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公开(公告)号:CN114622015A
公开(公告)日:2022-06-14
申请号:CN202110523169.5
申请日:2021-05-13
Applicant: 四川大学华西医院 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种检测769个基因突变的NGS panel在制备预测非小细胞肺癌术后复发的试剂盒中的用途以及一种预测非小细胞肺癌术后复发的试剂盒。通过可检测769个基因的NGS panel结合高通量测序对非小细胞肺癌患者血浆中的ctDNA进行检测,可以在围手术期准确有效地预测患者术后复发风险,具有重要的临床应用价值。
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公开(公告)号:CN114622015B
公开(公告)日:2023-05-05
申请号:CN202110523169.5
申请日:2021-05-13
Applicant: 四川大学华西医院 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种检测769个基因突变的NGS panel在制备预测非小细胞肺癌术后复发的试剂盒中的用途以及一种预测非小细胞肺癌术后复发的试剂盒。通过可检测769个基因的NGS panel结合高通量测序对非小细胞肺癌患者血浆中的ctDNA进行检测,可以在围手术期准确有效地预测患者术后复发风险,具有重要的临床应用价值。
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公开(公告)号:CN113257350A
公开(公告)日:2021-08-13
申请号:CN202110650420.4
申请日:2021-06-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于液体活检的ctDNA突变程度分析方法和装置、ctDNA性能分析装置,其中,突变程度分析方法包括:对待检测血浆样本进行捕获测序得到FASTQ文件;分别提取配对reads中的分子标签并存储为uBAM文件;将FASTQ文件的基因序列与参考基因组进行比对并去重,并将其与uBAM文件合并得到含有分子标签的BAM文件;对BAM文件中的reads进行聚集并去重;在基因突变panel区域得到样本原始突变集合,并对其中的基因突变参数进行统计;对样本原始突变集合进行过滤,对各样本的基因突变参数进行统计;针对样本的基因突变参数对待检测血浆样本的突变程度进行评估,提高ctDNA突变检测的灵敏度。
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公开(公告)号:CN113257350B
公开(公告)日:2021-10-08
申请号:CN202110650420.4
申请日:2021-06-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司 , 无锡臻和生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于液体活检的ctDNA突变程度分析方法和装置、ctDNA性能分析装置,其中,突变程度分析方法包括:对待检测血浆样本进行捕获测序得到FASTQ文件;分别提取配对reads中的分子标签并存储为uBAM文件;将FASTQ文件的基因序列与参考基因组进行比对并去重,并将其与uBAM文件合并得到含有分子标签的BAM文件;对BAM文件中的reads进行聚集并去重;在基因突变panel区域得到样本原始突变集合,并对其中的基因突变参数进行统计;对样本原始突变集合进行过滤,对各样本的基因突变参数进行统计;针对样本的基因突变参数对待检测血浆样本的突变程度进行评估,提高ctDNA突变检测的灵敏度。
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