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公开(公告)号:CN116312774A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310575289.9
申请日:2023-05-22
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种基于cfDNA的癌症预测模型及其构建方法和应用,属于医学检测技术领域。该模型构建方法是:利用收集的染色质开放区域内的序列上游末端覆盖度和序列下游末端覆盖度计算染色质开放区域内的方向特异cfDNA片段值(orientation‑aware cfDNA fragmentation value,OCF值),利用阳性样本和对照样本的OCF值进行机器学习训练和预测模型的构建。上述构建方法或者构建的预测模型可用于癌症预测,如制造癌症预测装置、设备和存储介质等,从而能对患者患有癌症的概率给出预测。本申请能够使用受试者血浆cfDNA全基因测序数据,而无需组织穿刺等侵入性检测方法,预测受试者患有癌症的概率。
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公开(公告)号:CN116087530B
公开(公告)日:2023-06-20
申请号:CN202310315892.3
申请日:2023-03-29
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种用于检测胰腺癌的蛋白组合物、装置、设备和存储介质,属于医学检测技术领域。该蛋白组合物包括蛋白CA125、CA19‑9、CA50、CEA、NSE和free‑β‑hCG,基于上述蛋白表达水平的胰腺癌风险评估模型可以用于计算患有胰腺癌的概率,该蛋白组合物的表达水平结合本申请提供的胰腺癌风险评估模型,可以有效检测胰腺癌,其AUC值高于使用任意一个单一蛋白标志物以及临床血清标志物CA19‑9和NSE的检测结果。
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公开(公告)号:CN114708905A
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN202210506571.7
申请日:2022-05-11
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于NGS的染色体非整倍体检测方法、装置、介质和设备,涉及生物医学技术领域。包括接收肿瘤组织和正常组织的NGS测序数据;对所述NGS测序数据进行预处理,获得中间数据文件;利用所述中间数据文件,对性别和胚系SNP进行一致性评估;利用所述中间数据文件获取待测样本基因组上覆盖深度信息及SNP基因型信息;检测肿瘤样本纯度、倍性和SCNV片段;根据单个肿瘤样本和准备好的泛癌队列SCNV数据库,计算每个肿瘤样本染色体臂水平的SCNV;基于样本染色体臂水平的SCNV,计算每个肿瘤样本最终的染色体非整倍体得分。所述装置、介质和设备均基于所述的方法。本发明提高了肿瘤染色体非整倍体检测的准确性。
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公开(公告)号:CN113096728B
公开(公告)日:2021-08-20
申请号:CN202110645857.9
申请日:2021-06-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻悦生物科技江苏有限公司 , 无锡臻和生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明公开了一种微小残余病灶的检测方法、装置、存储介质及设备,属于生物检测技术领域。本发明包括获取对患者的肿瘤组织和配对的白细胞的建库测序数据,并利用所述建库测序数据,构建患者的个性化肿瘤变异图谱;获取对患者微小残余病灶术后监测点的血浆游离DNA的建库测序数据,根据肿瘤变异图谱在血浆游离DNA的建库测序数据中提取相应的变异信号;根据噪音模型对提取到的变异信号进行单变异显著性分析,所述噪音模型为组合模型;对提取到的变异信号进行多变异联合置信度分析,根据获得的置信概率,判定微小残余病灶的状态。并配置了相应的装置、存储介质及设备。利用本发明,能够准确地检测微小残余病灶。
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公开(公告)号:CN113096728A
公开(公告)日:2021-07-09
申请号:CN202110645857.9
申请日:2021-06-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻悦生物科技江苏有限公司 , 无锡臻和生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明公开了一种微小残余病灶的检测方法、装置、存储介质及设备,属于生物检测技术领域。本发明包括获取对患者的肿瘤组织和配对的白细胞的建库测序数据,并利用所述建库测序数据,构建患者的个性化肿瘤变异图谱;获取对患者微小残余病灶术后监测点的血浆游离DNA的建库测序数据,根据肿瘤变异图谱在血浆游离DNA的建库测序数据中提取相应的变异信号;根据噪音模型对提取到的变异信号进行单变异显著性分析,所述噪音模型为组合模型;对提取到的变异信号进行多变异联合置信度分析,根据获得的置信概率,判定微小残余病灶的状态。并配置了相应的装置、存储介质及设备。利用本发明,能够准确地检测微小残余病灶。
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公开(公告)号:CN116087530A
公开(公告)日:2023-05-09
申请号:CN202310315892.3
申请日:2023-03-29
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本申请公开了一种用于检测胰腺癌的蛋白组合物、装置、设备和存储介质,属于医学检测技术领域。该蛋白组合物包括蛋白CA125、CA19‑9、CA50、CEA、NSE和free‑β‑hCG,基于上述蛋白表达水平的胰腺癌风险评估模型可以用于计算患有胰腺癌的概率,该蛋白组合物的表达水平结合本申请提供的胰腺癌风险评估模型,可以有效检测胰腺癌,其AUC值高于使用任意一个单一蛋白标志物以及临床血清标志物CA19‑9和NSE的检测结果。
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公开(公告)号:CN114863993B
公开(公告)日:2022-09-27
申请号:CN202210781536.6
申请日:2022-07-05
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及生物医药技术领域,具体涉及用于结肠癌预后预测的标志物、模型构建方法和系统。本发明提供用于结肠癌患者预后预测的TLS相关量化指标,以TLS相关量化指标作为标志物进行结肠癌的预后预测,能够更精准客观地反映患者的免疫状态,具有更高的预后预测准确性。本发明还提供结肠癌预后风险模型及其构建方法,该模型能够独立于TNM分期进行预后预测,且较TNM分期能够更好地对结肠癌患者进行预后风险分层,指导临床对不同预后的患者分别制定更有针对性的治疗方案,有利于实现精准医疗。
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公开(公告)号:CN114863993A
公开(公告)日:2022-08-05
申请号:CN202210781536.6
申请日:2022-07-05
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 无锡臻和生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及生物医药技术领域,具体涉及用于结肠癌预后预测的标志物、模型构建方法和系统。本发明提供用于结肠癌患者预后预测的TLS相关量化指标,以TLS相关量化指标作为标志物进行结肠癌的预后预测,能够更精准客观地反映患者的免疫状态,具有更高的预后预测准确性。本发明还提供结肠癌预后风险模型及其构建方法,该模型能够独立于TNM分期进行预后预测,且较TNM分期能够更好地对结肠癌患者进行预后风险分层,指导临床对不同预后的患者分别制定更有针对性的治疗方案,有利于实现精准医疗。
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公开(公告)号:CN114023381A
公开(公告)日:2022-02-08
申请号:CN202111677030.2
申请日:2021-12-31
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种肺癌MRD融合基因判定方法、装置、存储介质及设备,属于医学检测技术领域。包括接收肿瘤组织、肿瘤血细胞和血浆的测序数据;根据所述肿瘤组织的测序数据,利用第一检测软件和第二检测软件进行融合基因分析,得到第一融合基因序列和第二融合基因序列;在肿瘤血细胞和血浆的测序数据中追踪所述第一融合基因序列和第二融合基因序列,得到第一融合基因;对所述第一融合基因通过过滤血细胞中的融合基因,判定最终的经典融合基因。所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够对肺癌MRD融合基因进行准确判定。
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公开(公告)号:CN117576085B
公开(公告)日:2024-05-07
申请号:CN202410037266.7
申请日:2024-01-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻悦生物科技江苏有限公司
Abstract: 本发明公开一种基于全局莫兰指数的结肠癌预后预测方法及系统,获取结肠癌组织样品切片的全切片数字图像,所述结肠癌组织样品切片经染色及荧光免疫标记处理;提取数字图像中核心肿瘤区域中所有细胞的坐标,以及每个细胞的荧光强度值,并预设阳性阈值,筛选出超过阳性阈值的荧光强度值;基于筛选出的荧光强度值及对应的坐标值计算核心肿瘤区域的莫兰指数;获取莫兰指数的最佳截断值,基于最佳截断值将样品划分至不同风险组。本发明的量化指标考虑了整个肿瘤区域内的T细胞分布情况,同时顾及T细胞表达量的影响,指标覆盖的信息更全面,为评估结肠癌患者的预后提供新的指标和方法。
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