晚期肿瘤ctDNA动态变化判定方法及装置

    公开(公告)号:CN116913380B

    公开(公告)日:2023-12-05

    申请号:CN202311168288.9

    申请日:2023-09-12

    Abstract: 本发明提供了一种晚期肿瘤ctDNA动态变化判定方法及装置,属于医学检测技术领域。包括接收晚期肿瘤治前血浆和配对的血细胞的测序数据,构建肿瘤患者治疗前血浆个性化变异图谱;根据血浆变异图谱追踪治疗后血浆的变异信号;基于临床治疗前后突变位点的变异频率以及测序深度定量权重,评估治疗对位点变异频率变化的贡献度,降低测序和分析造成波动的影响,对晚期患者治疗前后血浆ctDNA的变化进行更准确的定量,评估患者对治疗方式是否响应。计算所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够更准确地对晚期肿瘤ctDNA动态变化进行判定,可有效提高对晚期肿瘤患者进行疗效评估的精准度。

    晚期肿瘤ctDNA动态变化判定方法及装置

    公开(公告)号:CN116913380A

    公开(公告)日:2023-10-20

    申请号:CN202311168288.9

    申请日:2023-09-12

    Abstract: 本发明提供了一种晚期肿瘤ctDNA动态变化判定方法及装置,属于医学检测技术领域。包括接收晚期肿瘤治前血浆和配对的血细胞的测序数据,构建肿瘤患者治疗前血浆个性化变异图谱;根据血浆变异图谱追踪治疗后血浆的变异信号;基于临床治疗前后突变位点的变异频率以及测序深度定量权重,评估治疗对位点变异频率变化的贡献度,降低测序和分析造成波动的影响,对晚期患者治疗前后血浆ctDNA的变化进行更准确的定量,评估患者对治疗方式是否响应。计算所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够更准确地对晚期肿瘤ctDNA动态变化进行判定,可有效提高对晚期肿瘤患者进行疗效评估的精准度。

    基于NGS的染色体非整倍体检测方法、装置、介质和设备

    公开(公告)号:CN114708905A

    公开(公告)日:2022-07-05

    申请号:CN202210506571.7

    申请日:2022-05-11

    Abstract: 本发明公开了一种基于NGS的染色体非整倍体检测方法、装置、介质和设备,涉及生物医学技术领域。包括接收肿瘤组织和正常组织的NGS测序数据;对所述NGS测序数据进行预处理,获得中间数据文件;利用所述中间数据文件,对性别和胚系SNP进行一致性评估;利用所述中间数据文件获取待测样本基因组上覆盖深度信息及SNP基因型信息;检测肿瘤样本纯度、倍性和SCNV片段;根据单个肿瘤样本和准备好的泛癌队列SCNV数据库,计算每个肿瘤样本染色体臂水平的SCNV;基于样本染色体臂水平的SCNV,计算每个肿瘤样本最终的染色体非整倍体得分。所述装置、介质和设备均基于所述的方法。本发明提高了肿瘤染色体非整倍体检测的准确性。

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