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公开(公告)号:CN100532571C
公开(公告)日:2009-08-26
申请号:CN200710017973.6
申请日:2007-06-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测山羊催乳素(PRL)基因单核苷酸多态性(SNP)的PCR-RFLP(聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性)方法,该方法是以山羊基因组DNA或包含PRL基因的DNA序列为模板,在TaqDNA聚合酶、Buffer(缓冲环境)、Mg++、dNTPs存在的情况下,利用1对PCR(聚合酶链式反应)引物,在PCR条件下进行扩增,然后利用限制性内切酶对其进行酶切,再根据琼脂糖凝胶电泳对其进行片段大小分离,利用凝胶成像系统分析其片段大小,从而确定其单核苷酸多态性。该方法操作简单、快速,成本低,而且检测的精确度高,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN116200472B
公开(公告)日:2024-09-03
申请号:CN202310357348.5
申请日:2023-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛SCN9A基因InDel标记在肉质性状早期选择中的应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR及琼脂糖凝胶电泳,准确鉴定SCN9A基因11‑bp缺失突变位点的基因型,关联分析结果揭示SCN9A基因11‑bp缺失突变位点的不同基因型与牛肉质性状显著相关,并存在作为筛选肉牛肉质性状的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与牛肉质性状密切相关的InDel标记,可快速建立牛优势遗传资源群体,从而加快牛肉质性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN117417993A
公开(公告)日:2024-01-19
申请号:CN202311482765.9
申请日:2023-11-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种绵羊E2F8基因插入/缺失标记的繁殖性状早期选择的应用。以澳洲白绵羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增E2F8基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定E2F8基因32‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。关联分析结果表明,所鉴定的E2F8基因的32‑bp插入/缺失多态性位点的不同基因型与澳洲白绵羊的产羔数差异显著相关,并存在提高绵羊产羔数性状的DNA标记,可用于快速建立优良绵羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN117363756A
公开(公告)日:2024-01-09
申请号:CN202311591064.9
申请日:2023-11-27
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开一种山羊C3H1orf226基因插入或缺失(InDel)标记的繁殖性状早期选择的应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊C3H1orf226基因NC_030810.1:g.112753708‑112753709位插入或缺失(InDel)多态性位点的基因型。本发明能够简单、快速、低成本、精确地检测所述插入或缺失多态性位点的基因型,检测的插入或缺失(InDel)多态性位点能够作为山羊产羔数的分子标记位点,从而加快建立产羔数性状优良的山羊种群,提高良种选育速度。
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公开(公告)号:CN111676273B
公开(公告)日:2023-08-11
申请号:CN202010599560.9
申请日:2020-06-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种检测牛成肌细胞HMGA2基因增强子的方法。根据染色质开放性高通量测序数据分析和序列保守性,并结合双荧光素酶载体报告系统,筛选具备增强子活性的牛HMGA2基因序列片段,根据Hi‑C数据分析确定筛选片段中与HMGA2基因启动子产生远距互作的序列,利用CRISPRi系统和实时荧光定量PCR技术验证序列片段功能。本发明从分子和细胞两个水平鉴定出可以促进牛成肌细胞HMGA2基因表达的增强子,可以用于肉牛的基因编辑和转基因育种,从而加快优良肉牛群体选育进程。
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公开(公告)号:CN112980969B
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN110093425B
公开(公告)日:2022-08-19
申请号:CN201910355325.4
申请日:2019-04-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以小尾寒羊耳组织全基因组DNA为模板,扩增小尾寒羊ORMDL1基因的拷贝数变异区域,并以扩增小尾寒羊ANKRD1基因片段作为内参,然后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,本发明提供的检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法为建立小尾寒羊ORMDL1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,以用于加快小尾寒羊品种改良的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110029156B
公开(公告)日:2022-07-29
申请号:CN201910379421.2
申请日:2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KAT6A基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊KAT6A基因拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参,利用2–ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数,通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记,可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择,以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号:CN110904247B
公开(公告)日:2022-05-31
申请号:CN201911385215.9
申请日:2019-12-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法及其应用。该方法是通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳鉴定山羊Sox9基因中的一个InDel位点的多态性,根据对InDel位点与山羊生长性状进行的关联性分析,发现该Sox9基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊胸围之间存在显著相关,提示所述InDel位点的基因型可作为提高山羊胸围的DNA标记,本发明的检测方法可以在山羊生长性状的标记辅助选择育种中应用,快速建立优良的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN108441566B
公开(公告)日:2021-06-29
申请号:CN201810301992.X
申请日:2018-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊ATBF1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过PCR技术扩增山羊ATBF1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊ATBF1基因indel位点多态性。相关分析结果揭示,ATBF1基因的indel位点的不同基因型与陕北白绒山羊、关中奶山羊和海南黑山羊的体高、胸围存在显著相关,揭示ATBF1基因indel位点的基因型可作为提高山羊体高和胸围性状的DNA标记。本发明可应用在山羊标记辅助选择育种中,有利于快速建立优良体尺性状的山羊遗传资源群体。
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