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公开(公告)号:CN118645153B
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202411114845.3
申请日:2024-08-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及基于全基因组甲基化数据的肿瘤微环境评价方法和系统,包括,获取免疫细胞的全基因组甲基化测序数据,计算免疫细胞特征区域的区域甲基化比率;对所述区域甲基化比率进行富集分析,获取免疫细胞的富集分数,基于所述富集分数评估免疫细胞浸润状态。本发明的方案可应用于≤10X低深度全基因组甲基化数据,填补了基于低深度的全基因组甲基化技术平台评估肿瘤免疫微环境的空白。
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公开(公告)号:CN119252324A
公开(公告)日:2025-01-03
申请号:CN202411782959.5
申请日:2024-12-06
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于超高深度测序的微小残留病灶检测方法及系统,涉及微小残留病灶智能化检测技术领域,包括以下步骤:基于测序文库,按照样本索引进行拆分获取待测样本,并根据待测样本的分子标识符,得到共识序列;基于共识序列,通过过滤掉质量值小于25或者familysize小于3的共识序列,联合subtype类型和距片段边缘距离作为引入原始核酸分子链上的噪音;上下文序列(context)以及链方向作为引入PCR扩增捕获水平的噪音;基于噪音水平,结合肿瘤先验知识,估计ctDNA水平,通过检验分子信号来源的显著性,从而确定MRD状态。本发明提高了MRD检测的灵敏度和特异性。
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公开(公告)号:CN118645153A
公开(公告)日:2024-09-13
申请号:CN202411114845.3
申请日:2024-08-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及基于全基因组甲基化数据的肿瘤微环境评价方法和系统,包括,获取免疫细胞的全基因组甲基化测序数据,计算免疫细胞特征区域的区域甲基化比率;对所述区域甲基化比率进行富集分析,获取免疫细胞的富集分数,基于所述富集分数评估免疫细胞浸润状态。本发明的方案可应用于≤10X低深度全基因组甲基化数据,填补了基于低深度的全基因组甲基化技术平台评估肿瘤免疫微环境的空白。
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公开(公告)号:CN116913380B
公开(公告)日:2023-12-05
申请号:CN202311168288.9
申请日:2023-09-12
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 武汉臻和医学检验实验室有限公司
Abstract: 本发明提供了一种晚期肿瘤ctDNA动态变化判定方法及装置,属于医学检测技术领域。包括接收晚期肿瘤治前血浆和配对的血细胞的测序数据,构建肿瘤患者治疗前血浆个性化变异图谱;根据血浆变异图谱追踪治疗后血浆的变异信号;基于临床治疗前后突变位点的变异频率以及测序深度定量权重,评估治疗对位点变异频率变化的贡献度,降低测序和分析造成波动的影响,对晚期患者治疗前后血浆ctDNA的变化进行更准确的定量,评估患者对治疗方式是否响应。计算所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够更准确地对晚期肿瘤ctDNA动态变化进行判定,可有效提高对晚期肿瘤患者进行疗效评估的精准度。
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公开(公告)号:CN116913380A
公开(公告)日:2023-10-20
申请号:CN202311168288.9
申请日:2023-09-12
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 武汉臻和医学检验实验室有限公司
Abstract: 本发明提供了一种晚期肿瘤ctDNA动态变化判定方法及装置,属于医学检测技术领域。包括接收晚期肿瘤治前血浆和配对的血细胞的测序数据,构建肿瘤患者治疗前血浆个性化变异图谱;根据血浆变异图谱追踪治疗后血浆的变异信号;基于临床治疗前后突变位点的变异频率以及测序深度定量权重,评估治疗对位点变异频率变化的贡献度,降低测序和分析造成波动的影响,对晚期患者治疗前后血浆ctDNA的变化进行更准确的定量,评估患者对治疗方式是否响应。计算所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够更准确地对晚期肿瘤ctDNA动态变化进行判定,可有效提高对晚期肿瘤患者进行疗效评估的精准度。
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