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公开(公告)号:CN103804447B
公开(公告)日:2016-08-17
申请号:CN201410055242.0
申请日:2014-02-18
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/167 , C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00 , C07H1/04 , C09K11/06 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种氮杂化鸟嘌呤核苷及其合成方法和在DNA测序中的用途;所述合成方法包括如下步骤:式(Ⅲ)化合物在碱性条件下去保护基得式(Ⅱ)化合物;进一步去甲基得式(Ⅰ)化合物,即7?去氮?7?卤素?8?氮?鸟嘌呤核苷;其中,R1为H或OH,R2为I、Br或Cl,R3为H或本发明的氮杂化鸟嘌呤核苷是用于DNA测序的新型试剂,与8位未取代氮的鸟嘌呤核苷相比,具有更好的碱基识别效果、更稳定的DNA链结构。同时,现有技术中8位氮取代鸟嘌呤核苷的合成方法复杂,产率低,尚未商业化生产,而本发明的合成方法所需原料简单易得,采用常规化学合成反应,且收率较高,适用于广泛推广使用。
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公开(公告)号:CN105131064B
公开(公告)日:2018-04-20
申请号:CN201510401611.1
申请日:2015-07-09
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/10 , C07H1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种基于四氢呋喃修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途。本发明的四氢呋喃修饰核苷酸,结构式如式I所示:该类化合物合成原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,易于实现大量合成;且该类化合物在DNA聚合酶作用下,可参与DNA链延伸反应,并且在模板为多个相同碱基时,一次只能延伸一个,延伸效率几乎100%。在酸性条件下,连接单元可以完全断裂将标记的荧光素切掉,下一轮延伸反应同样可以几乎100%效率进行,具有应用于DNA测序的价值。
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公开(公告)号:CN105131064A
公开(公告)日:2015-12-09
申请号:CN201510401611.1
申请日:2015-07-09
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种基于四氢呋喃修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途。本发明的四氢呋喃修饰核苷酸,结构式如式I所示:该类化合物合成原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,易于实现大量合成;且该类化合物在DNA聚合酶作用下,可参与DNA链延伸反应,并且在模板为多个相同碱基时,一次只能延伸一个,延伸效率几乎100%。在酸性条件下,连接单元可以完全断裂将标记的荧光素切掉,下一轮延伸反应同样可以几乎100%效率进行,具有应用于DNA测序的价值。
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公开(公告)号:CN104693258A
公开(公告)日:2015-06-10
申请号:CN201410692943.5
申请日:2014-11-26
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C07H19/10 , C07H1/00 , C09K11/06 , C09K2211/1022 , C09K2211/1081 , C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种基于分子胶的荧光标记核苷酸及其在DNA测序中的用途;所述荧光标记核苷酸的结构式如式(Ⅰ)所示:,其中,R1为或R2为荧光素或dNTP为含四个不同的碱基的核苷三磷酸;荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的荧光标记核苷酸可用于DNA测序;同时,本发明荧光标记核苷酸的合成所需原料简单易得,可用于大规模推广使用,并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应所有要求,具备很好的实用前景。
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公开(公告)号:CN103804447A
公开(公告)日:2014-05-21
申请号:CN201410055242.0
申请日:2014-02-18
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/167 , C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00 , C07H1/04 , C09K11/06 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种氮杂化鸟嘌呤核苷及其合成方法和在DNA测序中的用途;所述合成方法包括如下步骤:式(Ⅲ)化合物在碱性条件下去保护基得式(Ⅱ)化合物;进一步去甲基得式(Ⅰ)化合物,即7-去氮-7-卤素-8-氮-鸟嘌呤核苷;其中,R1为H或OH,R2为I、Br或Cl,R3为H或本发明的氮杂化鸟嘌呤核苷是用于DNA测序的新型试剂,与8位未取代氮的鸟嘌呤核苷相比,具有更好的碱基识别效果、更稳定的DNA链结构。同时,现有技术中8位氮取代鸟嘌呤核苷的合成方法复杂,产率低,尚未商业化生产,而本发明的合成方法所需原料简单易得,采用常规化学合成反应,且收率较高,适用于广泛推广使用。
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公开(公告)号:CN104693258B
公开(公告)日:2017-12-08
申请号:CN201410692943.5
申请日:2014-11-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于分子胶的荧光标记核苷酸及其在DNA测序中的用途;所述荧光标记核苷酸的结构式如式(Ⅰ)所示:,其中,R1为或R2为荧光素或dNTP为含四个不同的碱基的核苷三磷酸;荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的荧光标记核苷酸可用于DNA测序;同时,本发明荧光标记核苷酸的合成所需原料简单易得,可用于大规模推广使用,并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应所有要求,具备很好的实用前景。
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