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公开(公告)号:CN103539697B
公开(公告)日:2014-12-24
申请号:CN201310462509.3
申请日:2013-09-30
IPC: C07C245/08 , C07H19/10 , C07H1/00 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种还原敏感偶氮连接单元的合成及其在DNA测序中的用途;该还原敏感偶氮连接单元结构式如下:其中m为0~44中任一整数,n为0~44中任一整数。该还原敏感偶氮连接单元与核苷酸及荧光素连接得到可逆终端,所述可逆终端用于DNA合成测序。与现有技术相比,本发明合成了一类新的可裂解连接单元,并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端;该类可逆终端在温和的条件下可以实现高效率的裂解,可用于DNA合成测序;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN104003902A
公开(公告)日:2014-08-27
申请号:CN201410203327.9
申请日:2014-05-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C247/10 , C07H19/10 , C07H1/00 , C09K11/06 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种三氮烯连接单元的合成及其在DNA测序中的用途;该三氮烯连接单元结构式如下:,其中-CH2OH和-CH2N3分别连接于三氮烯结构的邻位、对位或间位。该酸敏感的三氮烯连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的可逆终端可用于DNA合成测序。与现有技术相比,本发明合成了一类新的酸敏感连接单元,并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端;该类可逆终端可用于DNA合成测序;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN103819523A
公开(公告)日:2014-05-28
申请号:CN201410030095.1
申请日:2014-01-22
IPC: C07H19/167 , C07H1/00 , C07H19/173 , C07H19/20
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷的合成方法;所述方法包括如下步骤:式(III)化合物在碱性条件下去保护基得式(IV1)或(IV2)化合物;进一步去甲基得式(I)化合物,即所述7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷;其中,R1为H或OH,R2为I、Br或Cl,R3为H或本发明合成的7-去氮-7-卤素-鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料,目前其销售价格很高,且合成方法复杂,难以控制;而本发明的合成方法所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN103804447A
公开(公告)日:2014-05-21
申请号:CN201410055242.0
申请日:2014-02-18
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/167 , C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00 , C07H1/04 , C09K11/06 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种氮杂化鸟嘌呤核苷及其合成方法和在DNA测序中的用途;所述合成方法包括如下步骤:式(Ⅲ)化合物在碱性条件下去保护基得式(Ⅱ)化合物;进一步去甲基得式(Ⅰ)化合物,即7-去氮-7-卤素-8-氮-鸟嘌呤核苷;其中,R1为H或OH,R2为I、Br或Cl,R3为H或本发明的氮杂化鸟嘌呤核苷是用于DNA测序的新型试剂,与8位未取代氮的鸟嘌呤核苷相比,具有更好的碱基识别效果、更稳定的DNA链结构。同时,现有技术中8位氮取代鸟嘌呤核苷的合成方法复杂,产率低,尚未商业化生产,而本发明的合成方法所需原料简单易得,采用常规化学合成反应,且收率较高,适用于广泛推广使用。
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公开(公告)号:CN103601779A
公开(公告)日:2014-02-26
申请号:CN201310489397.0
申请日:2013-10-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/173 , C07H19/20 , C07H1/00
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了一种7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷的合成方法;所述方法包括将下式(V)化合物在碱性条件下去甲基得到下式(I)化合物,即所述7-去氮-2’-脱氧-7-卤素取代鸟嘌呤核苷;(I),(V),其中R2为I、Br或Cl。本发明合成的7-去氮-7-碘-2’-脱氧鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料,目前其销售价格很高,且合成方法复杂;而本发明提供的合成方法所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN103588838A
公开(公告)日:2014-02-19
申请号:CN201310533070.9
申请日:2013-10-30
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/10 , C07H1/00 , C07H19/14 , C07H19/044 , C07C217/10 , C07C213/02 , C07C217/08 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种碱基修饰核苷酸的合成方法及其用途;所述方法包括将各种修饰核苷在磷酸化试剂的作用下,选择性地生成5′-核苷三磷酸;这些磷酸化试剂包括反应过程中原位生成的环状磷酸化试剂以及三氯氧磷和三丁基焦磷酸铵协同作用下的反应产物。本发明合成的碱基修饰核苷酸在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用,目前其销售价格很高,合成方法复杂,反应选择性差,副反应多,不好分离纯化;而本发明提供的合成方法选择性好,副反应少,容易分离纯化,且所需实验条件易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN103396556A
公开(公告)日:2013-11-20
申请号:CN201310317966.3
申请日:2013-07-25
Applicant: 上海交通大学 , 上海其胜生物制剂有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于壳聚糖的两亲性嵌段共聚物及其合成方法。所述共聚物的结构式如式(I)所示:其中,m、n为满足0≤m+n≤32且n/(m+n+1)≤15%的任一整数。本发明在壳聚糖、PLA、PCL、月桂酸及硬脂酸上分别引入具有氢键序列特异性作用的分子胶,合成了一系列基于壳聚糖的嵌段共聚物,产物经1H-NMR、GPC等表征。该类化合物合成原料简单易得,合成过程均为常规反应,各步反应技术均已成熟;本发明制备的两亲性嵌段共聚物含有双重二硫键,具有还原敏感性,可用于制备还原敏感性的自组装药物运输胶束。
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公开(公告)号:CN102675262A
公开(公告)日:2012-09-19
申请号:CN201210132695.X
申请日:2012-04-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07D307/20 , C08G65/48 , C12Q1/68
CPC classification number: Y02P20/55
Abstract: 本发明公开了四氢呋喃醚衍生物可裂解连接单元及其用途;本发明的可裂解连接单元,结构式如下式所示:,其中,n为0~44中的任意一个整数。本发明的四氢呋喃环衍生物中,无论是顺式、反式或二者的混合物都可用于测序,并具有相同的作用;该类化合物合成原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,易于实现大量合成;该类化合物可与核苷酸和荧光素实现高效率的连接;通过研究该类化合物的裂解性能,发现该类化合物在温和的条件下可以实现高效率的裂解,具有应用于DNA测序的价值。
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公开(公告)号:CN112390839A
公开(公告)日:2021-02-23
申请号:CN202011286386.9
申请日:2020-11-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/073 , C07H1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂及DNA单分子测序系统及测序方法,所述三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂包括以下基于三氮烯连接单元的不同荧光素标记四种不同碱基的可逆终止核苷酸:本发明在包含所述三氮烯四色荧光可逆终止核苷酸测序试剂的DNA单分子集成测序系统中,通过前一次DNA链延伸产物的荧光信号图像作为下一次延伸产物的定位荧光,无需额外的定位荧光,并且三氮烯荧光标记核苷酸在断裂反应后,在DNA链上无残基保留,理论上读长无限制。
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公开(公告)号:CN106083676B
公开(公告)日:2019-01-11
申请号:CN201610402708.9
申请日:2016-06-07
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C323/52 , C07C323/25 , C07H19/10 , C07H19/14 , C07H1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开一种硫代缩酮连接单元及其合成方法、用途;所述硫代缩酮连接单元的结构如式(Ⅰ)所示:其中,R=‑OH或者‑COOH;R1与R2的满足如下条件中的一种:(1)R1=R2=甲基;或,(2)R1=苯基、对甲氧基苯基、2,4,6‑三甲氧基苯基、萘基或对甲氧基萘基,R2=H;或,(3)R1、R2共同构成环己基或环戊基。该单元与核苷酸及荧光素连接得到的荧光素标记核苷酸可用于DNA测序。与现有技术相比,本发明连接单元的可逆终止剂用于DNA测序时,其延伸效率接近100%,并且在模板为连续多个相同碱基时,一次只延伸一个可逆终止剂;其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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