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公开(公告)号:CN103290121A
公开(公告)日:2013-09-11
申请号:CN201310202865.1
申请日:2013-05-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛Vaspin基因单核苷酸多态性的方法与应用,以包含Vaspin基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛Vaspin基因;用限制性内切酶MspI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛Vaspin基因第1124477位的单核苷酸多态性;由于Vaspin基因功能涉及初生重、日增重、体重生长性状,本发明提供的检测方法为Vaspin基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN102031307B
公开(公告)日:2013-01-30
申请号:CN201010550620.4
申请日:2010-11-19
Applicant: 西北农林科技大学 , 汉中天成生物工程有限公司
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种利用蜕皮检测大鲵群虹彩病毒带毒情况的试剂盒和检测的方法。试剂盒包括A液,蜕皮样本裂解液,1管,含有PBS;1%triton-100;B液,1管,200ug/ml蛋白酶K;C液,1管,模板抽提液,1管,含有酚/氯仿/异戊醇,比例为25∶24∶1;D液,1管,3mol/l乙酸钠等;本发明利用大鲵的新鲜蜕皮作为检测病料样品,解决了必须杀死大鲵个体才能获取检测样品的不足;根据大鲵蜕皮的特点我们优化了从蜕皮中提取病毒基因组DNA的方法,设计了简单而有效地提取大鲵蜕皮样品中的虹彩病毒基因的试剂盒,以及针对虹彩病毒2个保守基因的2对PCR引物和聚合酶链式反应条件;设立了阳性和阴性对照品。利用本发明的试剂盒并进行标准步骤的检测,更加可靠地掌握大鲵群虹彩病毒带毒情况,有利于在实际生产中应用。
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公开(公告)号:CN101906470B
公开(公告)日:2012-08-29
申请号:CN201010223349.3
申请日:2010-07-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛FTO基因单核苷酸多态性的方法,以包含FTO基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛FTO基因;对PCR产物进行高温变性后,再进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛FTO基因编码区第783位(+1为翻译起始位点)的单核苷酸多态性;由于FTO基因功能涉及体长和体高性状,本发明提供的检测方法为FTO基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN102251038A
公开(公告)日:2011-11-23
申请号:CN201110201229.8
申请日:2011-07-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛TMEM18(transmembrane protein 18)基因单核苷酸多态性的方法,其基因多态性包括:在黄牛TMEM18基因第3843位为A或G的碱基多态性;在黄牛TMEM18基因第3873位为G或A的碱基多态性。上述黄牛TMEM18基因的单核苷酸多态性为:以包含TMEM18基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对1F和2F为引物,PCR扩增黄牛TMEM18基因;分别用限制性内切酶XspI和MluI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛TMEM18基因第3843位和第3873位的单核苷酸多态性;该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,以便于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN101906470A
公开(公告)日:2010-12-08
申请号:CN201010223349.3
申请日:2010-07-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛FTO基因单核苷酸多态性的方法,以包含FTO基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛FTO基因;对PCR产物进行高温变性后,再进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛FTO基因编码区第783位(+1为翻译起始位点)的单核苷酸多态性;由于FTO基因功能涉及体长和体高性状,本发明提供的检测方法为FTO基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN101899500A
公开(公告)日:2010-12-01
申请号:CN201010108118.8
申请日:2010-02-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛KLF7基因单核苷酸多态性的方法,以包含KLF7基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2、P3等摩尔比的混合物为引物,PCR扩增黄牛KLF7基因;用限制性内切酶TaqI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛KLF7基因第41401、42025、42075位的单核苷酸多态性。本发明对KLF7基因的SNPs进行了基因分型和基因频率分析,以及与南阳牛不同生长阶段的生长性状之间进行了性状关联分析;结果表明:KLF7基因尤其是P2检测SNP位点可用作黄牛生长性状早期选择(6月龄和12月龄)的分子标记。
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公开(公告)号:CN101875977A
公开(公告)日:2010-11-03
申请号:CN201010235173.3
申请日:2010-07-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SREBP1c基因单核苷酸多态性的方法,以包含SREBP1c基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛SREBP1c基因;用限制性内切酶Bgl I消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SREBP1c基因第10914位的单核苷酸多态性。由于SREBP1c基因功能涉及体重、日增重、体斜长和胸围4个重要的生长性状,本发明提供的检测方法为SREBP1c基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN101705289A
公开(公告)日:2010-05-12
申请号:CN200910219003.3
申请日:2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了奶山羊GHRHR基因的单核苷酸多态性及其检测方法,其基因单核苷酸多态性包括:在如SEQ ID NO.1所示的奶山羊的GHRHR基因序列表的第231位为C或G的碱基多态性。其检测方法为:以包含GHRHR基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增奶山羊GHRHR基因;用限制性内切酶MspI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定其多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记,以用于奶山羊的辅助选择和分子育种,加快奶山羊良种繁育速度。
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公开(公告)号:CN110760597B
公开(公告)日:2022-08-23
申请号:CN201911159100.8
申请日:2019-11-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛NCSTN基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以云岭牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛NCSTN基因的拷贝数变异区域部分片段,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛BTF3基因部分片段作为内参对照,最后利用‑ΔΔCt计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立云岭牛NCSTN基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN109943646B
公开(公告)日:2022-08-16
申请号:CN201910354830.7
申请日:2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛PLAG1基因CNV分子标记辅助检测生长性状的方法及其应用:以黄牛基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增PLAG1基因拷贝数变异区域和内参基因BTF3的部分片段,根据2‑ΔΔCt方法将定量结果分为多拷贝型和正常型,从而鉴定黄牛个体PLAG1基因的拷贝数变异类型。本发明在DNA水平上检测与黄牛生长性状密切相关的拷贝数变异,该拷贝数变异可作为中国黄牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,用于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作。
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