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公开(公告)号:CN109943647B
公开(公告)日:2022-08-16
申请号:CN201910354837.9
申请日:2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛MLLT10基因CNV标记的方法及其应用,基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛基因组DNA为模板,利用特异性PCR引物扩增黄牛MLLT10基因拷贝数变异区,并扩增黄牛BTF3基因部分片段作为内参,最后利用2‑ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立黄牛MLLT10基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,检测方法简单、快速,可用于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110029156B
公开(公告)日:2022-07-29
申请号:CN201910379421.2
申请日:2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KAT6A基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊KAT6A基因拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参,利用2–ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数,通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记,可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择,以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号:CN110964838B
公开(公告)日:2022-07-22
申请号:CN202010006026.2
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速检测绵羊LRRFIP1基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以绵羊血样全基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩增绵羊LRRFIP1基因的拷贝数变异区域的部分片段,利用另外一对特异性引物扩增绵羊ANKRD1基因部分片段作为对照,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,基于绵羊LRRFIP1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立茶卡羊等地方绵羊品种的遗传资源优势种群,有利于加快茶卡羊等的分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110904247B
公开(公告)日:2022-05-31
申请号:CN201911385215.9
申请日:2019-12-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法及其应用。该方法是通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳鉴定山羊Sox9基因中的一个InDel位点的多态性,根据对InDel位点与山羊生长性状进行的关联性分析,发现该Sox9基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊胸围之间存在显著相关,提示所述InDel位点的基因型可作为提高山羊胸围的DNA标记,本发明的检测方法可以在山羊生长性状的标记辅助选择育种中应用,快速建立优良的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN108441566B
公开(公告)日:2021-06-29
申请号:CN201810301992.X
申请日:2018-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊ATBF1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过PCR技术扩增山羊ATBF1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊ATBF1基因indel位点多态性。相关分析结果揭示,ATBF1基因的indel位点的不同基因型与陕北白绒山羊、关中奶山羊和海南黑山羊的体高、胸围存在显著相关,揭示ATBF1基因indel位点的基因型可作为提高山羊体高和胸围性状的DNA标记。本发明可应用在山羊标记辅助选择育种中,有利于快速建立优良体尺性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112941203A
公开(公告)日:2021-06-11
申请号:CN202110304073.X
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛ITGβ5基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增牛ITGβ5基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,ITGβ5基因13‑bpInDel多态性位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN112831576A
公开(公告)日:2021-05-25
申请号:CN202110343708.7
申请日:2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor: 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 刘贤 , 柴亚楠 , 李克丽 , 牛梦晓 , 乔小玉 , 郑中华 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛DYNC1I2基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及专用试剂盒,以牛血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR技术,用两对引物P1、P2分别对牛DYNC1I2基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增,根据2*2‑ΔΔCt确定个体DYNC1I2基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据DYNC1I2基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果,本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记,可用于牛生长性状的标记辅助选择,加速良种选育进程。
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公开(公告)号:CN112795667A
公开(公告)日:2021-05-14
申请号:CN202110302857.9
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种牛FRAS1基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增牛FRAS1基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体FRAS1基因15‑bp缺失突变位点的基因型。根据性状关联分析结果,FRAS1基因15‑bp缺失突变位点的基因型与母牛繁殖性状显著相关。因此,FRAS1基因15‑bp缺失突变位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN106947826B
公开(公告)日:2020-06-30
申请号:CN201710289845.0
申请日:2017-04-27
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SERPINA3基因单核苷酸多态性的方法及其应用,以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,PCR扩增黄牛SERPINA3基因部分片段;利用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物片段大小;用限制性内切酶BstXI酶切PCR扩增片段之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SERPINA3基因第648位的单核苷酸多态性位点的基因型;本发明提供的检测方法可用于夏南牛等中国地方黄牛品种肉用生长性状的分子标记辅助选择,进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN107619857B
公开(公告)日:2020-06-16
申请号:CN201711003896.9
申请日:2017-10-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用:以肉牛品种郏县牛的血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增其KLF8基因CNV区域和内参基因BTF3,根据2*log2 2‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型,鉴定其KLF8基因的拷贝数变异。与郏县牛生产数据的关联分析显示,KLF8不同拷贝数对郏县牛的生长发育有显著影响,其中缺失型个体的胸宽显著高于插入型和正常型个体。本发明在DNA水平上检测与肉牛生产性状密切相关的CNV,可作为肉牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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