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公开(公告)号:CN111560421A
公开(公告)日:2020-08-21
申请号:CN202010550697.5
申请日:2020-06-16
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种夏南牛HMGA2基因Indel标记的检测方法及应用;以夏南牛的基因组DNA为模板,通过PCR扩增夏南牛HMGA2基因部分片段,并利用琼脂糖凝胶电泳对夏南牛个体HMGA2基因chr5:48094736-48094742的7bp插入缺失突变位点快速分型;该检测方法可以在DNA水平上筛查和检测与夏南牛体高密切相关的分子遗传标记,并应用于夏南牛体高的分子标记辅助选择,从而加快夏南牛品种改良的选育进程。
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公开(公告)号:CN107400720B
公开(公告)日:2020-04-21
申请号:CN201710808013.5
申请日:2017-09-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种KLF3基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其专用试剂盒。基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛基因组DNA为模板,扩增黄牛KLF3基因的拷贝数变异区域,并扩增牛通用转录因子BTF3基因作为内参,最后利用2‑ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立牛KLF3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110964838A
公开(公告)日:2020-04-07
申请号:CN202010006026.2
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速检测绵羊LRRFIP1基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以绵羊血样全基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增绵羊LRRFIP1基因的拷贝数变异区域的部分片段,利用另外一对特异性引物扩增绵羊ANKRD1基因部分片段作为对照,然后利用2*2-ΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,基于绵羊LRRFIP1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立茶卡羊等地方绵羊品种的遗传资源优势种群,有利于加快茶卡羊等的分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107475400B
公开(公告)日:2020-03-06
申请号:CN201710802522.7
申请日:2017-09-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种MYLK4基因辅助检测牛生长性状的方法及其专用试剂盒。以黄牛基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增获得黄牛MYLK4基因;PCR产物经限制性内切酶HhaI消化后,进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛MYLK4基因第61595位的单核苷酸多态性。本发明所阐述的方法能够检测黄牛MYLK4基因的单核苷酸多态性,可作为与牛生长性状密切相关分子遗传标记,用于牛的辅助选择和分子育种,加快良种牛繁育速度。
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公开(公告)号:CN106755422B
公开(公告)日:2020-02-14
申请号:CN201611219653.4
申请日:2016-12-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种与黄牛生长性状相关的MEG3基因SNP的检测方法及其应用,根据黄牛MEG3基因外显子区单核苷酸突变位点所在位置,采用PCR‑RFLP、Tetra‑primer ARMS‑PCR技术对黄牛个体进行分型,分型结果与生长数据关联分析。本发明提供的检测方法是在DNA水平上检测与黄牛生产性状密切相关的SNP标记,可用于中国黄牛品种生长性状标记辅助选择中,加快建立优良黄牛种群。
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公开(公告)号:CN110760597A
公开(公告)日:2020-02-07
申请号:CN201911159100.8
申请日:2019-11-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛NCSTN基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以云岭牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛NCSTN基因的拷贝数变异区域部分片段,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛BTF3基因部分片段作为内参对照,最后利用-ΔΔCt计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立云岭牛NCSTN基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN106636429B
公开(公告)日:2019-12-13
申请号:CN201710051013.5
申请日:2017-01-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/686 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ADNCR基因单核苷酸多态性的四引物扩增受阻突变体系PCR检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板,通过四引物扩增受阻突变体系PCR扩增长链非编码RNA ADNCR基因片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定长链非编码RNA ADNCR基因在g.1263T>A位点存在不同的基因型。结果发现,长链非编码RNA ADNCR基因g.1263T>A的单核苷酸不同类型与秦川牛的坐骨端宽性状之间存在显著相关,提示长链非编码RNA ADNCR基因单核苷酸多态不同类型可作为提高黄牛生长发育性状的DNA标记,有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN107119117B
公开(公告)日:2019-10-29
申请号:CN201710284523.7
申请日:2017-04-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛GBP2基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以秦川牛的血液全基因组DNA为模板,利用两对特异引物GBP2‑CNV1和GBP2‑CNV2分别扩增牛GBP2基因的两个拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增秦川牛BTF3基因作为对照,然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在秦川牛GBP2基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN108893545A
公开(公告)日:2018-11-27
申请号:CN201810736273.0
申请日:2018-07-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/683
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛ACTL8基因SNP的RFLP方法,包括以下步骤:该方法是以黄牛全基因组DNA为模板,利用1对PCR引物,在PCR条件下进行扩增,然后利用限制性内切酶消化PCR扩增产物,再对酶切后的产物进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳对其进行片段大小分离,从而确定其SNP。本发明是一种在DNA水平上筛检与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,可用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,该方法操作简单、快速,成本低,而且检测的精确度高,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN108841969A
公开(公告)日:2018-11-20
申请号:CN201810770060.X
申请日:2018-07-13
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686
Abstract: 本发明提供一种检测黄牛MSRB3基因插入/缺失标记的方法:以待检黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2、P3和P4为引物,分别PCR扩增黄牛个体MSRB3基因部分片段,通过电泳检测PCR扩增产物,根据电泳检测结果分别判定黄牛个体MSRB3基因上四个插入/缺失突变位点的基因型;本发明根据检测到的MSRB3基因indel突变位点NC_007303.6g.48797975-48798004del、g.48816764ins、g.48896073-48896094del、g.48903091ins的基因型,可应用于黄牛的分子标记辅助选择中,从而加快生长性状优良的地方黄牛种群的建立。
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