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公开(公告)号:CN112766428B
公开(公告)日:2021-07-02
申请号:CN202110374936.0
申请日:2021-04-08
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明提供了一种肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质,其中,方法包括:获取多个肿瘤组织样本的测序数据,并计算拷贝数数值;筛选各肿瘤组织样本中发生变异的基因;对发生变异的基因进行无监督聚类得到多个样本类别;筛选各样本类别样本间基因拷贝数变异显著的基因并无监督聚类得到多个基因类别;基于拷贝数变异计算第一主成分,并通过回归分析确定第一主成分对患者预后的影响;根据第一主成分对患者预后的影响计算各肿瘤组织样本的拷贝数变异分值,并根据该值对各样本类别的样本进行分类,完成对肿瘤的分子分型。其基于每个基因的拷贝数变异进行分子分型,分辨率高、分型精准,且可以显著区分不同分子分型肿瘤患者的预后。
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公开(公告)号:CN114622015A
公开(公告)日:2022-06-14
申请号:CN202110523169.5
申请日:2021-05-13
Applicant: 四川大学华西医院 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种检测769个基因突变的NGS panel在制备预测非小细胞肺癌术后复发的试剂盒中的用途以及一种预测非小细胞肺癌术后复发的试剂盒。通过可检测769个基因的NGS panel结合高通量测序对非小细胞肺癌患者血浆中的ctDNA进行检测,可以在围手术期准确有效地预测患者术后复发风险,具有重要的临床应用价值。
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公开(公告)号:CN114622015B
公开(公告)日:2023-05-05
申请号:CN202110523169.5
申请日:2021-05-13
Applicant: 四川大学华西医院 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种检测769个基因突变的NGS panel在制备预测非小细胞肺癌术后复发的试剂盒中的用途以及一种预测非小细胞肺癌术后复发的试剂盒。通过可检测769个基因的NGS panel结合高通量测序对非小细胞肺癌患者血浆中的ctDNA进行检测,可以在围手术期准确有效地预测患者术后复发风险,具有重要的临床应用价值。
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公开(公告)号:CN113096728B
公开(公告)日:2021-08-20
申请号:CN202110645857.9
申请日:2021-06-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻悦生物科技江苏有限公司 , 无锡臻和生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明公开了一种微小残余病灶的检测方法、装置、存储介质及设备,属于生物检测技术领域。本发明包括获取对患者的肿瘤组织和配对的白细胞的建库测序数据,并利用所述建库测序数据,构建患者的个性化肿瘤变异图谱;获取对患者微小残余病灶术后监测点的血浆游离DNA的建库测序数据,根据肿瘤变异图谱在血浆游离DNA的建库测序数据中提取相应的变异信号;根据噪音模型对提取到的变异信号进行单变异显著性分析,所述噪音模型为组合模型;对提取到的变异信号进行多变异联合置信度分析,根据获得的置信概率,判定微小残余病灶的状态。并配置了相应的装置、存储介质及设备。利用本发明,能够准确地检测微小残余病灶。
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公开(公告)号:CN113096728A
公开(公告)日:2021-07-09
申请号:CN202110645857.9
申请日:2021-06-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻悦生物科技江苏有限公司 , 无锡臻和生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明公开了一种微小残余病灶的检测方法、装置、存储介质及设备,属于生物检测技术领域。本发明包括获取对患者的肿瘤组织和配对的白细胞的建库测序数据,并利用所述建库测序数据,构建患者的个性化肿瘤变异图谱;获取对患者微小残余病灶术后监测点的血浆游离DNA的建库测序数据,根据肿瘤变异图谱在血浆游离DNA的建库测序数据中提取相应的变异信号;根据噪音模型对提取到的变异信号进行单变异显著性分析,所述噪音模型为组合模型;对提取到的变异信号进行多变异联合置信度分析,根据获得的置信概率,判定微小残余病灶的状态。并配置了相应的装置、存储介质及设备。利用本发明,能够准确地检测微小残余病灶。
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公开(公告)号:CN114863993B
公开(公告)日:2022-09-27
申请号:CN202210781536.6
申请日:2022-07-05
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及生物医药技术领域,具体涉及用于结肠癌预后预测的标志物、模型构建方法和系统。本发明提供用于结肠癌患者预后预测的TLS相关量化指标,以TLS相关量化指标作为标志物进行结肠癌的预后预测,能够更精准客观地反映患者的免疫状态,具有更高的预后预测准确性。本发明还提供结肠癌预后风险模型及其构建方法,该模型能够独立于TNM分期进行预后预测,且较TNM分期能够更好地对结肠癌患者进行预后风险分层,指导临床对不同预后的患者分别制定更有针对性的治疗方案,有利于实现精准医疗。
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公开(公告)号:CN114863993A
公开(公告)日:2022-08-05
申请号:CN202210781536.6
申请日:2022-07-05
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及生物医药技术领域,具体涉及用于结肠癌预后预测的标志物、模型构建方法和系统。本发明提供用于结肠癌患者预后预测的TLS相关量化指标,以TLS相关量化指标作为标志物进行结肠癌的预后预测,能够更精准客观地反映患者的免疫状态,具有更高的预后预测准确性。本发明还提供结肠癌预后风险模型及其构建方法,该模型能够独立于TNM分期进行预后预测,且较TNM分期能够更好地对结肠癌患者进行预后风险分层,指导临床对不同预后的患者分别制定更有针对性的治疗方案,有利于实现精准医疗。
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公开(公告)号:CN114023381A
公开(公告)日:2022-02-08
申请号:CN202111677030.2
申请日:2021-12-31
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种肺癌MRD融合基因判定方法、装置、存储介质及设备,属于医学检测技术领域。包括接收肿瘤组织、肿瘤血细胞和血浆的测序数据;根据所述肿瘤组织的测序数据,利用第一检测软件和第二检测软件进行融合基因分析,得到第一融合基因序列和第二融合基因序列;在肿瘤血细胞和血浆的测序数据中追踪所述第一融合基因序列和第二融合基因序列,得到第一融合基因;对所述第一融合基因通过过滤血细胞中的融合基因,判定最终的经典融合基因。所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够对肺癌MRD融合基因进行准确判定。
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公开(公告)号:CN117576085B
公开(公告)日:2024-05-07
申请号:CN202410037266.7
申请日:2024-01-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻悦生物科技江苏有限公司
Abstract: 本发明公开一种基于全局莫兰指数的结肠癌预后预测方法及系统,获取结肠癌组织样品切片的全切片数字图像,所述结肠癌组织样品切片经染色及荧光免疫标记处理;提取数字图像中核心肿瘤区域中所有细胞的坐标,以及每个细胞的荧光强度值,并预设阳性阈值,筛选出超过阳性阈值的荧光强度值;基于筛选出的荧光强度值及对应的坐标值计算核心肿瘤区域的莫兰指数;获取莫兰指数的最佳截断值,基于最佳截断值将样品划分至不同风险组。本发明的量化指标考虑了整个肿瘤区域内的T细胞分布情况,同时顾及T细胞表达量的影响,指标覆盖的信息更全面,为评估结肠癌患者的预后提供新的指标和方法。
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公开(公告)号:CN116913380B
公开(公告)日:2023-12-05
申请号:CN202311168288.9
申请日:2023-09-12
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 武汉臻和医学检验实验室有限公司
Abstract: 本发明提供了一种晚期肿瘤ctDNA动态变化判定方法及装置,属于医学检测技术领域。包括接收晚期肿瘤治前血浆和配对的血细胞的测序数据,构建肿瘤患者治疗前血浆个性化变异图谱;根据血浆变异图谱追踪治疗后血浆的变异信号;基于临床治疗前后突变位点的变异频率以及测序深度定量权重,评估治疗对位点变异频率变化的贡献度,降低测序和分析造成波动的影响,对晚期患者治疗前后血浆ctDNA的变化进行更准确的定量,评估患者对治疗方式是否响应。计算所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够更准确地对晚期肿瘤ctDNA动态变化进行判定,可有效提高对晚期肿瘤患者进行疗效评估的精准度。
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