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公开(公告)号:CN108410997B
公开(公告)日:2021-06-22
申请号:CN201810188401.2
申请日:2018-03-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种公猪StAR基因5‑bp重复缺失多态性的检测方法及其应用。该方法以待测公猪全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增StAR基因片段,随后进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定StAR基因在NC_010457.5:g.5524‑5528位点存在5‑bp重复缺失多态性。StAR基因5‑bp重复缺失多态性不同基因型分别与15日龄和40日龄大白猪公猪的睾丸长轴长、睾丸短轴长和睾丸重等繁殖性状之间显著相关。本发明提供的检测公猪StAR基因插入/缺失的方法,可在公猪繁殖性状的标记辅助选择育种中应用,有利于快速建立繁殖性能优良的公猪遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112980935A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110352715.3
申请日:2021-03-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊PRNT基因单核苷酸多态性标记在性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊PRNT基因部分片段,通过测序鉴定该基因的g.149C>T突变位点在山羊群体中的多态性。根据关联分析结果,PRNT基因的这一单核苷酸多态性位点的基因型与山羊的胸围、胸宽极显著相关,可用于快速建立遗传资源优良的山羊群体,从而可以通过山羊性状的早期标记辅助选择加快育种进程。
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公开(公告)号:CN112941203A
公开(公告)日:2021-06-11
申请号:CN202110304073.X
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛ITGβ5基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增牛ITGβ5基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点的基因型。根据性状关联分析结果,ITGβ5基因13‑bpInDel多态性位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,ITGβ5基因13‑bp InDel多态性位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN112795667A
公开(公告)日:2021-05-14
申请号:CN202110302857.9
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种牛FRAS1基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增牛FRAS1基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体FRAS1基因15‑bp缺失突变位点的基因型。根据性状关联分析结果,FRAS1基因15‑bp缺失突变位点的基因型与母牛繁殖性状显著相关。因此,FRAS1基因15‑bp缺失突变位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN105779594B
公开(公告)日:2020-04-28
申请号:CN201610171698.2
申请日:2016-03-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种猪Oct4基因插入/缺失的检测方法及其应用。以待测公猪全基因组DNA为模板,以参照猪全基因组设计的引物对P1为引物,通过PCR技术扩增Oct4基因,再进行琼脂糖凝胶电泳。根据电泳结果鉴定Oct4基因在NC_010449:g.2759‑2760ins GGTTTTTGTCTA位点存在插入/缺失多态性。结果发现,Oct4基因12‑bp插入/缺失的不同类型与15日龄大白猪公猪睾丸重、睾丸长周长和睾丸短周长等繁殖性状之间存在显著相关,提示Oct4基因12‑bp插入/缺失的不同类型可作为提高公猪繁殖性状的DNA标记。本发明将有利于快速建立繁殖性状优良的公猪遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN107164482B
公开(公告)日:2020-02-18
申请号:CN201710414058.4
申请日:2017-06-05
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊CSN1S1基因插入/缺失的检测方法及其应用。该方法是以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增山羊CSN1S1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊CSN1S1基因存在indel位点多态性。大样本(N>1000)相关分析结果揭示,CSN1S1基因indel的不同类型与陕北白绒山羊第一胎产羔性状之间存在显著相关,提示CSN1S1基因indel的不同类型可作为提高山羊第一胎产羔性状的DNA标记。本发明提供的快速检测山羊CSN1S1基因indel的方法,可在中国山羊繁殖性状的标记辅助选择育种中应用,有利于快速建立高产羔数性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110607373A
公开(公告)日:2019-12-24
申请号:CN201910877427.2
申请日:2019-09-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊DNAH1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊DNAH1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊DNAH1基因NC_030829.1:g.48594103_48594129位27-bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,该山羊DNAH1基因的27-bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,存在提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊DNAH1基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110172516A
公开(公告)日:2019-08-27
申请号:CN201910218571.5
申请日:2019-03-21
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用,以中国地方黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区序列,再对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和DNA测序;根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区的2个单核苷酸变异;关联分析发现lncFAM200B基因5'侧翼区的这2个单核苷酸位点对生长性状具有重要调控,可作为分子标记。本发明提供的检测方法为建立lncFAM200B基因SNP与生长性状关系提供简单、快速的途径,检测结果可用于生长性状的标记辅助选择,加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN108441566A
公开(公告)日:2018-08-24
申请号:CN201810301992.X
申请日:2018-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊ATBF1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过PCR技术扩增山羊ATBF1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊ATBF1基因indel位点多态性。相关分析结果揭示,ATBF1基因的indel位点的不同基因型与陕北白绒山羊、关中奶山羊和海南黑山羊的体高、胸围存在显著相关,揭示ATBF1基因indel位点的基因型可作为提高山羊体高和胸围性状的DNA标记。本发明可应用在山羊标记辅助选择育种中,有利于快速建立优良体尺性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN106755474A
公开(公告)日:2017-05-31
申请号:CN201710036016.1
申请日:2017-01-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种公猪KDM5B基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。该方法以公猪全基因组DNA为模板,通过PCR扩增KDM5B基因,随后进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定KDM5B基因在NC_010452.3:g.52599_52633位点存在35‑bp插入/缺失多态性。KDM5B基因35‑bp插入/缺失多态性不同基因型与40日龄长白猪公猪睾丸短轴长、睾丸重等繁殖性状之间显著相关,KDM5B基因35‑bp插入/缺失多态性位点能够作为提高长白猪公猪繁殖性状的分子标记,故本发明有利于长白猪公猪繁殖性状的标记辅助选择(MAS),有利于快速建立遗传资源优良的公猪种群。
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