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公开(公告)号:CN105256003A
公开(公告)日:2016-01-20
申请号:CN201510582998.5
申请日:2015-09-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2525/101 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明公开了一种基于酸敏感修饰核苷酸的DNA测序方法;所述方法包括:用式(I)所示的酸敏感修饰核苷酸为可逆终止剂,参与DNA链延伸反应以及对所述酸敏感修饰核苷酸中的酸敏感连接单元进行断裂;(I);其中,所述荧光素选自:BODIPY、罗丹明、香豆素、咕吨、花青、芘、酞菁、Alexa、squaring染料、产生能量转移染料,或其组合;所述Base表示选自如下碱基:U、T、C、A、G。与现有技术相比,本发明提供一种准确性高,特别是在模板为连续多个相同碱基时能够具有较高的延伸效率和剪切效率的延伸方法。
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公开(公告)号:CN103087131B
公开(公告)日:2015-07-08
申请号:CN201310015235.3
申请日:2013-01-15
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种可逆终端及其合成和在DNA合成测序中的用途。所述可逆终端的结构式如式(I)所示:其中R1为荧光素,R2为连接单元。本发明的可裂解该可逆终端可用于DNA合成测序;同时,本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用,并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求,具备较好的实用前景。
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公开(公告)号:CN102838751B
公开(公告)日:2014-12-10
申请号:CN201210311659.X
申请日:2012-08-29
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于分子胶的两亲性嵌段共聚物自组装胶束及其用途。所述共聚物结构式如下:其中,n为2~225中的任意一个整数,m为0~135中的任意一个整数。将该两亲性嵌段共聚物在水性溶液中自组装即得两亲性嵌段共聚物胶束。该胶束作为药物载体,可用于包裹疏水性药物。本发明采用有机合成的方法在聚合物PEG(聚乙二醇),PLA(聚乳酸)大分子中分别引入具有氢键序列特异性的分子胶单链,从而通过形成分子胶双链可选择性的高效合成一系列两亲性嵌段共聚物,合成所需原料简单易得,合成过程均为常规反应,适合较大规模生产。
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公开(公告)号:CN103012771B
公开(公告)日:2014-10-15
申请号:CN201210442960.4
申请日:2012-11-07
IPC: C08G65/48 , C08G81/00 , C07D309/10 , C07D307/20 , A61K47/34 , A61P35/00
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感可裂解连接单元及其用途。所述可裂解连接单元的结构式为:其中,m为1或2,n为0~44中的任一整数,X为Br、NH2、N3或OH,Y为Br、NH2、N3或OH。该类连接单元在酸性条件下可以实现有效裂解;并可与亲水性化合物、疏水性化合物实现高效率连接,得到两亲性嵌段共聚物;该嵌段共聚物自组装胶束可作为药物运输载体。与现有技术相比,合成本发明化合物所需的原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,反应条件温和,易于大量合成。
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公开(公告)号:CN102977358B
公开(公告)日:2014-10-15
申请号:CN201210442360.8
申请日:2012-11-07
IPC: C08G65/48 , C08G63/78 , C08G63/688 , C08G63/08 , C08G81/00 , C07D249/04 , C07C323/52 , C07C319/20
Abstract: 本发明公开了一种具有氢键序列特异性组合的模块化合物及其制备方法。所述模块化合物的结构式如下:其中,当R为(m为1~200中任一整数)时,该模块化合物为亲水模块化合物P2;当R为(n为2~140中任一整数)时,该模块化合物对应为疏水模块化合物BLOCK-1、BLOCK-2或BLOCK-3。本发明的模块化合物由于具有氢键序列特异性而且两种互补的单链可以相互特异性地识别、配对从而形成分子胶,所以利用分子胶集团可以方便地制备用其它方法不容易合成的嵌段共聚物。
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公开(公告)号:CN104031268A
公开(公告)日:2014-09-10
申请号:CN201410196559.6
申请日:2014-05-09
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种聚乙烯亚胺三嵌段共聚物及其在基因载体中的用途;所述共聚物PEI-PLA-PEG的结构式如下所示:其中,PEG的分子量为2000~10000g/mol中的任意一个整数,PLA的分子量为3000~10000g/mol,PEI的分子量为1800~10000g/mol。该嵌段共聚物可以自组装成纳米胶束作为基因载体应用于基因药物输送体系,在负载基因药物的同时还可以包裹疏水小分子药物,从而成为基因/疏水药物的双重载体。
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公开(公告)号:CN103044298B
公开(公告)日:2014-06-18
申请号:CN201210545392.0
申请日:2011-01-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C323/60 , C07C319/20 , C07D249/04 , C08G65/00
Abstract: 本发明公开了一种疏水性模块化合物及其制备方法。其结构式为以下两种中的任意一种:其中,R为-SCPh3或-SH,m为2~8中任一整数,n为2~9中任一整数。本发明制得的疏水性模块化合物M1-1或M1-2在温和、简单的条件下就可以和亲水性模块通过同时形成两个二硫键与两个氢键的形式生成双亲性嵌段共聚物,且生成的嵌段共聚物稳定、易于纯化,可以在溶液中自组装为可以装载药物的纳米胶束。
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公开(公告)号:CN102516208B
公开(公告)日:2014-06-18
申请号:CN201110331659.1
申请日:2011-10-27
Applicant: 上海交通大学 , 华东理工大学 , 深圳华因康基因科技有限公司
IPC: C07D307/20 , C07D309/10 , C08G65/00 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种可裂解连接单元及其合成方法与用途。可裂解连接单元的结构式为:,其中,n为1或2,m为0~20中的任意一个整数,k为1~20中的任意一个整数。该可裂解连接单元可用于DNA合成测序。与现有技术相比,本发明的化合物合成原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,易于实现大量合成;该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接;通过研究该类化合物的裂解性能,发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的完全裂解,可应用于DNA测序。
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公开(公告)号:CN103709410A
公开(公告)日:2014-04-09
申请号:CN201310643667.9
申请日:2013-12-03
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感两亲性嵌段共聚物及其自组织胶束、用途;其结构式为式(I)所示:其中,n为1~300中的任意一个整数,m为1~100中的任意一个整数,R为式(II)、(III)、(IV)、(V)或(VI)所示的结构:其中,t=1或2。本发明化合物合成原料简单易得,合成过程均为常规反应,反应条件温和,可以大量制备;由该类嵌段共聚物自组装而成的胶束可用于药物运输载体。
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公开(公告)号:CN103484106A
公开(公告)日:2014-01-01
申请号:CN201310401580.0
申请日:2013-09-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种四色荧光标记可逆终端及其在DNA测序中的用途;所述可逆终端的结构式如式(I)所示:(I);其中,R1为三磷酸盐;R2为H或者OH;碱基为U,C,A,G或其衍生物;连接单元为在温和条件下可以断裂的双官能团化合物;荧光基团选自BODIPY、荧光素、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的可逆终端可用于DNA单分子测序;同时,本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用,并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求,具备很好的实用前景。
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