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公开(公告)号：CN102675262B
公开(公告)日：2016-01-13
申请号：CN201210132695.X
申请日：2012-04-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07D307/20 , C08G65/48 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了四氢呋喃醚衍生物可裂解连接单元及其用途；本发明的可裂解连接单元，结构式如下式所示：，其中，n为0～44中的任意一个整数。本发明的四氢呋喃环衍生物中，无论是顺式、反式或二者的混合物都可用于测序，并具有相同的作用；该类化合物合成原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，易于实现大量合成；该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接；通过研究该类化合物的裂解性能，发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的裂解，具有应用于DNA测序的价值。
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公开(公告)号：CN103539697A
公开(公告)日：2014-01-29
申请号：CN201310462509.3
申请日：2013-09-30
IPC: C07C245/08 , C07H19/10 , C07H1/00 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种还原敏感偶氮连接单元的合成及其在DNA测序中的用途；该还原敏感偶氮连接单元结构式如下：其中m为0～44中任一整数，n为0～44中任一整数。该还原敏感偶氮连接单元与核苷酸及荧光素连接得到可逆终端，所述可逆终端用于DNA合成测序。与现有技术相比，本发明合成了一类新的可裂解连接单元，并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端；该类可逆终端在温和的条件下可以实现高效率的裂解，可用于DNA合成测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103804447B
公开(公告)日：2016-08-17
申请号：CN201410055242.0
申请日：2014-02-18
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/167 , C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00 , C07H1/04 , C09K11/06 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种氮杂化鸟嘌呤核苷及其合成方法和在DNA测序中的用途；所述合成方法包括如下步骤：式(Ⅲ)化合物在碱性条件下去保护基得式(Ⅱ)化合物；进一步去甲基得式(Ⅰ)化合物，即7?去氮?7?卤素?8?氮?鸟嘌呤核苷；其中，R1为H或OH，R2为I、Br或Cl，R3为H或本发明的氮杂化鸟嘌呤核苷是用于DNA测序的新型试剂，与8位未取代氮的鸟嘌呤核苷相比，具有更好的碱基识别效果、更稳定的DNA链结构。同时，现有技术中8位氮取代鸟嘌呤核苷的合成方法复杂，产率低，尚未商业化生产，而本发明的合成方法所需原料简单易得，采用常规化学合成反应，且收率较高，适用于广泛推广使用。
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公开(公告)号：CN103601779B
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201310489397.0
申请日：2013-10-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括将下式(V)化合物在碱性条件下去甲基得到下式(I)化合物，即所述7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷；(I)，(V)，其中R2为I、Br或Cl。本发明合成的7-去氮-7-碘-2’-脱氧鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂；而本发明提供的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN103484106B
公开(公告)日：2015-08-19
申请号：CN201310401580.0
申请日：2013-09-05
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种四色荧光标记可逆终端及其在DNA测序中的用途；所述可逆终端的结构式如式(I)所示：(I)；其中，R1为三磷酸盐；R2为H或者OH；碱基为U，C，A，G或其衍生物；连接单元为在温和条件下可以断裂的双官能团化合物；荧光基团选自BODIPY、荧光素、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的可逆终端可用于DNA单分子测序；同时，本发明的可逆终端的合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应要求，具备很好的实用前景。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN104292117A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201410186697.6
申请日：2014-05-05
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C217/08 , C07C217/12 , C07C217/10 , C07C213/02 , C07H19/10 , C07H19/14 , C07H1/00 , C08G65/48 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种酸敏感连接单元的合成及其在DNA测序中的用途。该酸敏感连接单元，结构式为：其中R为NH2或N3，m为0～44中任一整数，n为0～44中任一整数；R1，R2均为脂肪族烷基，或R1，R2均为芳香族衍生物，或R1为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R2为脂肪族烷基或氢；或R2为苯基、萘基、苯基的衍生物、或萘基的衍生物，R1为脂肪族烷基或氢，或R1、R2构成环己基、环戊基或环丁基。该酸敏感连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。该类可逆终端可用于DNA测序；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN102977358A
公开(公告)日：2013-03-20
申请号：CN201210442360.8
申请日：2012-11-07
IPC: C08G65/48 , C08G63/78 , C08G63/688 , C08G63/08 , C08G81/00 , C07D249/04 , C07C323/52 , C07C319/20
Abstract: 本发明公开了一种具有氢键序列特异性组合的模块化合物及其制备方法。所述模块化合物的结构式如下：其中，当R为（m为1～200中任一整数）时，该模块化合物为亲水模块化合物P2；当R为（n为2～140中任一整数）时，该模块化合物对应为疏水模块化合物BLOCK-1、BLOCK-2或BLOCK-3。本发明的模块化合物由于具有氢键序列特异性而且两种互补的单链可以相互特异性地识别、配对从而形成分子胶，所以利用分子胶集团可以方便地制备用其它方法不容易合成的嵌段共聚物。
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公开(公告)号：CN105906544B
公开(公告)日：2018-11-16
申请号：CN201610237008.9
申请日：2016-04-15
IPC: C07D209/38 , C07B53/00
Abstract: 本发明公开了一种S型3‑羟基‑3‑炔基氧化吲哚类化合物，其结构通式如（I）所示，R1为吸电子基团；R2为氢原子、C1‑4烷基、苯基、苄基及其衍生物或萘基；R3为苯基及其衍生物、萘基、环己烯基、噻吩、吡啶或呋喃；本发明还公开了该化合物的合成方法以及该化合物作为原料在有机合成中的应用。本发明的结构通式（I）所示的S型3‑羟基‑3‑炔基氧化吲哚类化合物具有结构新颖，合成方法具有原料廉价易得、反应条件温和、操作简单、原子经济性好、对映选择性高等优点，因而具有较大的应用前景和社会经济效益。
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公开(公告)号：CN105906544A
公开(公告)日：2016-08-31
申请号：CN201610237008.9
申请日：2016-04-15
IPC: C07D209/38 , C07B53/00
CPC classification number: C07D209/38 , C07B53/00 , C07B2200/07
Abstract: 本发明公开了一种S型3?羟基?3?炔基氧化吲哚类化合物，其结构通式如（I）所示，R1为吸电子基团；R2为氢原子、C1?4烷基、苯基、苄基及其衍生物或萘基；R3为苯基及其衍生物、萘基、环己烯基、噻吩、吡啶或呋喃；本发明还公开了该化合物的合成方法以及该化合物作为原料在有机合成中的应用。本发明的结构通式（I）所示的S型3?羟基?3?炔基氧化吲哚类化合物具有结构新颖，合成方法具有原料廉价易得、反应条件温和、操作简单、原子经济性好、对映选择性高等优点，因而具有较大的应用前景和社会经济效益。
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公开(公告)号：CN103601778A
公开(公告)日：2014-02-26
申请号：CN201310489350.4
申请日：2013-10-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/167 , C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00 , C07H1/04 , C07H19/23
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-7-取代鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括如下步骤：式(III)化合物在碱性条件下去保护基得式(IV1)或(IV2)化合物；进一步去甲基得式(I)化合物，即所述7-去氮-7-取代鸟嘌呤核苷；其中，R1为H或OH，R2为I、Br或C1，R3为H或OBz。本发明合成的7-去氮-7-取代-鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂，难以控制；而本发明的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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