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公开(公告)号:CN112941202B
公开(公告)日:2022-06-24
申请号:CN202110304062.1
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛SEPT7基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增牛SEPT7基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体SEPT7基因9‑bp插入突变的基因型。根据性状关联分析结果,SEPT7基因9‑bp插入突变位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,SEPT7基因9‑bp插入突变位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN113005201A
公开(公告)日:2021-06-22
申请号:CN202110315036.9
申请日:2021-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测山羊FecB基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术,以山羊基因组DNA为模板,利用一对特异引物扩山羊FecB基因的拷贝数变异区域部分片段,利用另外一对特异引物扩增山羊MC1R基因部分片段作为参照,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型,根据对拷贝数变异与山羊繁殖性状和生长性状的关联分析结果,本发明提供的方法为利用山羊FecB基因CNV标记建立优势性状种群奠定了基础,有利于加快山羊育种进程。
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公开(公告)号:CN112695102A
公开(公告)日:2021-04-23
申请号:CN202110179632.9
申请日:2021-02-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了山羊PRNT基因单核苷酸多态性在产羔性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,参照山羊PRNT基因CDS区的单核苷酸多态性位点设计引物,通过对扩增片段测序,鉴定PRNT基因单核苷酸多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,PRNT基因突变位点c.71A>G的不同基因型与山羊个体产羔数显著相关,可以用于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN110904247A
公开(公告)日:2020-03-24
申请号:CN201911385215.9
申请日:2019-12-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法及其应用。该方法是通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳鉴定山羊Sox9基因中的一个InDel位点的多态性,根据对InDel位点与山羊生长性状进行的关联性分析,发现该Sox9基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊胸围之间存在显著相关,提示所述InDel位点的基因型可作为提高山羊胸围的DNA标记,本发明的检测方法可以在山羊生长性状的标记辅助选择育种中应用,快速建立优良的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN108192985A
公开(公告)日:2018-06-22
申请号:CN201810186689.X
申请日:2018-03-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CTNNB1基因插入/缺失的检测方法及其应用。该方法是以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增山羊CTNNB1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊CTNNB1基因存在插入/缺失位点多态性。大样本(N>600)相关分析结果揭示,CTNNB1基因插入/缺失的不同类型与陕北白绒山羊第一胎产羔性状之间存在显著相关,提示CTNNB1基因插入/缺失的不同类型可作为提高山羊第一胎产羔性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊CTNNB1基因插入/缺失的方法,可在中国山羊繁殖性状的标记辅助选择育种中应用,有利于快速建立高产羔数性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN107164482A
公开(公告)日:2017-09-15
申请号:CN201710414058.4
申请日:2017-06-05
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种山羊CSN1S1基因插入/缺失的检测方法及其应用。该方法是以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增山羊CSN1S1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊CSN1S1基因存在indel位点多态性。大样本(N>1000)相关分析结果揭示,CSN1S1基因indel的不同类型与陕北白绒山羊第一胎产羔性状之间存在显著相关,提示CSN1S1基因indel的不同类型可作为提高山羊第一胎产羔性状的DNA标记。本发明提供的快速检测山羊CSN1S1基因indel的方法,可在中国山羊繁殖性状的标记辅助选择育种中应用,有利于快速建立高产羔数性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN105779594A
公开(公告)日:2016-07-20
申请号:CN201610171698.2
申请日:2016-03-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种猪Oct4基因插入/缺失的检测方法及其应用。以待测公猪全基因组DNA为模板,以参照猪全基因组设计的引物对P1为引物,通过PCR技术扩增Oct4基因,再进行琼脂糖凝胶电泳。根据电泳结果鉴定Oct4基因在NC_010449:g.2759?2760ins GGTTTTTGTCTA位点存在插入/缺失多态性。结果发现,Oct4基因12?bp插入/缺失的不同类型与15日龄大白猪公猪睾丸重、睾丸长周长和睾丸短周长等繁殖性状之间存在显著相关,提示Oct4基因12?bp插入/缺失的不同类型可作为提高公猪繁殖性状的DNA标记。本发明将有利于快速建立繁殖性状优良的公猪遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN102808018B
公开(公告)日:2014-04-09
申请号:CN201210153944.3
申请日:2012-05-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊PITX2基因单核苷酸多态性的检测方法,该方法以奶山羊基因组DNA或包含奶山羊PITX2基因的DNA序列为模板,利用PCR引物对P为引物,扩增奶山羊PITX2基因;通过限制性内切酶RsaI对其进行酶切,再根据琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行片段大小分离,利用凝胶成像系统分析其片段大小,从而确定奶山羊PITX2基因第543位的SNP。该SNP位点的TT基因型和TC基因型可作为显著提高奶山羊乳脂含量,而同时又显著降低乳糖含量、乳浓度的有效DNA标记。
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公开(公告)号:CN102399819B
公开(公告)日:2013-06-19
申请号:CN201110244070.8
申请日:2011-08-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12N15/861 , C12N15/66
Abstract: 构建含秦川牛NRIP1(nuclear receptor interacting protein 1)基因的重组腺病毒载体,可应用于秦川牛NRIP1基因功能研究、鉴定和对种子细胞进行改造,调控肌肉、脂肪、生殖等组织相关基因的代谢。方法是将秦川牛NRIP1基因插入pAdTrack-CMV腺病毒穿梭质粒的CMV启动子之下,构建重组穿梭质粒pAdTrack-CMV-NRIP1。PmeI线性化后转化含有pAdEasy-1质粒的E.coli BJ5183感受态细胞,利用E.coli BJ5183内Cre重组酶高效的同源重组系统,在细菌中完成pAdTrack-CMV-NRIP1和pAdEasy-1的同源重组。将正确的重组腺病毒质粒命名为pAd-NRIP1。pAd-NRIP1经PacI酶切线性化后,脂质体转染293A细胞产生并获得重组病毒颗粒。
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公开(公告)号:CN101063169A
公开(公告)日:2007-10-31
申请号:CN200710017973.6
申请日:2007-06-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测山羊催乳素(PRL)基因单核苷酸多态性(SNP)的PCR-RFLP(聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性)方法,该方法是以山羊基因组DNA或包含PRL基因的DNA序列为模板,在Taq DNA聚合酶、Buffer(缓冲环境)、Mg++、dNTPs存在的情况下,利用1对PCR(聚合酶链式反应)引物,在PCR条件下进行扩增,然后利用限制性内切酶对其进行酶切,再根据琼脂糖凝胶电泳对其进行片段大小分离,利用凝胶成像系统分析其片段大小,从而确定其单核苷酸多态性。该方法操作简单、快速,成本低,而且检测的精确度高,便于推广应用。
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