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公开(公告)号:CN112226528B
公开(公告)日:2021-03-16
申请号:CN202011463358.X
申请日:2020-12-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明属于生物工程质检技术领域,具体涉及一种用于生物组织样本检测细菌污染的质检方法,分别配制两种RT‑qPCR反应体系,分别扩增细菌16S的rRNA和人ACTB,经过RT‑qPCR反应后,根据扩增后的细菌16S的rRNA的CT值和人ACTB的CT值的差值ΔCT=CT(ACTB)‑CT(16S),比较ΔCT与阈值的关系:若高于阈值,则生物组织样本为阳性,质控不合格;若低于阈值,则生物组织样本为阴性,质控合格。本发明方法在阈值取4时,质控结果具有最佳的灵敏度(86.7%)和特异性(93.8%),且检测方便、耗时短、准确度高。
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公开(公告)号:CN119252323B
公开(公告)日:2025-03-21
申请号:CN202411729727.3
申请日:2024-11-29
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基因融合检测Panel性能评价方法及装置,属于生信分析领域,通过基于预先构建的融合基因转录本数据库,合成不同类型的已知融合基因单链DNA,用于模拟未知融合基因组合;对融合基因单链DNA进行扩增;对扩增产物进行转录;使用待评价检测Panel对转录组文库进行捕获;对捕获的转录本进行测序;对测序数据进行数据处理;判断测序数据是否通过质控;若通过,则基于处理后的测序数据分析目标融合检出情况。本发明构建了覆盖全面的融合基因库,通过生物信息学分析方法不但可以评价检测Panel对已知融合基因的检出性能,而且还可以预测检出未知融合基因的能力。
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公开(公告)号:CN119252323A
公开(公告)日:2025-01-03
申请号:CN202411729727.3
申请日:2024-11-29
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基因融合检测Panel性能评价方法及装置,属于生信分析领域,通过基于预先构建的融合基因转录本数据库,合成不同类型的已知融合基因单链DNA,用于模拟未知融合基因组合;对融合基因单链DNA进行扩增;对扩增产物进行转录;使用待评价检测Panel对转录组文库进行捕获;对捕获的转录本进行测序;对测序数据进行数据处理;判断测序数据是否通过质控;若通过,则基于处理后的测序数据分析目标融合检出情况。本发明构建了覆盖全面的融合基因库,通过生物信息学分析方法不但可以评价检测Panel对已知融合基因的检出性能,而且还可以预测检出未知融合基因的能力。
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公开(公告)号:CN116926198A
公开(公告)日:2023-10-24
申请号:CN202311191784.6
申请日:2023-09-15
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B25/10 , G16B40/00
Abstract: 本申请公开了一种检测胃癌组织Claudin18.2蛋白阳性的方法、装置、设备和存储介质,属于基因检测技术领域。该方法是基于NGS技术检测胃癌组织Claudin18.2基因的表达水平,并将其与本申请的预设阈值进行比较,从而在基因水平对胃癌组织Claudin18.2蛋白阳性进行检测,更易于实现检测结果判读的标准化。
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公开(公告)号:CN112226528A
公开(公告)日:2021-01-15
申请号:CN202011463358.X
申请日:2020-12-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明属于生物工程质检技术领域,具体涉及一种用于生物组织样本检测细菌污染的质检方法,分别配制两种RT‑qPCR反应体系,分别扩增细菌16S的rRNA和人ACTB,经过RT‑qPCR反应后,根据扩增后的细菌16S的rRNA的CT值和人ACTB的CT值的差值ΔCT=CT(ACTB)‑CT(16S),比较ΔCT与阈值的关系:若高于阈值,则生物组织样本为阳性,质控不合格;若低于阈值,则生物组织样本为阴性,质控合格。本发明方法在阈值取4时,质控结果具有最佳的灵敏度(86.7%)和特异性(93.8%),且检测方便、耗时短、准确度高。
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