和敏感性高的优点,具有广阔的临床应用前景。将其用于胃癌辅助诊断,可以实现胃癌早筛早诊,提高生存率的目的。
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公开(公告)号:CN115679000B
公开(公告)日:2023-03-21
申请号:CN202211721580.4
申请日:2022-12-30
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6874 , G16B20/50 , G16B20/30 , G16B25/20 , G16B20/20
Abstract: 本申请公开了一种微小残留病灶的检测方法、装置、设备和存储介质,属于医疗检测技术领域。该方法基于差异化深度全外显子/靶向用药测序和组织‑血细胞‑血浆共捕获技术,及10万×超高深度个性化/高证据热点组合Panel测序的方式,评估血浆样本中微小残留病灶和肿瘤进化/第二原发的方法,克服现有方法在组织检测下限较高或追踪位点过少,和血液中ctDNA含量较低时检测灵敏度、准确度不足或检测成本过高,个性化追踪检测与肿瘤进化/第二原发检测无法兼得等问题,在有限成本范围内显著提高患者治疗后复发风险预测的准确性。
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公开(公告)号:CN115691672A
公开(公告)日:2023-02-03
申请号:CN202211638241.X
申请日:2022-12-20
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种针对测序平台特征的碱基质量值矫正方法、装置、电子设备和存储介质,属于基因测序技术领域。该方法以原始双端测序数据为基础,提取read1和read2的重叠碱基,利用重叠碱基区分测序错误和非测序错误,并根据测序错误碱基所在的read朝向、测序循环数、测序方向的dinucleotide及测序仪给定的碱基质量值,将提取的重叠碱基划分成不同的bins,统计各特征bins下测序错误碱基并计算经验质量值,采用局部加权回归模型对特征bins内的RQS和EQS进行多项式拟合建模,并利用建立的模型对原始碱基质量值进行矫正。本申请能够区分测序错误和非测序错误,能够更准确的反映测序仪偏好,在此基础上建模矫正,能够全面提高碱基质量值的可信度。
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公开(公告)号:CN113903401B
公开(公告)日:2022-04-08
申请号:CN202111513450.7
申请日:2021-12-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
IPC: G16B40/00 , G16B25/10 , G16B25/20 , G16B30/10 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种基于ctDNA长度的分析方法和系统,其中,分析方法中包括:基于NGS平台对待检测血浆样本进行低深度的全基因组测序;采用预先选定大小的窗口对全基因组区间进行划分,并对各窗口内短插入片段和长插入片段的数量比值ratio进行计算,短插入片段的数量据预先设定的短插入片段区间阈值统计得到,长插入片段的数量根据预先设定的长插入片段区间阈值统计得到;由统计得到的数量比值ratio使用预先训练的ctDNA长度分析模型得到待检测血浆样本的评分,进而根据评分对待检测血浆样本进行分析。该方法能够对待检测血浆样本的cfDNA长度进行精确分析,为后续应用提供部分依据。
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公开(公告)号:CN113643759B
公开(公告)日:2022-01-11
申请号:CN202111206821.7
申请日:2021-10-15
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于液体活检的染色体稳定性评价方法和装置、终端设备及存储介质,其中,染色体稳定性评价方法,包括:分别对待测血浆样本和选定的基准血浆样本进行捕获测序并进行预处理操作得到Bam文件;根据Bam文件分别对待测血浆样本和基准血浆样本bin水平的reads数量进行统计;根据bin水平的reads数量对待测血浆样本的染色体稳定性进行评分;根据评分对待测血浆样本的染色体稳定性进行评价。其根据统计的bin水平的reads数量得到染色体稳定性的评分,进而根据该评分对待测血浆样本的染色体稳定性进行评价,提高检测的鲁棒性和灵敏度。
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