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公开(公告)号：CN105085591B
公开(公告)日：2018-02-09
申请号：CN201510388164.0
申请日：2015-07-03
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种荧光标记偶氮修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途；其结构式如式I所示：其中，R1、R2、R3、R4、R5、R6不同时为H；m，n为0～10的整数。与现有技术相比，本发明合成了一类新的基于偶氮连接单元的可逆终端；用变性PAGE胶即测序胶证明，该类可逆终端在模板为连续多个相同碱基时，一次只能延伸一个可逆终端，且延伸效率为100％，在还原剂作用下，可实现高效快递完全剪切，具有应用于DNA测序的巨大潜力和价值；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN104693258B
公开(公告)日：2017-12-08
申请号：CN201410692943.5
申请日：2014-11-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于分子胶的荧光标记核苷酸及其在DNA测序中的用途；所述荧光标记核苷酸的结构式如式(Ⅰ)所示：，其中，R1为或R2为荧光素或dNTP为含四个不同的碱基的核苷三磷酸；荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的荧光标记核苷酸可用于DNA测序；同时，本发明荧光标记核苷酸的合成所需原料简单易得，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应所有要求，具备很好的实用前景。
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公开(公告)号：CN105085591A
公开(公告)日：2015-11-25
申请号：CN201510388164.0
申请日：2015-07-03
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种荧光标记偶氮修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途；其结构式如式I所示：，其中，R1、R2、R3、R4、R5、R6不同时为H；m，n为0～10的整数。与现有技术相比，本发明合成了一类新的基于偶氮连接单元的可逆终端；用变性PAGE胶即测序胶证明，该类可逆终端在模板为连续多个相同碱基时，一次只能延伸一个可逆终端，且延伸效率为100％，在还原剂作用下，可实现高效快递完全剪切，具有应用于DNA测序的巨大潜力和价值；同时，其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN108192957B
公开(公告)日：2021-11-23
申请号：CN201711279201.X
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/36 , C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成测序方法和测序系统，所述方法包括：通过水溶性双功能连接单元将引物P1连接于基体表面；在基体表面加入含待测DNA模板的溶液，然后进行等温表面放大反应；再将引物Pe加入基体表面，然后在基体表面加入四种碱基的荧光标记可逆终止剂的延伸反应溶液，进行延伸反应；然后对延伸后的DNA双链进行成像之后，加入相应的化学试剂，使荧光标记可逆终止剂的连接单元断裂。重复DNA链延伸和断裂步骤，完成多次循环测序，即得待测DNA模板核苷酸的碱基序列。本发明测序方法可用于DNA高通量合成测序，在所述测序条件下实验结果其读长至少为73碱基；如果双端测序，其读长至少为146，准确率至少为99.98％。
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公开(公告)号：CN108424844B
公开(公告)日：2020-07-28
申请号：CN201810307850.4
申请日：2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种单分子测序芯片及其制备方法，所述芯片包括流道板、基板和盖板，所述流道板设置在基板和盖板之间；所述流道板上设置流通池，所述流通池包括多个平行设置的流道；所述流通池的上方设置盖板、流通池的下方设置基板；所述流道的底部与基板表面连通；与流道板接触的所述基板的表面固定测序引物和定位用荧光标记物。该芯片表面负载有荧光寿命长、荧光强度高，荧光性能稳定的量子点或荧光微球，可以在测序过程中对目标DNA单分子进行定位。由于量子点或荧光微球在经过很多次的激发光照后仍然能够保持较高的荧光强度，解决了定位荧光信号无法长时间保持的问题，显著提高单分子测序读长，降低测序的错误率，并有效降低测序成本。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105256003A
公开(公告)日：2016-01-20
申请号：CN201510582998.5
申请日：2015-09-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2525/101 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明公开了一种基于酸敏感修饰核苷酸的DNA测序方法；所述方法包括：用式(I)所示的酸敏感修饰核苷酸为可逆终止剂，参与DNA链延伸反应以及对所述酸敏感修饰核苷酸中的酸敏感连接单元进行断裂；(I)；其中，所述荧光素选自：BODIPY、罗丹明、香豆素、咕吨、花青、芘、酞菁、Alexa、squaring染料、产生能量转移染料，或其组合；所述Base表示选自如下碱基：U、T、C、A、G。与现有技术相比，本发明提供一种准确性高，特别是在模板为连续多个相同碱基时能够具有较高的延伸效率和剪切效率的延伸方法。
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公开(公告)号：CN103224654B
公开(公告)日：2015-07-08
申请号：CN201310158981.8
申请日：2013-05-02
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种硫化银量子点-壳聚糖纳米复合物的制备方法，在室温下将一定量的壳聚糖或其衍生物溶于去离子水中，制得浓度为1-20mg/mL的壳聚糖或壳聚糖衍生物水溶液；在室温搅拌条件下向壳聚糖或壳聚糖衍生物水溶液中依次加入螯合剂和水溶性银盐，搅拌反应5-20分钟；在步骤(2)得到的产物中加入碱金属硫化物和羧基化合物，搅拌反应5-20小时；将反应产物用水透析、离心，相继用无水甲醇和乙醚洗涤，在室温下真空干燥得到硫化银量子点-壳聚糖纳米复合物。与现有技术相比，本发明采用简单易行的方法制备了一种具有近红外荧光成像功能的纳米复合物，可用于生物荧光成像或作为荧光探针，生物相容性好，无生理毒性，在生物医药领域有着广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN102516606A
公开(公告)日：2012-06-27
申请号：CN201110383271.6
申请日：2011-11-25
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一氧化氮供体-量子点复合物及其制备方法，先将具有一定脱乙酰度的壳聚糖或壳聚糖衍生物溶于水中，然后在室温搅拌条件下向壳聚糖或壳聚糖衍生物水溶液中依次加入适当的金属盐水溶液和硫族化合物溶液，经过加热回流、透析和蒸发干燥得到壳聚糖或壳聚糖衍生物与量子点的复合物，再与一氧化氮在加压条件下反应制得一氧化氮供体。与现有技术相比，本发明复合物以壳聚糖为释放一氧化氮的载体，以量子点为探测一氧化氮释放的荧光探针，在生理环境下能够稳定地释放一氧化氮，并且具备对一氧化氮释放的探测功能，生物相容性好，无生理毒性，在高血压、心脏病、呼吸道疾病、性功能障碍等的诊断和治疗方面有着广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN106083676B
公开(公告)日：2019-01-11
申请号：CN201610402708.9
申请日：2016-06-07
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C323/52 , C07C323/25 , C07H19/10 , C07H19/14 , C07H1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开一种硫代缩酮连接单元及其合成方法、用途；所述硫代缩酮连接单元的结构如式(Ⅰ)所示:其中，R＝‑OH或者‑COOH；R1与R2的满足如下条件中的一种：(1)R1＝R2＝甲基；或，(2)R1＝苯基、对甲氧基苯基、2,4,6‑三甲氧基苯基、萘基或对甲氧基萘基，R2＝H；或，(3)R1、R2共同构成环己基或环戊基。该单元与核苷酸及荧光素连接得到的荧光素标记核苷酸可用于DNA测序。与现有技术相比，本发明连接单元的可逆终止剂用于DNA测序时，其延伸效率接近100％，并且在模板为连续多个相同碱基时，一次只延伸一个可逆终止剂；其合成所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN108192957A
公开(公告)日：2018-06-22
申请号：CN201711279201.X
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/36 , C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成测序方法和测序系统，所述方法包括：通过水溶性双功能连接单元将引物P1连接于基体表面；在基体表面加入含待测DNA模板的溶液，然后进行等温表面放大反应；再将引物Pe加入基体表面，然后在基体表面加入四种碱基的荧光标记可逆终止剂的延伸反应溶液，进行延伸反应；然后对延伸后的DNA双链进行成像之后，加入相应的化学试剂，使荧光标记可逆终止剂的连接单元断裂。重复DNA链延伸和断裂步骤，完成多次循环测序，即得待测DNA模板核苷酸的碱基序列。本发明测序方法可用于DNA高通量合成测序，在所述测序条件下实验结果其读长至少为73碱基；如果双端测序，其读长至少为146，准确率至少为99.98％。
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